More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1570 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1570  small GTP-binding protein  100 
 
 		 354 aa  733    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2103  small GTP-binding protein  62.26 
 
 		 330 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0641  hypothetical protein  63.33 
 
 		 340 aa  398  9.999999999999999e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1923  small GTP-binding protein  58.75 
 
 		 326 aa  368  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2933  GTP-binding protein, HSR1-related  57.19 
 
 		 324 aa  348  6e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000336633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2164  GTP-binding protein  43.28 
 
 		 333 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.311194  normal  0.912911 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1887  GTP-binding protein  42.3 
 
 		 356 aa  248  1e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3556  GTP-binding protein HSR1-related protein  41.99 
 
 		 329 aa  238  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0267  nucleolar GTP-binding 1  39.22 
 
 		 306 aa  237  3e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.809465  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0093  small GTP-binding protein  39.16 
 
 		 317 aa  230  2e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.333043  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0546  GTP-binding protein HSR1-related  39.16 
 
 		 329 aa  224  2e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1571  GTP-binding protein HSR1-related protein  39.17 
 
 		 331 aa  223  3e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2297  GTP-binding protein HSR1-related  40.13 
 
 		 328 aa  223  3e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.754733 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1159  GTP-binding protein HSR1-related  39.3 
 
 		 322 aa  219  5e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0020  small GTP-binding protein  38.28 
 
 		 347 aa  217  2e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0708  small GTP-binding protein  38.97 
 
 		 346 aa  212  7e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0148  small GTP-binding protein  38.97 
 
 		 346 aa  212  1e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0331774  normal  0.033756 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1755  small GTP-binding protein  36.21 
 
 		 346 aa  209  7e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0801  small GTP-binding protein  39.27 
 
 		 338 aa  203  3e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.911521  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0752  small GTP-binding protein  40.46 
 
 		 344 aa  183  3e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.741374 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2208  small GTP-binding protein  35.83 
 
 		 345 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.739861 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2010  small GTP-binding protein  38.01 
 
 		 348 aa  182  6e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0918  small GTP-binding protein  37.76 
 
 		 351 aa  177  4e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.259421  normal  0.0321262 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1306  small GTP-binding protein  38.43 
 
 		 355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.294825  normal  0.393807 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35887  predicted protein  33.96 
 
 		 664 aa  160  4e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0391  small GTP-binding protein  32.54 
 
 		 334 aa  158  2e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75790  predicted protein  32.04 
 
 		 640 aa  154  2e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.113893  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01880  nucleolar GTP-binding protein 1, putative  31.93 
 
 		 666 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05865  nucleolar GTP-binding protein (Nog1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11510)  30.8 
 
 		 656 aa  147  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.181849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30365  predicted protein  29.12 
 
 		 677 aa  145  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.660335  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1975  small GTP-binding protein  35.93 
 
 		 331 aa  135  7.000000000000001e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1688  small GTP-binding protein  34.35 
 
 		 332 aa  130  3e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_3188  predicted protein  28.07 
 
 		 290 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43105  predicted protein  32.56 
 
 		 455 aa  93.6  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2226  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.29 
 
 		 416 aa  69.7  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00929863  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  28.49 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  32.61 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2974  GTP-binding protein Era  32.86 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0899132  hitchhiker  0.00507105 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0250  small GTP-binding protein  31.67 
 
 		 370 aa  65.1  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.829825  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1387  GTP-binding protein Era  33.6 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.263237  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  30.85 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  31.11 
 
 		 353 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1506  GTP-binding protein Era  34.65 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.094805  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  30.19 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1541  small GTP-binding protein  27.38 
 
 		 363 aa  62.8  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  29.31 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  28.93 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  27.86 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0251  GTPase ObgE  29.38 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3038  tRNA modification GTPase TrmE  28.64 
 
 		 448 aa  60.1  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.38062  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1945  small GTP-binding protein  29.75 
 
 		 368 aa  60.1  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  27.65 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  28.57 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2546  small GTP-binding protein  30.77 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.120198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2668  GTP-binding protein Obg/CgtA  24.54 
 
 		 427 aa  59.7  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00700338  normal  0.373543 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1462  GTP-binding protein Era  31.82 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  29.79 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20124  predicted protein  29.17 
 
 		 400 aa  59.3  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.902407  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  33.83 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0104  tRNA modification GTPase TrmE  33.33 
 
 		 462 aa  58.9  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_2  GTP-binding protein, GTP1/OBG family  43.86 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  29.84 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1582  GTPase ObgE  30.15 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02641  tRNA modification GTPase TrmE  28.35 
 
 		 464 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2429  small GTP-binding protein  28.57 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45203  predicted protein  31.02 
 
 		 457 aa  58.2  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.017445  normal  0.182069 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  32.73 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3577  GTP1/OBG domain-containing protein  26.67 
 
 		 439 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0973  GTP-binding protein Era  26.72 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0002  GTPase ObgE  43.86 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  27.09 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  37.01 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1525  GTPase ObgE  34.75 
 
 		 357 aa  57.8  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1004  GTP-binding protein Era  26.72 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0574  GTP-binding protein  29.67 
 
 		 364 aa  57.4  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.437415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1445  GTP-binding protein Era  29.77 
 
 		 298 aa  57  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0735  GTP-binding protein Era  30.73 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.222854  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0517  GTPase ObgE  31.55 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1726  GTPase ObgE  34.88 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1181  small GTP-binding protein  28.93 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0969  GTPase ObgE  30.73 
 
 		 389 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00013573  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1038  GTPase ObgE  30.73 
 
 		 389 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000432526  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1376  GTP-binding protein Era  29.77 
 
 		 298 aa  57  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1653  small GTP-binding protein Era  32.26 
 
 		 310 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  29.44 
 
 		 353 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3321  GTPase ObgE  30.73 
 
 		 389 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000481857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1071  GTPase ObgE  30.73 
 
 		 389 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00003897  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02244  GTP binding protein (Gtp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06770)  32.43 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3317  tRNA modification GTPase TrmE  30 
 
 		 446 aa  56.6  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0627  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.85 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0262779  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2170  GTP-binding protein HSR1-related  36.08 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000924799 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  29.48 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  31.54 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  28.44 
 
 		 358 aa  56.2  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1247  GTP-binding protein Era  27.59 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.734456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2293  GTP-binding protein Era  32.26 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0382696  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02790  cytoplasm protein, putative  30.77 
 
 		 368 aa  56.2  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0463275  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  28.98 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2205  GTP-binding protein Era  32.26 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.395814  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0728  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.95 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.199071 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>