More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1306 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1306  small GTP-binding protein  100 
 
 		 355 aa  721    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.294825  normal  0.393807 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2208  small GTP-binding protein  46.96 
 
 		 345 aa  328  6e-89  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.739861 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2010  small GTP-binding protein  48.17 
 
 		 348 aa  324  1e-87  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0918  small GTP-binding protein  48.01 
 
 		 351 aa  324  2e-87  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.259421  normal  0.0321262 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0752  small GTP-binding protein  46.65 
 
 		 344 aa  322  8e-87  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.741374 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0093  small GTP-binding protein  41.61 
 
 		 317 aa  230  3e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.333043  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0391  small GTP-binding protein  35.67 
 
 		 334 aa  204  1e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30365  predicted protein  34.2 
 
 		 677 aa  184  2.0000000000000003e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.660335  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1755  small GTP-binding protein  33.55 
 
 		 346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0708  small GTP-binding protein  35.21 
 
 		 346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0267  nucleolar GTP-binding 1  38 
 
 		 306 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.809465  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0148  small GTP-binding protein  33.77 
 
 		 346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0331774  normal  0.033756 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0020  small GTP-binding protein  34.25 
 
 		 347 aa  180  4e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0801  small GTP-binding protein  37.3 
 
 		 338 aa  179  9e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.911521  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1887  GTP-binding protein  40.83 
 
 		 356 aa  177  3e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0641  hypothetical protein  34.83 
 
 		 340 aa  172  9e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1571  GTP-binding protein HSR1-related protein  33.79 
 
 		 331 aa  170  4e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1159  GTP-binding protein HSR1-related  35.54 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3556  GTP-binding protein HSR1-related protein  34.62 
 
 		 329 aa  168  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2164  GTP-binding protein  37.54 
 
 		 333 aa  167  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.311194  normal  0.912911 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75790  predicted protein  30.79 
 
 		 640 aa  167  2e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.113893  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2297  GTP-binding protein HSR1-related  35.42 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.754733 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1923  small GTP-binding protein  32.65 
 
 		 326 aa  167  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05865  nucleolar GTP-binding protein (Nog1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11510)  30.74 
 
 		 656 aa  167  4e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.181849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35887  predicted protein  32.26 
 
 		 664 aa  166  5e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1570  small GTP-binding protein  38.2 
 
 		 354 aa  166  8e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0546  GTP-binding protein HSR1-related  33.33 
 
 		 329 aa  160  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2103  small GTP-binding protein  33.46 
 
 		 330 aa  159  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01880  nucleolar GTP-binding protein 1, putative  32.33 
 
 		 666 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1688  small GTP-binding protein  35.29 
 
 		 332 aa  153  5e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2933  GTP-binding protein, HSR1-related  32.34 
 
 		 324 aa  146  5e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000336633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1975  small GTP-binding protein  32.17 
 
 		 331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_3188  predicted protein  29.26 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43105  predicted protein  28.62 
 
 		 455 aa  110  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0847  GTP1/OBG domain-containing protein  34.12 
 
 		 358 aa  71.6  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  35.19 
 
 		 353 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2218  GTPase ObgE  31.74 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4091  GTPase ObgE  33.53 
 
 		 335 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001671  GTP-binding protein Obg  33.53 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000343056  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2855  GTPase ObgE  35.12 
 
 		 395 aa  67  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000349951  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00015  GTPase ObgE  30.95 
 
 		 350 aa  67  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178881  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  32.52 
 
 		 337 aa  67  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.18 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0214  GTPase ObgE  34.15 
 
 		 370 aa  66.6  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301302 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2285  GTPase ObgE  33.33 
 
 		 338 aa  66.2  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.397881  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1121  GTPase ObgE  32.12 
 
 		 350 aa  66.2  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.261529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0196  GTPase ObgE  37.04 
 
 		 362 aa  66.2  0.0000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825185  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0676  GTPase ObgE  30 
 
 		 347 aa  66.2  0.0000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3660  GTPase ObgE  33.14 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0449011  normal  0.0890894 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  32.93 
 
 		 370 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  32.12 
 
 		 365 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0866  GTPase ObgE  30.91 
 
 		 350 aa  65.5  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3598  GTPase ObgE  33.14 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3491  GTPase ObgE  33.14 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000240056  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3562  GTPase ObgE  33.14 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.238363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  32.53 
 
 		 349 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3493  GTPase ObgE  33.14 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3447  GTPase ObgE  32.93 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179081  hitchhiker  0.00548922 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  31.1 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  33.33 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1475  GTP-binding protein Obg/CgtA  32 
 
 		 486 aa  65.1  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.754526  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  32.12 
 
 		 365 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  31.1 
 
 		 364 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00802  GTPase ObgE  32.95 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  31.1 
 
 		 364 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  31.55 
 
 		 369 aa  64.3  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  35.46 
 
 		 417 aa  64.7  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4505  GTPase ObgE  32.18 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000250571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  27.98 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  30.77 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1525  GTPase ObgE  28.86 
 
 		 357 aa  63.5  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5484  GTP-binding protein Obg/CgtA  33.59 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.278538 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  32.73 
 
 		 338 aa  63.5  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  31.52 
 
 		 372 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  31.52 
 
 		 372 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  31.52 
 
 		 372 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  31.52 
 
 		 372 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  31.52 
 
 		 372 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  31.52 
 
 		 372 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0101  GTPase ObgE  32.32 
 
 		 370 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113103  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  31.52 
 
 		 372 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1590  GTP-binding protein Obg/CgtA  32.53 
 
 		 491 aa  62.8  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00877411  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0524  GTP-binding protein Obg/CgtA  31.61 
 
 		 390 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000179136  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0553  GTPase ObgE  32.32 
 
 		 370 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000106913  normal  0.0178049 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0583  GTPase ObgE  32.32 
 
 		 370 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0349123  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  33.74 
 
 		 434 aa  62.8  0.000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1837  GTP-binding protein Obg/CgtA  27.65 
 
 		 435 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1817  GTPase ObgE  31.71 
 
 		 354 aa  62.8  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.389419  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  31.52 
 
 		 372 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12467  GTPase ObgE  33.52 
 
 		 479 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.642368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  29.82 
 
 		 346 aa  62.4  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  32.34 
 
 		 337 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0363  GTPase ObgE  30.81 
 
 		 392 aa  62.4  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0223104  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2056  GTPase ObgE  28.96 
 
 		 366 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.520405  normal  0.906933 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  31.1 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20124  predicted protein  29.86 
 
 		 400 aa  62  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.902407  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3455  GTPase ObgE  30.86 
 
 		 513 aa  62  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  32.93 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0772  GTPase ObgE  30.18 
 
 		 357 aa  62  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  33.33 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>