More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1159 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1159  GTP-binding protein HSR1-related  100 
 
 
322 aa  657    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0546  GTP-binding protein HSR1-related  73.03 
 
 
329 aa  489  1e-137  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3556  GTP-binding protein HSR1-related protein  66.97 
 
 
329 aa  436  1e-121  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1571  GTP-binding protein HSR1-related protein  65.85 
 
 
331 aa  430  1e-119  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2297  GTP-binding protein HSR1-related  65.62 
 
 
328 aa  424  1e-118  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.754733 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2164  GTP-binding protein  47 
 
 
333 aa  280  2e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.311194  normal  0.912911 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1887  GTP-binding protein  45.11 
 
 
356 aa  251  8.000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0267  nucleolar GTP-binding 1  43.17 
 
 
306 aa  247  2e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.809465  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1923  small GTP-binding protein  44.3 
 
 
326 aa  232  6e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2103  small GTP-binding protein  41.75 
 
 
330 aa  231  1e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0641  hypothetical protein  41.78 
 
 
340 aa  231  1e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0093  small GTP-binding protein  41.4 
 
 
317 aa  224  1e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.333043  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1570  small GTP-binding protein  39.3 
 
 
354 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2933  GTP-binding protein, HSR1-related  38.89 
 
 
324 aa  207  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000336633  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0148  small GTP-binding protein  36.64 
 
 
346 aa  205  7e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0331774  normal  0.033756 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0708  small GTP-binding protein  36.64 
 
 
346 aa  205  9e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1755  small GTP-binding protein  36.64 
 
 
346 aa  204  1e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0020  small GTP-binding protein  35.27 
 
 
347 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0801  small GTP-binding protein  37.72 
 
 
338 aa  191  1e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.911521  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2010  small GTP-binding protein  40.49 
 
 
348 aa  189  5.999999999999999e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75790  predicted protein  32.3 
 
 
640 aa  186  3e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.113893  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35887  predicted protein  35.03 
 
 
664 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01880  nucleolar GTP-binding protein 1, putative  37.55 
 
 
666 aa  181  2e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0752  small GTP-binding protein  38.03 
 
 
344 aa  177  3e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.741374 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05865  nucleolar GTP-binding protein (Nog1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11510)  31.29 
 
 
656 aa  176  5e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.181849  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2208  small GTP-binding protein  38.73 
 
 
345 aa  175  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.739861 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0918  small GTP-binding protein  39.08 
 
 
351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.259421  normal  0.0321262 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1688  small GTP-binding protein  34.4 
 
 
332 aa  172  6.999999999999999e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30365  predicted protein  31.74 
 
 
677 aa  170  2e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.660335  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0391  small GTP-binding protein  37.37 
 
 
334 aa  169  8e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1306  small GTP-binding protein  35.54 
 
 
355 aa  168  1e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.294825  normal  0.393807 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1975  small GTP-binding protein  31.82 
 
 
331 aa  146  6e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_3188  predicted protein  31.02 
 
 
290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43105  predicted protein  28.92 
 
 
455 aa  105  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1559  TGS domain-containing protein  36.51 
 
 
311 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.397282  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0250  small GTP-binding protein  32.26 
 
 
370 aa  65.5  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.829825  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2170  GTP-binding protein HSR1-related  32.52 
 
 
324 aa  64.7  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000924799 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  35.14 
 
 
415 aa  63.9  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0596  GTP-binding protein EngA  38.19 
 
 
467 aa  62.8  0.000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115321  hitchhiker  0.00000000000000451977 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20124  predicted protein  40.22 
 
 
400 aa  61.6  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.902407  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50671  predicted protein  36.67 
 
 
407 aa  61.6  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2429  small GTP-binding protein  32.74 
 
 
369 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1231  GTP-binding proten HflX  28.65 
 
 
370 aa  61.2  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2226  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.47 
 
 
416 aa  60.5  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00929863  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45203  predicted protein  31.46 
 
 
457 aa  60.1  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.017445  normal  0.182069 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1951  ferrous iron transport protein B  29.93 
 
 
654 aa  59.7  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3895  GTPase ObgE  29.82 
 
 
345 aa  60.1  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1945  small GTP-binding protein  28.83 
 
