More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0148 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0148  small GTP-binding protein  100 
 
 		 346 aa  696    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0331774  normal  0.033756 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1755  small GTP-binding protein  96.82 
 
 		 346 aa  674    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0708  small GTP-binding protein  96.82 
 
 		 346 aa  679    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0020  small GTP-binding protein  85.22 
 
 		 347 aa  610  1e-173  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0801  small GTP-binding protein  70.42 
 
 		 338 aa  436  1e-121  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.911521  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2164  GTP-binding protein  39.52 
 
 		 333 aa  251  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.311194  normal  0.912911 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0093  small GTP-binding protein  43.25 
 
 		 317 aa  248  1e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.333043  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2103  small GTP-binding protein  39.39 
 
 		 330 aa  228  8e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1887  GTP-binding protein  43.5 
 
 		 356 aa  222  9e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1923  small GTP-binding protein  36.97 
 
 		 326 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1570  small GTP-binding protein  38.97 
 
 		 354 aa  212  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0641  hypothetical protein  34.43 
 
 		 340 aa  209  6e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1159  GTP-binding protein HSR1-related  36.64 
 
 		 322 aa  205  8e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0267  nucleolar GTP-binding 1  36.33 
 
 		 306 aa  203  3e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.809465  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0546  GTP-binding protein HSR1-related  34.33 
 
 		 329 aa  202  5e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2297  GTP-binding protein HSR1-related  37.11 
 
 		 328 aa  202  9e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.754733 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0391  small GTP-binding protein  35 
 
 		 334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3556  GTP-binding protein HSR1-related protein  36.16 
 
 		 329 aa  199  3.9999999999999996e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2933  GTP-binding protein, HSR1-related  38.28 
 
 		 324 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000336633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1571  GTP-binding protein HSR1-related protein  36.04 
 
 		 331 aa  192  7e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35887  predicted protein  28.53 
 
 		 664 aa  188  1e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0918  small GTP-binding protein  33.44 
 
 		 351 aa  186  4e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.259421  normal  0.0321262 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2010  small GTP-binding protein  33.44 
 
 		 348 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2208  small GTP-binding protein  33.22 
 
 		 345 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.739861 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75790  predicted protein  30.18 
 
 		 640 aa  179  8e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.113893  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0752  small GTP-binding protein  32.89 
 
 		 344 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.741374 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1306  small GTP-binding protein  34.09 
 
 		 355 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.294825  normal  0.393807 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05865  nucleolar GTP-binding protein (Nog1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11510)  28.7 
 
 		 656 aa  173  3.9999999999999995e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.181849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30365  predicted protein  29.41 
 
 		 677 aa  166  4e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.660335  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1975  small GTP-binding protein  36.9 
 
 		 331 aa  163  5.0000000000000005e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01880  nucleolar GTP-binding protein 1, putative  29.69 
 
 		 666 aa  160  4e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1688  small GTP-binding protein  33.14 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_3188  predicted protein  28.16 
 
 		 290 aa  124  3e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43105  predicted protein  25.25 
 
 		 455 aa  117  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0676  GTPase ObgE  31.34 
 
 		 347 aa  73.6  0.000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  29.47 
 
 		 427 aa  69.3  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  31.71 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0250  small GTP-binding protein  36.7 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.829825  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  29.94 
 
 		 425 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1945  small GTP-binding protein  40.7 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.23 
 
 		 426 aa  64.7  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1549  GTP-binding protein Obg/CgtA  28.71 
 
 		 463 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  31.25 
 
 		 423 aa  64.7  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0185  GTPase ObgE  29.9 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  29.95 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  29.35 
 
 		 428 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  29.35 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1194  ferrous iron transport protein B  30.34 
 
 		 714 aa  62.8  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  29.35 
 
 		 428 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  30.29 
 
 		 428 aa  62.8  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  30.29 
 
 		 428 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2429  small GTP-binding protein  30.63 
 
 		 369 aa  62.8  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0929  GTP-binding protein Obg/CgtA  27.03 
 
 		 426 aa  62.4  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0009475  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  30.29 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  30.29 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2218  GTPase ObgE  26.55 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  30.29 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5095  GTP-binding protein Obg/CgtA  32.54 
 
 		 334 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15330  cytidylate kinase  33.14 
 
 		 755 aa  61.6  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.201651  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  29.71 
 
 		 428 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  29.71 
 
 		 428 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0418  GTPase ObgE  28.14 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1181  small GTP-binding protein  34.29 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  27.23 
 
 		 437 aa  60.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1650  GTP-binding protein Obg/CgtA  26.87 
 
 		 439 aa  59.7  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1837  GTP-binding protein Obg/CgtA  31.03 
 
 		 435 aa  59.7  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2226  GTP-binding protein Obg/CgtA  31.1 
 
 		 416 aa  59.7  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00929863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1536  GTPase ObgE  27.08 
 
 		 344 aa  59.3  0.00000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12990  ferrous iron transporter FeoB  32.16 
 
 		 824 aa  58.9  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0255803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0782  small GTP-binding protein  35.78 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3577  GTP1/OBG domain-containing protein  27.09 
 
 		 439 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  27.84 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0728  GTP-binding protein Obg/CgtA  29.38 
 
 		 356 aa  58.9  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.199071 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4334  GTPase ObgE  31.29 
 
 		 424 aa  59.3  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00027074  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0489  GTPase ObgE  30.51 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4144  GTP-binding protein Obg/CgtA  28.65 
 
 		 368 aa  58.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0532  GTPase ObgE  29.55 
 
 		 433 aa  58.2  0.0000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0114887  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1277  small GTP-binding protein domain-containing protein  31.29 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.038791  hitchhiker  0.00000385407 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  27.47 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1694  GTPase ObgE  29.19 
 
 		 437 aa  58.5  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3380  GTPase ObgE  29.84 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0866  GTPase ObgE  30.56 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  26.8 
 
 		 425 aa  57.8  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4091  GTPase ObgE  27.27 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1538  GTP-binding protein EngA  30.43 
 
 		 516 aa  57.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0501467  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  27.18 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1538  GTP-binding protein EngA  30.68 
 
 		 516 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000734498 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10130  GTPase ObgE  26.42 
 
 		 515 aa  57.4  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.398815  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3459  ferrous iron transport protein B  30.67 
 
 		 715 aa  57  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000760098  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1624  GTPase ObgE  26.39 
 
 		 519 aa  57  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.647176  normal  0.880816 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18250  GTPase ObgE  27.31 
 
 		 509 aa  57  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106834  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15170  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  30.36 
 
 		 527 aa  56.6  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00982196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2180  GTPase ObgE  27.92 
 
 		 454 aa  56.6  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  28.89 
 
 		 458 aa  56.6  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  29.34 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4265  GTP-binding protein Obg/CgtA  26.6 
 
 		 454 aa  56.6  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.256023  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  28.74 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  31.52 
 
 		 435 aa  56.2  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1726  GTPase ObgE  26.78 
 
 		 376 aa  56.2  0.0000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2143  GTPase ObgE  26.51 
 
 		 529 aa  56.2  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.37985e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>