More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0583 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0583  GTP-binding protein HflX  100 
 
 		 512 aa  1035    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.622699 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  70.41 
 
 		 501 aa  660    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  60.04 
 
 		 509 aa  526  1e-148  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  62.97 
 
 		 493 aa  497  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1140  GTP-binding proten HflX  62 
 
 		 501 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.762868 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  53.74 
 
 		 502 aa  492  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  59.51 
 
 		 515 aa  492  9.999999999999999e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1562  GTP-binding proten HflX  60.9 
 
 		 505 aa  493  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.410019  hitchhiker  0.00407104 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  58.53 
 
 		 521 aa  489  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1255  GTP-binding proten HflX  58.08 
 
 		 515 aa  487  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  55.78 
 
 		 493 aa  484  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  55.6 
 
 		 553 aa  482  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115477 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  56.06 
 
 		 517 aa  479  1e-134  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  56.79 
 
 		 522 aa  478  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  54.21 
 
 		 503 aa  478  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07300  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein TIGR00650  62.95 
 
 		 546 aa  470  1.0000000000000001e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1503  small GTP-binding protein  60.19 
 
 		 530 aa  471  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0726763  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  56.3 
 
 		 487 aa  465  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2263  GTP-binding family protein ; K03665 GTP-binding protein HflX  58.3 
 
 		 494 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586252 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  59.46 
 
 		 486 aa  462  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  60.36 
 
 		 512 aa  462  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  60.18 
 
 		 485 aa  464  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  57.49 
 
 		 482 aa  461  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  55.68 
 
 		 479 aa  452  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0684  GTP-binding proten HflX  55.85 
 
 		 512 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  54.81 
 
 		 484 aa  437  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4564  GTP-binding proten HflX  57.73 
 
 		 466 aa  432  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.631716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1482  small GTP-binding protein  58.37 
 
 		 524 aa  434  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.578947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3837  GTP-binding protein, HSR1-related  55.26 
 
 		 493 aa  434  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1407  small GTP-binding protein  55.68 
 
 		 515 aa  429  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155427 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1449  GTP-binding protein, HSR1-related  55.46 
 
 		 494 aa  427  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.062201  normal  0.276789 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12738  GTP-binding protein hflX  54.2 
 
 		 495 aa  419  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.324868 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2151  GTP-binding protein, HSR1-related  55.75 
 
 		 483 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.0136453 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2164  GTP-binding protein, HSR1-related  55.53 
 
 		 483 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.951338  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2210  GTP-binding protein, HSR1-related  55.53 
 
 		 483 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60775  normal  0.0439435 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1436  GTP-binding proten HflX  55.88 
 
 		 480 aa  418  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3960  GTP-binding protein, HSR1-related  55.85 
 
 		 482 aa  412  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.342247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2436  GTP-binding protein, HSR1-related  55.75 
 
 		 482 aa  412  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445847  normal  0.220236 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  44.88 
 
 		 582 aa  312  9e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  44.23 
 
 		 433 aa  311  1e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  44.98 
 
 		 421 aa  310  4e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  42.79 
 
 		 395 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  44.17 
 
 		 414 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  42.22 
 
 		 436 aa  303  5.000000000000001e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0528  GTP-binding proten HflX  53.59 
 
 		 384 aa  301  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270654  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  40.85 
 
 		 461 aa  298  1e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  44.5 
 
 		 442 aa  298  2e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  46.84 
 
 		 422 aa  296  4e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  40.05 
 
 		 435 aa  296  6e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  42.45 
 
 		 454 aa  293  5e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  44.74 
 
 		 434 aa  293  7e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  40.72 
 
 		 437 aa  292  1e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  43.49 
 
 		 434 aa  292  1e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  41.38 
 
 		 441 aa  291  1e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  42.89 
 
 		 596 aa  290  3e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  41.98 
 
 		 454 aa  290  5.0000000000000004e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  43.54 
 
 		 489 aa  288  1e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  44.79 
 
 		 435 aa  288  1e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  41.49 
 
 		 420 aa  288  2e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  43.54 
 
 		 489 aa  288  2e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  49.58 
 
 		 434 aa  288  2e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3259  GTP-binding proten HflX  45.43 
 
 		 450 aa  287  2.9999999999999996e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0957781 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  43.34 
 
 		 431 aa  286  7e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  42.89 
 
 		 440 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  40.15 
 
 		 419 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  39.02 
 
 		 419 aa  283  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  40.15 
 
 		 419 aa  283  7.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  39.9 
 
 		 419 aa  282  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  38.79 
 
 		 419 aa  281  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  39.17 
 
 		 419 aa  281  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1232  GTP-binding proten HflX  42.79 
 
 		 415 aa  280  4e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000402227  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  38.55 
 
 		 419 aa  280  4e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  41.67 
 
 		 413 aa  280  4e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  40.19 
 
 		 444 aa  280  5e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  39.02 
 
 		 419 aa  280  5e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  39.02 
 
 		 419 aa  279  9e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  39.02 
 
 		 419 aa  279  9e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4167  GTP-binding proten HflX  43.35 
 
 		 396 aa  278  1e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000123151  unclonable  0.00000000000307153 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  41.93 
 
 		 401 aa  277  3e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1886  GTP-binding protein HflX  44.98 
 
 		 406 aa  276  7e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.968139 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  47.22 
 
 		 433 aa  276  8e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04515  GTP-binding protein HflX  46.3 
 
 		 407 aa  275  1.0000000000000001e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.546831  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  39.18 
 
 		 415 aa  274  2.0000000000000002e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1868  GTP-binding protein, HSR1-related  41.84 
 
 		 481 aa  275  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0249572  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1916  GTP-binding protein  41.09 
 
 		 401 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328695  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  41.28 
 
 		 433 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  41.28 
 
 		 433 aa  273  6e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0658  GTP-binding proten HflX  50.46 
 
 		 425 aa  273  7e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  43.48 
 
 		 553 aa  272  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1212  GTP-binding protein HflX  45.23 
 
 		 412 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  43.44 
 
 		 441 aa  270  4e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3023  GTP-binding proten HflX  46.11 
 
 		 540 aa  270  5e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1171  GTP-binding protein, HSR1-related  44.58 
 
 		 409 aa  269  8e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  42.82 
 
 		 441 aa  269  8.999999999999999e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0879  GTP-binding proten HflX  46.33 
 
 		 561 aa  268  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2114  GTP-binding proten HflX  45 
 
 		 415 aa  269  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1195  GTP-binding protein  45.54 
 
 		 412 aa  269  1e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00118595  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  42.38 
 
 		 414 aa  268  2e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1628  GTP-binding protein, HSR1-related  40.44 
 
 		 425 aa  268  2e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0275  GTP-binding proten HflX  45.88 
 
 		 564 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>