More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2297 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2297  GTP-binding protein HSR1-related  100 
 
 		 328 aa  667    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.754733 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3556  GTP-binding protein HSR1-related protein  64.53 
 
 		 329 aa  439  9.999999999999999e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1571  GTP-binding protein HSR1-related protein  65.05 
 
 		 331 aa  437  1e-121  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1159  GTP-binding protein HSR1-related  65.62 
 
 		 322 aa  424  1e-118  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0546  GTP-binding protein HSR1-related  60.73 
 
 		 329 aa  394  1e-108  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2164  GTP-binding protein  51.11 
 
 		 333 aa  312  4.999999999999999e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.311194  normal  0.912911 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1887  GTP-binding protein  50.16 
 
 		 356 aa  273  3e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0267  nucleolar GTP-binding 1  45.55 
 
 		 306 aa  248  1e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.809465  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1923  small GTP-binding protein  45.54 
 
 		 326 aa  242  7e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2103  small GTP-binding protein  41.75 
 
 		 330 aa  239  2.9999999999999997e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0093  small GTP-binding protein  42.36 
 
 		 317 aa  238  1e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.333043  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0641  hypothetical protein  38.3 
 
 		 340 aa  236  3e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2933  GTP-binding protein, HSR1-related  42.26 
 
 		 324 aa  227  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000336633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1570  small GTP-binding protein  40.13 
 
 		 354 aa  223  3e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0148  small GTP-binding protein  37.11 
 
 		 346 aa  202  9e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0331774  normal  0.033756 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0708  small GTP-binding protein  36.77 
 
 		 346 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1755  small GTP-binding protein  36.77 
 
 		 346 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0020  small GTP-binding protein  36.08 
 
 		 347 aa  197  3e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0801  small GTP-binding protein  38.71 
 
 		 338 aa  185  7e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.911521  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35887  predicted protein  32.78 
 
 		 664 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05865  nucleolar GTP-binding protein (Nog1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11510)  31.85 
 
 		 656 aa  172  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.181849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2010  small GTP-binding protein  38.11 
 
 		 348 aa  168  1e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2208  small GTP-binding protein  34.8 
 
 		 345 aa  168  1e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.739861 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1306  small GTP-binding protein  35.42 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.294825  normal  0.393807 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30365  predicted protein  29.91 
 
 		 677 aa  167  2.9999999999999998e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.660335  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75790  predicted protein  28.19 
 
 		 640 aa  166  6.9999999999999995e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.113893  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01880  nucleolar GTP-binding protein 1, putative  35.74 
 
 		 666 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1688  small GTP-binding protein  33.44 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0391  small GTP-binding protein  35.59 
 
 		 334 aa  159  5e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0752  small GTP-binding protein  37.6 
 
 		 344 aa  157  2e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.741374 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0918  small GTP-binding protein  36.78 
 
 		 351 aa  156  4e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.259421  normal  0.0321262 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1975  small GTP-binding protein  30.99 
 
 		 331 aa  134  3e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_3188  predicted protein  30.93 
 
 		 290 aa  132  7.999999999999999e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43105  predicted protein  27.54 
 
 		 455 aa  100  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.56 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  33.33 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0728  GTP-binding protein Obg/CgtA  35.94 
 
 		 356 aa  63.5  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.199071 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2226  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.91 
 
 		 416 aa  63.5  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00929863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  33.65 
 
 		 434 aa  63.2  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0596  GTP-binding protein EngA  35.43 
 
 		 467 aa  63.2  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115321  hitchhiker  0.00000000000000451977 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0574  GTP-binding protein  26.49 
 
 		 364 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.437415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0250  small GTP-binding protein  32.97 
 
 		 370 aa  62  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.829825  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2429  small GTP-binding protein  36.05 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1559  TGS domain-containing protein  35.16 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.397282  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1945  small GTP-binding protein  34.88 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3727  ribosome-associated GTPase EngA  32.22 
 
 		 518 aa  58.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  39.44 
 
 		 435 aa  58.9  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  39.44 
 
 		 435 aa  58.9  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  32.62 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  33.98 
 
