More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_3188 on replicon NC_009355
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009355  OSTLU_3188  predicted protein  100 
 
 
290 aa  594  1e-169  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43105  predicted protein  38.97 
 
 
455 aa  203  3e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0093  small GTP-binding protein  32.72 
 
 
317 aa  158  8e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.333043  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2208  small GTP-binding protein  33.9 
 
 
345 aa  145  1e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.739861 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0641  hypothetical protein  29.72 
 
 
340 aa  139  7e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2010  small GTP-binding protein  30.88 
 
 
348 aa  135  5e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2164  GTP-binding protein  31.39 
 
 
333 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.311194  normal  0.912911 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1571  GTP-binding protein HSR1-related protein  31.65 
 
 
331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1159  GTP-binding protein HSR1-related  31.02 
 
 
322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3556  GTP-binding protein HSR1-related protein  31.75 
 
 
329 aa  133  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1688  small GTP-binding protein  32.72 
 
 
332 aa  132  5e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2297  GTP-binding protein HSR1-related  30.93 
 
 
328 aa  132  6.999999999999999e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.754733 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0918  small GTP-binding protein  30.9 
 
 
351 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.259421  normal  0.0321262 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0752  small GTP-binding protein  31.42 
 
 
344 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.741374 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75790  predicted protein  27.74 
 
 
640 aa  129  5.0000000000000004e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.113893  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1923  small GTP-binding protein  30.26 
 
 
326 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1755  small GTP-binding protein  28.93 
 
 
346 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0801  small GTP-binding protein  28.88 
 
 
338 aa  124  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.911521  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0148  small GTP-binding protein  28.16 
 
 
346 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0331774  normal  0.033756 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0708  small GTP-binding protein  28.57 
 
 
346 aa  122  5e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1887  GTP-binding protein  31.15 
 
 
356 aa  122  6e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0020  small GTP-binding protein  26.71 
 
 
347 aa  122  6e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0391  small GTP-binding protein  31.14 
 
 
334 aa  122  8e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0546  GTP-binding protein HSR1-related  30.04 
 
 
329 aa  121  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2103  small GTP-binding protein  29.97 
 
 
330 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0267  nucleolar GTP-binding 1  30.53 
 
 
306 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.809465  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1306  small GTP-binding protein  29.26 
 
 
355 aa  118  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.294825  normal  0.393807 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1975  small GTP-binding protein  30.88 
 
 
331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35887  predicted protein  27.8 
 
 
664 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1570  small GTP-binding protein  28.07 
 
 
354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05865  nucleolar GTP-binding protein (Nog1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11510)  25.45 
 
 
656 aa  111  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.181849  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2933  GTP-binding protein, HSR1-related  26.95 
 
 
324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000336633  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01880  nucleolar GTP-binding protein 1, putative  26.37 
 
 
666 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30365  predicted protein  26.88 
 
 
677 aa  103  4e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.660335  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  38.6 
 
 
434 aa  72.8  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0929  GTP-binding protein Obg/CgtA  36.92 
 
 
426 aa  71.2  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0009475  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  36.92 
 
 
435 aa  67.8  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  36.92 
 
 
435 aa  68.2  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_2  GTP-binding protein, GTP1/OBG family  37.74 
 
 
424 aa  67.4  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0002  GTPase ObgE  37.74 
 
 
424 aa  67  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4144  GTP-binding protein Obg/CgtA  38.52 
 
 
368 aa  66.2  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0728  GTP-binding protein Obg/CgtA  37.21 
 
 
356 aa  66.2  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.199071 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  35.07 
 
 
439 aa  65.9  0.0000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0002  GTPase ObgE  36.79 
 
 
424 aa  65.5  0.0000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05980  GTP-binding protein Obg/CgtA  35.71 
 
 
464 aa  65.5  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00718326  decreased coverage  0.00000000000109453 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  34.43 
 
 
427 aa  64.3  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3455  GTPase ObgE  37.17 
 
 
513 aa  64.3  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382796  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0185  GTPase ObgE  39.45 
 
 
347 aa  63.2  0.000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0100  GTPase ObgE  37.1 
 
 
345 aa  63.2  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3577  GTP1/OBG domain-containing protein  34.88 
 
