More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1266 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1266  GTP-binding protein, HSR1-related  100 
 
 
689 aa  1384    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1404  GTP-binding protein, HSR1-related  38.85 
 
 
716 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000264351  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1209  small GTP-binding protein  42.79 
 
 
609 aa  444  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0549532  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0761  GTP-binding protein HSR1-related  38.24 
 
 
720 aa  438  1e-121  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0972395  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1043  ferrous iron transport protein B  38.96 
 
 
725 aa  434  1e-120  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00262992 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1009  ferrous iron transport protein B  35.28 
 
 
707 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0206507  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1140  ferrous iron transport protein B  33.33 
 
 
680 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000225033  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0779  ferrous iron transport protein B  34.19 
 
 
688 aa  390  1e-107  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328587  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0095  ferrous iron transport protein B  33.43 
 
 
676 aa  379  1e-104  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0434  ferrous iron transport protein B  31.49 
 
 
665 aa  375  1e-102  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1951  ferrous iron transport protein B  35.09 
 
 
680 aa  376  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0016959  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2325  ferrous iron transport protein B  34.71 
 
 
666 aa  371  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.907395  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  32.37 
 
 
669 aa  365  1e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3765  ferrous iron transport protein B  32.61 
 
 
743 aa  363  7.0000000000000005e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0970  ferrous iron transport protein B  36.02 
 
 
666 aa  358  1.9999999999999998e-97  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0839864 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  32.22 
 
 
669 aa  358  1.9999999999999998e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3658  ferrous iron transport protein B  31.64 
 
 
741 aa  356  8.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1452  ferrous iron transport protein B  33.04 
 
 
665 aa  356  1e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.789379  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3268  ferrous iron transport protein B  32.23 
 
 
747 aa  352  1e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.309598  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0873  ferrous iron transport protein B  32.06 
 
 
667 aa  351  2e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101727  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0110  ferrous iron transport protein B  35.53 
 
 
668 aa  350  4e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0260348  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0895  ferrous iron transport protein B  32.06 
 
 
669 aa  350  4e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00236216  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3293  ferrous iron transport protein B  33.96 
 
 
741 aa  348  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.608312  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1569  ferrous iron transport protein B  33.53 
 
 
659 aa  348  2e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000694144  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1785  ferrous iron transport protein B  32.12 
 
 
713 aa  343  4e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.84236  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3412  ferrous iron transport protein B  33.47 
 
 
740 aa  343  7e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3368  ferrous iron transport protein B  33.33 
 
 
740 aa  342  1e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  32.42 
 
 
662 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0307  ferrous iron transport protein B  31.69 
 
 
662 aa  340  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4105  ferrous iron transport protein B  33.64 
 
 
738 aa  339  8e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281443  normal  0.296674 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  31.84 
 
 
662 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4932  ferrous iron transport protein B  31.69 
 
 
662 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  31.84 
 
 
662 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  31.84 
 
 
662 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  31.84 
 
 
662 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4947  ferrous iron transport protein B  31.98 
 
 
662 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4642  ferrous iron transport protein B  31.84 
 
 
662 aa  337  5e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0618  ferrous iron transport protein B  31.87 
 
 
721 aa  337  5e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0536695  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0623  ferrous iron transport protein B  31.5 
 
 
783 aa  336  7e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.626283  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  31.69 
 
 
662 aa  335  2e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3459  ferrous iron transport protein B  31.49 
 
 
715 aa  333  4e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000760098  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3474  ferrous iron transport protein B  30.97 
 
 
662 aa  333  5e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0856  hypothetical protein  33.43 
 
 
649 aa  332  2e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.935712  normal  0.465758 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1194  ferrous iron transport protein B  31.29 
 
 
714 aa  331  3e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0793  ferrous iron transport protein B  30.77 
 
 
728 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.585929  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0543  ferrous iron transport protein B  32.01 
 
 
669 aa  325  2e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00422143  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  33.82 
 
 
676 aa  324  3e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2074  ferrous iron transport protein B  31.4 
 
 
712 aa  324  4e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0107  ferrous iron transport protein B  34.49 
 
 
778 aa  323  9.000000000000001e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.803376  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3524  ferrous iron transport protein B  29.07 
 
 
697 aa  323  9.000000000000001e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000134401  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2843  ferrous iron transport protein B  31.22 
 
 
712 aa  322  9.999999999999999e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2658  ferrous iron transport protein B  33.67 
 