 		 458 aa  58.9  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0758  GTPase ObgE  35.16 
 
 		 476 aa  58.9  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.639245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1181  small GTP-binding protein  36.05 
 
 		 370 aa  58.5  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02244  GTP binding protein (Gtp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06770)  31.82 
 
 		 367 aa  57.8  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11420  GTP-binding protein Obg/CgtA  35.05 
 
 		 517 aa  57.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.32525  decreased coverage  0.000779693 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02790  cytoplasm protein, putative  31.73 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0463275  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1951  ferrous iron transport protein B  36.84 
 
 		 654 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1224  ribosome-associated GTPase EngA  31.69 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1523  GTPase ObgE  33.33 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1400  hypothetical protein  27.01 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  37.5 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3308  GTP-binding protein EngA  31.3 
 
 		 487 aa  57  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45203  predicted protein  30.17 
 
 		 457 aa  57  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.017445  normal  0.182069 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2170  GTP-binding protein HSR1-related  33.59 
 
 		 324 aa  57  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000924799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2546  small GTP-binding protein  30.43 
 
 		 370 aa  57  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.120198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1232  GTP-binding protein EngA  31.3 
 
 		 488 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1303  GTP-binding protein EngA  31.3 
 
 		 488 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1233  GTP-binding protein EngA  31.3 
 
 		 488 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2361  GTP-binding protein EngA  32.06 
 
 		 488 aa  57  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.596104  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2648  GTP-binding protein EngA  31.3 
 
 		 488 aa  56.6  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3378  GTP-binding protein Obg/CgtA  32.41 
 
 		 454 aa  56.6  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2668  GTP-binding protein Obg/CgtA  40 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00700338  normal  0.373543 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0810  GTPase ObgE  32.28 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0769748  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3144  GTP-binding protein EngA  31.3 
 
 		 488 aa  56.6  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0749903 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1377  GTP-binding protein EngA  31.3 
 
 		 488 aa  56.6  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.694687  normal  0.70956 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2986  GTP-binding protein EngA  31.3 
 
 		 488 aa  56.6  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.306969  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0754  small GTP-binding protein  26.19 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0684  small GTP-binding protein  31.52 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3001  GTP-binding protein EngA  31.3 
 
 		 488 aa  56.6  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  31.25 
 
 		 439 aa  56.6  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  33.33 
 
 		 425 aa  56.2  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05980  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.06 
 
 		 464 aa  56.2  0.0000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00718326  decreased coverage  0.00000000000109453 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2045  GTP-binding protein EngA  34.59 
 
 		 464 aa  55.8  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1498  GTP-binding protein EngA  33.64 
 
 		 462 aa  55.8  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0782  small GTP-binding protein  33.72 
 
 		 371 aa  55.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2016  GTP-binding protein EngA  26.29 
 
 		 435 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  38.03 
 
 		 354 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1617  GTP-binding protein EngA  28.11 
 
 		 460 aa  55.8  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1309  GTP-binding protein EngA  31.3 
 
 		 490 aa  55.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00502538  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0312  GTP-binding protein Obg/CgtA  34.78 
 
 		 432 aa  55.5  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  38.03 
 
 		 354 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1726  GTPase ObgE  30.84 
 
 		 376 aa  55.5  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  32.65 
 
 		 370 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1260  GTP-binding protein EngA  31.3 
 
 		 491 aa  55.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00475437  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42420  predicted protein  34.09 
 
 		 368 aa  55.8  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.257266  normal  0.210698 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1548  GTP-binding protein EngA  31.3 
 
 		 488 aa  55.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20124  predicted protein  34.78 
 
 		 400 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.902407  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3587  small GTP-binding protein  32.09 
 
 		 495 aa  55.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.748458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1536  GTPase ObgE  27.22 
 
 		 344 aa  55.1  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3449  GTPase ObgE  30 
 
 		 516 aa  55.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0579297  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0733  GTP-binding protein EngA  33.71 
 
 		 500 aa  55.8  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>