More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1009 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1009  ferrous iron transport protein B  100 
 
 		 707 aa  1422    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0206507  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1404  GTP-binding protein, HSR1-related  56.28 
 
 		 716 aa  794    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000264351  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0761  GTP-binding protein HSR1-related  47.15 
 
 		 720 aa  630  1e-179  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0972395  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1043  ferrous iron transport protein B  47.37 
 
 		 725 aa  618  1e-175  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00262992 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2720  ferrous iron transport B domain-containing protein  55.14 
 
 		 463 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.241159  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02700  Ferrous iron transport protein FeoB  54.61 
 
 		 469 aa  498  1e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3771  Ferrous iron transport B domain protein  52.62 
 
 		 465 aa  497  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3839  Ferrous iron transport B domain protein  54.75 
 
 		 462 aa  498  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1973  Ferrous iron transport B domain protein  49.24 
 
 		 464 aa  478  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.279314  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1405  nucleoside recognition  53.9 
 
 		 463 aa  474  1e-132  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1539  nucleoside recognition proteinn  54.63 
 
 		 464 aa  473  1e-132  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2274  Ferrous iron transport B domain protein  47.93 
 
 		 464 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4590  ferrous iron transport protein B  51.46 
 
 		 466 aa  443  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0628  ferrous iron transport B domain-containing protein  51.13 
 
 		 466 aa  442  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0678  ferrous iron transport protein B  50.9 
 
 		 466 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0877109  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0622  ferrous iron transport protein B, C-terminal region  50.9 
 
 		 466 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000193657  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0622  ferrous iron transport protein B, C-terminal region  50.9 
 
 		 466 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00607756  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4510  ferrous iron transport B domain-containing protein  48.38 
 
 		 464 aa  442  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.448654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0767  ferrous iron transport protein B  50.9 
 
 		 466 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000322668 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1266  GTP-binding protein, HSR1-related  36.04 
 
 		 689 aa  436  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0600  ferrous iron transport B domain-containing protein  48.46 
 
 		 466 aa  430  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1140  ferrous iron transport protein B  31.15 
 
 		 680 aa  340  4e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000225033  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1951  ferrous iron transport protein B  29.13 
 
 		 680 aa  333  9e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0016959  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  32.14 
 
 		 669 aa  330  6e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0095  ferrous iron transport protein B  31.08 
 
 		 676 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0779  ferrous iron transport protein B  32.9 
 
 		 688 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328587  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  31.99 
 
 		 669 aa  327  5e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2325  ferrous iron transport protein B  31.79 
 
 		 666 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.907395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1452  ferrous iron transport protein B  31.09 
 
 		 665 aa  311  2e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.789379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0970  ferrous iron transport protein B  30.23 
 
 		 666 aa  308  2.0000000000000002e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0839864 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0543  ferrous iron transport protein B  33.19 
 
 		 669 aa  306  6e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00422143  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3459  ferrous iron transport protein B  31.86 
 
 		 715 aa  304  4.0000000000000003e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000760098  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2658  ferrous iron transport protein B  30.68 
 
 		 664 aa  298  3e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0975  ferrous iron transport protein B  30.98 
 
 		 647 aa  298  3e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0434  ferrous iron transport protein B  29.72 
 
 		 665 aa  298  3e-79  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  29.6 
 
 		 676 aa  295  1e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2626  ferrous iron transport protein B  30.73 
 
 		 664 aa  295  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.51649  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2572  ferrous iron transport protein B  30.73 
 
 		 664 aa  295  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0260  ferrous iron transport protein B  31.65 
 
 		 647 aa  295  2e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1508  ferrous iron transport protein B  30.33 
 
 		 665 aa  293  6e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.225021  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1343  ferrous iron transport protein B  29.97 
 
 		 662 aa  293  6e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.547756  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1653  ferrous iron transport protein B  30.98 
 
 		 647 aa  293  7e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.888316 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1739  ferrous iron transport protein B  31.4 
 
 		 646 aa  292  1e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00069018  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0873  ferrous iron transport protein B  31.95 
 
 		 667 aa  291  2e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101727  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0895  ferrous iron transport protein B  32.1 
 
 		 669 aa  291  3e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00236216  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  30.27 
 
 		 662 aa  291  4e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  30.32 
 
 		 662 aa  290  7e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  30.42 
 
 		 662 aa  290  9e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  30.42 
 
 		 662 aa  290  9e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0307  ferrous iron transport protein B  29.74 
 
 		 662 aa  288  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2126  ferrous iron transport protein B  31 
 
