299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1539 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1539  nucleoside recognition proteinn  100 
 
 
464 aa  916    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3839  Ferrous iron transport B domain protein  60.35 
 
 
462 aa  557  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02700  Ferrous iron transport protein FeoB  60.36 
 
 
469 aa  556  1e-157  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1404  GTP-binding protein, HSR1-related  61.1 
 
 
716 aa  550  1e-155  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000264351  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2720  ferrous iron transport B domain-containing protein  58.41 
 
 
463 aa  542  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.241159  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1405  nucleoside recognition  61.1 
 
 
463 aa  518  1e-146  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3771  Ferrous iron transport B domain protein  56.77 
 
 
465 aa  512  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1973  Ferrous iron transport B domain protein  53.73 
 
 
464 aa  511  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.279314  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2274  Ferrous iron transport B domain protein  53.17 
 
 
464 aa  497  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1009  ferrous iron transport protein B  54.63 
 
 
707 aa  482  1e-135  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0206507  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0600  ferrous iron transport B domain-containing protein  53.81 
 
 
466 aa  464  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0678  ferrous iron transport protein B  52.98 
 
 
466 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0877109  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0622  ferrous iron transport protein B, C-terminal region  52.98 
 
 
466 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000193657  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0622  ferrous iron transport protein B, C-terminal region  52.98 
 
 
466 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00607756  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0767  ferrous iron transport protein B  52.98 
 
 
466 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000322668 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4590  ferrous iron transport protein B  52.52 
 
 
466 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0628  ferrous iron transport B domain-containing protein  52.52 
 
 
466 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4510  ferrous iron transport B domain-containing protein  52.07 
 
 
464 aa  459  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.448654  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0761  GTP-binding protein HSR1-related  51.59 
 
 
720 aa  449  1e-125  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0972395  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1043  ferrous iron transport protein B  51.33 
 
 
725 aa  437  1e-121  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00262992 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1266  GTP-binding protein, HSR1-related  39.67 
 
 
689 aa  291  1e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1209  small GTP-binding protein  38.21 
 
 
609 aa  230  4e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0549532  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2325  ferrous iron transport protein B  32.26 
 
 
666 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.907395  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  28.6 
 
 
669 aa  171  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  29.06 
 
 
662 aa  170  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4642  ferrous iron transport protein B  29.06 
 
 
662 aa  170  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4932  ferrous iron transport protein B  29.29 
 
 
662 aa  170  6e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  28.96 
 
 
669 aa  169  8e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  29.29 
 
 
662 aa  169  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  29.29 
 
 
662 aa  169  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4947  ferrous iron transport protein B  28.83 
 
 
662 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  29.06 
 
 
662 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  29.06 
 
 
662 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0307  ferrous iron transport protein B  28.8 
 
 
662 aa  168  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  28.83 
 
 
662 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1951  ferrous iron transport protein B  29.83 
 
 
680 aa  166  5.9999999999999996e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0016959  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2658  ferrous iron transport protein B  30.15 
 
 
664 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1140  ferrous iron transport protein B  27.64 
 
 
680 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000225033  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0856  hypothetical protein  31.95 
 
 
649 aa  162  1e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.935712  normal  0.465758 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3459  ferrous iron transport protein B  28.48 
 
 
715 aa  161  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000760098  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1508  ferrous iron transport protein B  29.88 
 
 
665 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.225021  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3474  ferrous iron transport protein B  27.69 
 
 
662 aa  159  9e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2126  ferrous iron transport protein B  29.44 
 
 
664 aa  159  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2572  ferrous iron transport protein B  28.77 
 
 
664 aa  159  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2626  ferrous iron transport protein B  28.77 
 
 
664 aa  159  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.51649  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0110  ferrous iron transport protein B  30.98 
 
 
668 aa  157  3e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0260348  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0970  ferrous iron transport protein B  28.93 
 
 
666 aa  156  9e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0839864 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0434  ferrous iron transport protein B  27.8 
 
 
665 aa  155  1e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  29.18 
 
 
631 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2809  ferrous iron transport protein B  27.68 
 
 
597 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.123024 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  30.51 
 
 
676 aa  153  7e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0779  ferrous iron transport protein B  30.13 
 
