283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_75790 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001301  ANIA_05865  nucleolar GTP-binding protein (Nog1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11510)  60.49 
 
 
656 aa  787    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.181849  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01880  nucleolar GTP-binding protein 1, putative  52.58 
 
 
666 aa  655    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75790  predicted protein  100 
 
 
640 aa  1329    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.113893  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35887  predicted protein  46.56 
 
 
664 aa  593  1e-168  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30365  predicted protein  48.11 
 
 
677 aa  514  1e-144  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.660335  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3556  GTP-binding protein HSR1-related protein  32.39 
 
 
329 aa  189  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1159  GTP-binding protein HSR1-related  31.97 
 
 
322 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1571  GTP-binding protein HSR1-related protein  31.77 
 
 
331 aa  184  6e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0267  nucleolar GTP-binding 1  40.09 
 
 
306 aa  182  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.809465  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0708  small GTP-binding protein  30.77 
 
 
346 aa  181  4.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1923  small GTP-binding protein  35.27 
 
 
326 aa  181  4.999999999999999e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0093  small GTP-binding protein  34.13 
 
 
317 aa  180  7e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.333043  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0148  small GTP-binding protein  30.18 
 
 
346 aa  179  2e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0331774  normal  0.033756 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1755  small GTP-binding protein  29.59 
 
 
346 aa  178  2e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0752  small GTP-binding protein  32.56 
 
 
344 aa  178  3e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.741374 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2010  small GTP-binding protein  31.17 
 
 
348 aa  176  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2103  small GTP-binding protein  35.49 
 
 
330 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2208  small GTP-binding protein  31.03 
 
 
345 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.739861 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2164  GTP-binding protein  35.96 
 
 
333 aa  174  5e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.311194  normal  0.912911 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0641  hypothetical protein  35.17 
 
 
340 aa  171  4e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0020  small GTP-binding protein  31.35 
 
 
347 aa  171  5e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0918  small GTP-binding protein  30.62 
 
 
351 aa  171  5e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.259421  normal  0.0321262 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0546  GTP-binding protein HSR1-related  30.79 
 
 
329 aa  169  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0391  small GTP-binding protein  32.95 
 
 
334 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2297  GTP-binding protein HSR1-related  29.49 
 
 
328 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.754733 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1306  small GTP-binding protein  31.49 
 
 
355 aa  165  2.0000000000000002e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.294825  normal  0.393807 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1887  GTP-binding protein  36.29 
 
 
356 aa  165  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2933  GTP-binding protein, HSR1-related  31.23 
 
 
324 aa  160  7e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000336633  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0801  small GTP-binding protein  30.07 
 
 
338 aa  159  2e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.911521  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1570  small GTP-binding protein  32.04 
 
 
354 aa  154  4e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1688  small GTP-binding protein  30.71 
 
 
332 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1975  small GTP-binding protein  30.08 
 
 
331 aa  136  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_3188  predicted protein  27.74 
 
 
290 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43105  predicted protein  24.48 
 
 
455 aa  110  7.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  28.38 
 
 
415 aa  68.9  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  29.63 
 
 
435 aa  62.8  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  29.63 
 
 
435 aa  62.4  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2226  GTP-binding protein Obg/CgtA  26.57 
 
 
416 aa  61.2  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00929863  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0871  small GTP-binding protein  45.61 
 
 
367 aa  60.8  0.00000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.548847  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2546  small GTP-binding protein  35.11 
 
 
370 aa  59.3  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.120198  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  28.67 
 
 
434 aa  59.3  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4236  GTP-binding protein Obg/CgtA  28.97 
 
 
396 aa  58.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000643018  hitchhiker  0.00000182471 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1559  TGS domain-containing protein  25.82 
 
 
311 aa  57.8  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.397282  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0069  GTPase ObgE  28.97 
 
 
337 aa  57.8  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0754  small GTP-binding protein  43.86 
 
 
369 aa  57.8  0.0000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0688  small GTP-binding protein  42.11 
 