 		 664 aa  287  4e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4932  ferrous iron transport protein B  29.74 
 
 		 662 aa  287  5e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  30.03 
 
 		 662 aa  287  5e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1713  ferrous iron transport protein B  28.61 
 
 		 645 aa  286  7e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.340113  normal  0.969498 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0618  ferrous iron transport protein B  29.87 
 
 		 721 aa  286  7e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0536695  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0735  ferrous iron transport protein B  33.43 
 
 		 648 aa  286  9e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.56734  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4642  ferrous iron transport protein B  29.45 
 
 		 662 aa  286  9e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4947  ferrous iron transport protein B  29.74 
 
 		 662 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1569  ferrous iron transport protein B  30.45 
 
 		 646 aa  285  3.0000000000000004e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0198  ferrous iron transport protein B  29.39 
 
 		 645 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0623  ferrous iron transport protein B  31.11 
 
 		 783 aa  284  5.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.626283  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  29.74 
 
 		 662 aa  283  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0793  ferrous iron transport protein B  28.13 
 
 		 728 aa  282  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.585929  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1569  ferrous iron transport protein B  32.21 
 
 		 659 aa  282  2e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000694144  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1194  ferrous iron transport protein B  30.08 
 
 		 714 aa  280  6e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  30.09 
 
 		 631 aa  280  9e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1458  ferrous iron transport protein B  29.51 
 
 		 716 aa  279  1e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.137578  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0856  hypothetical protein  29.01 
 
 		 649 aa  279  1e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.935712  normal  0.465758 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3268  ferrous iron transport protein B  28.09 
 
 		 747 aa  278  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.309598  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3474  ferrous iron transport protein B  28.43 
 
 		 662 aa  278  4e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1785  ferrous iron transport protein B  28.08 
 
 		 713 aa  278  4e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.84236  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2843  ferrous iron transport protein B  28.94 
 
 		 712 aa  277  6e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  30.45 
 
 		 631 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1088  ferrous iron transport protein B  27.97 
 
 		 753 aa  275  2.0000000000000002e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000362942  hitchhiker  0.0000000000000163165 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0754  ferrous iron transport protein B  29.03 
 
 		 786 aa  275  3e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0018483  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0193  Fe2+ transport system protein B  29.05 
 
 		 691 aa  274  5.000000000000001e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2464  ferrous iron transport protein B  28.47 
 
 		 712 aa  273  6e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.967572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0108  ferrous iron transport protein B  28.59 
 
 		 712 aa  273  6e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0259  ferrous iron transport protein B  30.1 
 
 		 628 aa  273  8.000000000000001e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00038951  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0976  ferrous iron transport protein B  32.95 
 
 		 676 aa  273  8.000000000000001e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00114707  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2434  ferrous iron transport protein B  28.34 
 
 		 711 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0984425  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0316  ferrous iron transport protein B  32.14 
 
 		 725 aa  271  4e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000873753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3765  ferrous iron transport protein B  27.67 
 
 		 743 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2074  ferrous iron transport protein B  27.57 
 
 		 712 aa  270  7e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0654  Fe2+ transport system protein B  29.61 
 
 		 712 aa  269  1e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0966  ferrous iron transport protein B  30.89 
 
 		 669 aa  268  2e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0344  ferrous iron transport protein B  31.19 
 
 		 724 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00337716  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2213  ferrous iron transport protein B  28.8 
 
 		 713 aa  268  2.9999999999999995e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0110  ferrous iron transport protein B  27.43 
 
 		 668 aa  267  5e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0260348  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2669  ferrous iron transport protein B  26.93 
 
 		 725 aa  266  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0675  ferrous iron transport protein B  26.52 
 
 		 732 aa  266  1e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.183925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3658  ferrous iron transport protein B  26.52 
 
 		 741 aa  264  4e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0890  ferrous iron transport protein B  27.05 
 
 		 684 aa  264  4e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2470  ferrous iron transport protein B  30.15 
 
 		 786 aa  261  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20050  ferrous iron transporter FeoB  28.97 
 
 		 749 aa  262  2e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.558981  normal  0.661098 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4105  ferrous iron transport protein B  27.52 
 
 		 738 aa  261  3e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281443  normal  0.296674 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0169  ferrous iron transport protein B  32.2 
 
 		 778 aa  261  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2524  ferrous iron transport protein B  27.06 
 
 		 766 aa  261  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2152  ferrous iron transport protein B  27.06 
 
 		 782 aa  261  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.264076  hitchhiker  0.0000442692 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1585  ferrous iron transport protein B  26.68 
 
 		 723 aa  261  4e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0104102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>