 
688 aa  147  5e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328587  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0095  ferrous iron transport protein B  27.91 
 
 
676 aa  146  9e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1458  ferrous iron transport protein B  28.54 
 
 
716 aa  145  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.137578  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  28.88 
 
 
631 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0618  ferrous iron transport protein B  27.61 
 
 
721 aa  144  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0536695  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0292  ferrous iron transport protein B  26.22 
 
 
784 aa  144  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000454012  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1631  ferrous iron transport protein B  27.56 
 
 
587 aa  143  8e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000698683  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1913  ferrous iron transport protein B  26.83 
 
 
587 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000339722  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1294  ferrous iron transport protein B  26.09 
 
 
844 aa  141  3e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1452  ferrous iron transport protein B  29 
 
 
665 aa  141  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.789379  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1097  ferrous iron transport protein B  30.75 
 
 
595 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0555  ferrous iron transport B domain-containing protein  30.31 
 
 
577 aa  140  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1343  ferrous iron transport protein B  25.7 
 
 
662 aa  139  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.547756  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0344  ferrous iron transport protein B  26.4 
 
 
724 aa  139  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00337716  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0873  ferrous iron transport protein B  27.08 
 
 
667 aa  137  4e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101727  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0895  ferrous iron transport protein B  27.08 
 
 
669 aa  137  4e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00236216  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2325  ferrous iron transport protein B  28.22 
 
 
848 aa  137  5e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3546  Ferrous iron transport protein B domain protein  30.35 
 
 
574 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1569  ferrous iron transport protein B  26.77 
 
 
659 aa  135  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000694144  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0259  ferrous iron transport protein B  27.09 
 
 
628 aa  135  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00038951  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0193  Fe2+ transport system protein B  26.67 
 
 
691 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1194  ferrous iron transport protein B  27.33 
 
 
714 aa  134  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1585  ferrous iron transport protein B  27.16 
 
 
723 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0104102  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2584  ferrous iron transporter B  26.74 
 
 
751 aa  133  9e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0719  ferrous iron transport protein B  25.11 
 
 
829 aa  132  9e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0311256  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2711  ferrous iron transporter B  26.74 
 
 
751 aa  132  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2843  ferrous iron transport protein B  29.12 
 
 
712 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0316  ferrous iron transport protein B  28.51 
 
 
725 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000873753  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0735  ferrous iron transport protein B  28.11 
 
 
648 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.56734  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56680  ferrous iron transport protein B  32.73 
 
 
766 aa  131  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0654  Fe2+ transport system protein B  26.04 
 
 
712 aa  131  3e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1088  ferrous iron transport protein B  25.51 
 
 
753 aa  130  4.0000000000000003e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000362942  hitchhiker  0.0000000000000163165 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0976  ferrous iron transport protein B  30.6 
 
 
676 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00114707  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4258  ferrous iron transport B domain-containing protein  28.53 
 
 
577 aa  129  9.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.966603  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2878  ferrous iron transport protein B  26.71 
 
 
606 aa  129  9.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0506695 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0108  ferrous iron transport protein B  27.36 
 
 
712 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3658  ferrous iron transport protein B  25.25 
 
 
741 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4929  ferrous iron transport protein B  32.37 
 
 
766 aa  128  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875416  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3524  ferrous iron transport protein B  24.83 
 
 
697 aa  127  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000134401  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0168  ferrous iron transport protein B  27.03 
 
 
771 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.426324  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3985  ferrous iron transport protein B  27.03 
 
 
771 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4105  ferrous iron transport protein B  24.32 
 
 
738 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281443  normal  0.296674 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1729  ferrous iron transport protein B  27.42 
 
 
717 aa  127  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0580785 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0675  ferrous iron transport protein B  26.96 
 
 
732 aa  127  5e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.183925  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2071  ferrous iron transport protein B  29.85 
 
 
774 aa  125  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3746  ferrous iron transport protein B  29.12 
 
 
771 aa  126  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1761  ferrous iron transport protein B  24.72 
 
 
711 aa  126  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1933  ferrous iron transport protein B  30.11 
 
 
774 aa  124  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.651093  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2434  ferrous iron transport protein B  25.43 
 
 
711 aa  124  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0984425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>