 
439 aa  62.4  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1650  GTP-binding protein Obg/CgtA  35.66 
 
 
439 aa  62.4  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2281  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.78 
 
 
505 aa  62  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523689  hitchhiker  0.000211996 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1624  GTPase ObgE  40.48 
 
 
519 aa  62  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.647176  normal  0.880816 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4265  GTP-binding protein Obg/CgtA  32.56 
 
 
454 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.256023  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0642  GTPase ObgE  33.33 
 
 
336 aa  61.2  0.00000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03048  GTPase involved in cell partioning and DNA repair  33.59 
 
 
390 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00301118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0524  GTP-binding protein Obg/CgtA  33.59 
 
 
390 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000179136  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0091  GTPase ObgE  40.45 
 
 
350 aa  60.5  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.333267  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02999  hypothetical protein  33.59 
 
 
390 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0026544  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11420  GTP-binding protein Obg/CgtA  37.63 
 
 
517 aa  60.8  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.32525  decreased coverage  0.000779693 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3587  GTPase ObgE  33.59 
 
 
390 aa  60.5  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000763921  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3472  GTPase ObgE  52.63 
 
 
363 aa  60.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.004996  normal  0.428622 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3668  GTPase ObgE  33.59 
 
 
390 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000139354  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3479  GTPase ObgE  33.59 
 
 
390 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000528393  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4505  GTPase ObgE  33.59 
 
 
390 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000250571  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3376  GTPase ObgE  33.59 
 
 
390 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000688776  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0312  GTP-binding protein Obg/CgtA  36.21 
 
 
432 aa  60.5  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0517  GTPase ObgE  33.59 
 
 
390 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000402809  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0504  GTP-binding protein Obg/CgtA  40 
 
 
368 aa  60.8  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3858  GTPase ObgE  33.61 
 
 
481 aa  60.1  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03729  GTPase ObgE  36.17 
 
 
392 aa  59.7  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10130  GTPase ObgE  40.48 
 
 
515 aa  59.7  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.398815  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0248  GTPase ObgE  30.94 
 
 
392 aa  59.7  0.00000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0758  GTPase ObgE  37.5 
 
 
476 aa  59.7  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.639245  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3479  GTPase ObgE  34.19 
 
 
481 aa  59.7  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.395045  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0676  GTPase ObgE  38.46 
 
 
347 aa  59.7  0.00000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13035  predicted protein  35.97 
 
 
305 aa  59.3  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0163002  normal  0.451283 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1475  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.76 
 
 
486 aa  59.3  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.754526  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2668  GTP-binding protein Obg/CgtA  33.59 
 
 
427 aa  58.9  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00700338  normal  0.373543 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0131  GTPase ObgE  39.33 
 
 
356 aa  58.9  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5258  GTPase ObgE  38.14 
 
 
541 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1650  GTPase ObgE  35.71 
 
 
509 aa  58.9  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420929  hitchhiker  0.000176178 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1414  GTPase ObgE  37.78 
 
 
369 aa  58.5  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3802  GTPase ObgE  32.69 
 
 
359 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18250  GTPase ObgE  36.56 
 
 
509 aa  58.9  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106834  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3944  GTPase ObgE  36.9 
 
 
480 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1505  GTPase ObgE  34.23 
 
 
504 aa  57.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00667966  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1618  GTPase ObgE  48.21 
 
 
563 aa  57.8  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.664599  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0469  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.67 
 
 
327 aa  57.8  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0561  GTPase ObgE  31.82 
 
 
390 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00587502  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3493  GTPase ObgE  32.82 
 
 
390 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364177  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3491  GTPase ObgE  32.82 
 
 
390 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000240056  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3553  GTPase ObgE  32.46 
 
 
485 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3562  GTPase ObgE  32.82 
 
 
390 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.238363  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3619  GTPase ObgE  31.25 
 
 
392 aa  58.2  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000171752  normal  0.293815 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3660  GTPase ObgE  32.82 
 
 
390 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0449011  normal  0.0890894 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3548  GTPase ObgE  32.46 
 
 
485 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3476  GTPase ObgE  33.59 
 
 
391 aa  58.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000303711  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3621  GTPase ObgE  32.46 
 
 
485 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3514  GTPase ObgE  32.69 
 
 
342 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>