 
369 aa  57  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.629301  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1230  small GTP-binding protein  42.11 
 
 
369 aa  57  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0135  small GTP-binding protein  42.11 
 
 
369 aa  56.6  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1400  hypothetical protein  32.98 
 
 
370 aa  56.6  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0758  GTPase ObgE  27.07 
 
 
476 aa  56.6  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.639245  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  27.95 
 
 
434 aa  55.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3649  GTPase ObgE  28.67 
 
 
388 aa  55.8  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3895  GTPase ObgE  26.86 
 
 
345 aa  55.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1006  GTPase ObgE  26.9 
 
 
389 aa  55.5  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134861  decreased coverage  0.00000589779 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1541  small GTP-binding protein  30.3 
 
 
363 aa  55.1  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2103  GTP-binding protein EngA  32.16 
 
 
441 aa  54.7  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0897  GTPase ObgE  28.67 
 
 
388 aa  54.7  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00842399  normal  0.946957 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3123  GTPase ObgE  28.67 
 
 
388 aa  54.7  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0347517  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3217  GTPase ObgE  28.67 
 
 
388 aa  54.7  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000011291  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  25.57 
 
 
402 aa  54.7  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2218  GTPase ObgE  24.71 
 
 
433 aa  54.3  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02790  cytoplasm protein, putative  34.09 
 
 
368 aa  54.3  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0463275  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2925  GTPase ObgE  29.85 
 
 
388 aa  53.9  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000231295  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3087  GTPase ObgE  27.92 
 
 
388 aa  53.9  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1072  GTPase  25.97 
 
 
436 aa  53.9  0.000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.561302  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  24.75 
 
 
440 aa  53.9  0.000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20124  predicted protein  38.33 
 
 
400 aa  53.9  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.902407  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  27.1 
 
 
408 aa  53.9  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91341 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02244  GTP binding protein (Gtp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06770)  40.68 
 
 
367 aa  53.5  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0782  small GTP-binding protein  37.93 
 
 
371 aa  53.9  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0854  GTPase ObgE  27.97 
 
 
387 aa  53.5  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000429069  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1038  GTPase ObgE  27.27 
 
 
389 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000432526  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  26.45 
 
 
408 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1945  small GTP-binding protein  25.56 
 
 
368 aa  53.1  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3577  GTP1/OBG domain-containing protein  24 
 
 
439 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  26.42 
 
 
407 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0969  GTPase ObgE  27.27 
 
 
389 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00013573  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  25.32 
 
 
407 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3321  GTPase ObgE  27.27 
 
 
389 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000481857  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1071  GTPase ObgE  27.27 
 
 
389 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00003897  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  28.9 
 
 
427 aa  52.8  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0627  small GTP-binding protein domain-containing protein  35.09 
 
 
370 aa  52.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0262779  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  26.45 
 
 
408 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4091  GTPase ObgE  25.15 
 
 
335 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1699  small GTP-binding protein  25.4 
 
 
371 aa  52  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.473033  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  22.31 
 
 
458 aa  52  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5226  ribosome-associated GTPase EngA  27.06 
 
 
435 aa  52.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.814163 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0250  small GTP-binding protein  36.21 
 
 
370 aa  52  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.829825  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  24.59 
 
 
358 aa  52  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  25.81 
 
 
408 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1848  small GTP-binding protein  36.84 
 
 
371 aa  51.6  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0489  GTPase ObgE  25 
 
 
332 aa  51.6  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1705  GTPase ObgE  26.28 
 
 
348 aa  51.6  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.074389  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1181  small GTP-binding protein  36.21 
 
 
370 aa  51.6  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0871  GTPase ObgE  29.92 
 
 
387 aa  51.6  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0184633  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2429  small GTP-binding protein  26.67 
 
 
369 aa  51.6  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50671  predicted protein  28.89 
 
 
407 aa  51.2  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  25.32 
 
 
405 aa  51.2  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05575  GTP-binding protein  24.16 
 
 
333 aa  51.2  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1582  GTPase ObgE  27.1 
 
 
357 aa  51.2  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>