 
368 aa  60.1  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  40 
 
 
434 aa  59.3  0.00000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1848  small GTP-binding protein  32.29 
 
 
371 aa  59.3  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03250  cytoplasm protein, putative  29.47 
 
 
367 aa  58.5  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.594558  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0758  GTPase ObgE  35.56 
 
 
476 aa  58.9  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.639245  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2016  GTP-binding protein EngA  26.67 
 
 
435 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0627  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.29 
 
 
370 aa  58.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0262779  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2546  small GTP-binding protein  29.35 
 
 
370 aa  58.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.120198  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3449  GTPase ObgE  32.59 
 
 
516 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0579297  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1181  small GTP-binding protein  31.87 
 
 
370 aa  57.4  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0782  small GTP-binding protein  34.92 
 
 
371 aa  57.4  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0676  GTPase ObgE  30.28 
 
 
347 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1400  hypothetical protein  32.26 
 
 
370 aa  57.4  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0490  GTPase ObgE  37.23 
 
 
340 aa  57  0.0000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.831388  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1072  GTPase  29.66 
 
 
436 aa  57.4  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.561302  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0728  GTP-binding protein Obg/CgtA  32.64 
 
 
356 aa  56.6  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.199071 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0002  GTPase ObgE  29.92 
 
 
424 aa  56.6  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2632  small GTP-binding protein  36.8 
 
 
434 aa  56.6  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1699  small GTP-binding protein  35.05 
 
 
371 aa  57  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.473033  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2203  ribosome-associated GTPase EngA  36.15 
 
 
567 aa  56.2  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0754  small GTP-binding protein  37.1 
 
 
369 aa  56.2  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3317  tRNA modification GTPase TrmE  33.17 
 
 
446 aa  56.2  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0317  GTPase ObgE  50.91 
 
 
339 aa  56.2  0.0000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0871  small GTP-binding protein  25.49 
 
 
367 aa  56.2  0.0000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.548847  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02244  GTP binding protein (Gtp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06770)  32.95 
 
 
367 aa  56.2  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  29.86 
 
 
435 aa  56.2  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  29.86 
 
 
435 aa  56.2  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42420  predicted protein  32.95 
 
 
368 aa  55.8  0.0000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.257266  normal  0.210698 
 
 
-
 
NC_002936  DET0002  GTPase ObgE  28.8 
 
 
424 aa  55.8  0.0000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0688  small GTP-binding protein  37.1 
 
 
369 aa  55.8  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.629301  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1230  small GTP-binding protein  37.1 
 
 
369 aa  55.8  0.0000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  30 
 
 
426 aa  55.8  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1580  tRNA modification GTPase TrmE  32.96 
 
 
444 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.183316 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  29.61 
 
 
427 aa  55.8  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2114  GTP-binding protein, HSR1-related  39.33 
 
 
330 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0543  GTPase ObgE  34.65 
 
 
340 aa  55.5  0.000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0135  small GTP-binding protein  37.1 
 
 
369 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3378  GTP-binding protein Obg/CgtA  33.78 
 
 
454 aa  54.7  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2929  tRNA modification GTPase TrmE  32.53 
 
 
446 aa  54.7  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  37.84 
 
 
423 aa  54.7  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.82 
 
 
434 aa  55.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_2  GTP-binding protein, GTP1/OBG family  28.8 
 
 
424 aa  54.7  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0684  small GTP-binding protein  25.4 
 
 
369 aa  54.3  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0699  GTPase ObgE  30.53 
 
 
335 aa  54.3  0.000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.244108  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  30.28 
 
 
430 aa  54.3  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000454316  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0733  GTP-binding protein EngA  32.8 
 
 
500 aa  53.9  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0574  GTP-binding protein  29.03 
 
 
364 aa  54.3  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.437415  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3835  GTP-binding protein Obg/CgtA  34.02 
 
 
346 aa  54.3  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0583  GTP-binding protein HflX  31.14 
 
 
512 aa  53.9  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.622699 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1222  Obg family GTPase CgtA  41.07 
 
 
560 aa  53.9  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000289684 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3577  GTP1/OBG domain-containing protein  30.82 
 
 
439 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3874  GTPase ObgE  47.27 
 
 
364 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00849027 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4198  GTPase ObgE  47.27 
 
 
364 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501209  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>