 
664 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0344  ferrous iron transport protein B  29.62 
 
 
724 aa  319  1e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00337716  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2567  ferrous iron transport protein B  32.36 
 
 
753 aa  319  1e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1739  ferrous iron transport protein B  29.17 
 
 
646 aa  319  1e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00069018  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0108  ferrous iron transport protein B  29.93 
 
 
712 aa  318  2e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2071  ferrous iron transport protein B  33.6 
 
 
774 aa  318  2e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0654  Fe2+ transport system protein B  32.79 
 
 
712 aa  318  3e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1933  ferrous iron transport protein B  31.93 
 
 
774 aa  315  9.999999999999999e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.651093  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2434  ferrous iron transport protein B  31.62 
 
 
711 aa  315  9.999999999999999e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0984425  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2626  ferrous iron transport protein B  30.04 
 
 
664 aa  315  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.51649  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1458  ferrous iron transport protein B  30.06 
 
 
716 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.137578  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2572  ferrous iron transport protein B  30.04 
 
 
664 aa  315  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1508  ferrous iron transport protein B  31.99 
 
 
665 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.225021  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1343  ferrous iron transport protein B  30.6 
 
 
662 aa  315  2.9999999999999996e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.547756  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2470  ferrous iron transport protein B  36.63 
 
 
786 aa  313  9e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2126  ferrous iron transport protein B  29.31 
 
 
664 aa  312  2e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0193  Fe2+ transport system protein B  29.82 
 
 
691 aa  310  5e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1653  ferrous iron transport protein B  30.88 
 
 
647 aa  310  6.999999999999999e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.888316 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0754  ferrous iron transport protein B  33.44 
 
 
786 aa  309  1.0000000000000001e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0018483  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1622  ferrous iron transport protein B  31.67 
 
 
722 aa  309  1.0000000000000001e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.782227  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0286  Fe2+ transport system protein B  31.12 
 
 
704 aa  308  2.0000000000000002e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0260  ferrous iron transport protein B  30.22 
 
 
647 aa  306  8.000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2464  ferrous iron transport protein B  29.71 
 
 
712 aa  306  1.0000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.967572  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0901  ferrous iron transport protein B  28.75 
 
 
708 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000608812  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0012  ferrous iron transport protein B  31.46 
 
 
717 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00299021  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0975  ferrous iron transport protein B  29.63 
 
 
647 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3855  hypothetical protein  34.31 
 
 
776 aa  305  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107886  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0239  ferrous iron transport protein B  31.42 
 
 
816 aa  304  4.0000000000000003e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0882  ferrous iron transport protein B  29.7 
 
 
720 aa  303  5.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000109469  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1929  ferrous iron transport protein B  29.32 
 
 
712 aa  303  5.000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000762105  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0675  ferrous iron transport protein B  31.56 
 
 
732 aa  303  6.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.183925  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1959  ferrous iron transport protein B  31.12 
 
 
816 aa  302  2e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1569  ferrous iron transport protein B  29.93 
 
 
646 aa  298  3e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0259  ferrous iron transport protein B  29.53 
 
 
628 aa  298  3e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00038951  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0188  ferrous iron transport protein B  30.62 
 
 
657 aa  297  4e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000355145  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0465  ferrous iron transport protein B  35.43 
 
 
770 aa  296  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0292  ferrous iron transport protein B  29.96 
 
 
784 aa  295  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000454012  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1668  ferrous iron transport protein B  31.94 
 
 
662 aa  294  3e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1818  Fe2+ transport system protein B  35.74 
 
 
770 aa  294  4e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.375819  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2325  ferrous iron transport protein B  31.66 
 
 
848 aa  294  4e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56680  ferrous iron transport protein B  31.95 
 
 
766 aa  293  6e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0316  ferrous iron transport protein B  29.69 
 
 
725 aa  291  3e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000873753  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0976  ferrous iron transport protein B  31.86 
 
 
676 aa  291  3e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00114707  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02700  Ferrous iron transport protein FeoB  37.74 
 
 
469 aa  290  6e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2213  ferrous iron transport protein B  30.17 
 
 
713 aa  290  7e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  29.85 
 
 
631 aa  289  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20050  ferrous iron transporter FeoB  29.41 
 
 
749 aa  288  2e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.558981  normal  0.661098 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1729  ferrous iron transport protein B  28.45 
 
 
717 aa  288  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0580785 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16120  ferrous iron transporter FeoB  31.44 
 
 
785 aa  287  4e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000453744 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>