More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1755 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0148  small GTP-binding protein  96.82 
 
 
346 aa  674    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0331774  normal  0.033756 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0708  small GTP-binding protein  95.38 
 
 
346 aa  672    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1755  small GTP-binding protein  100 
 
 
346 aa  698    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0020  small GTP-binding protein  84.06 
 
 
347 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0801  small GTP-binding protein  69.37 
 
 
338 aa  431  1e-120  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.911521  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0093  small GTP-binding protein  43.94 
 
 
317 aa  253  5.000000000000001e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.333043  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2164  GTP-binding protein  39.22 
 
 
333 aa  249  7e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.311194  normal  0.912911 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2103  small GTP-binding protein  38.19 
 
 
330 aa  225  9e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1887  GTP-binding protein  39.65 
 
 
356 aa  222  7e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1923  small GTP-binding protein  36.7 
 
 
326 aa  216  4e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1570  small GTP-binding protein  36.21 
 
 
354 aa  209  6e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0391  small GTP-binding protein  35.62 
 
 
334 aa  208  1e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0641  hypothetical protein  33.63 
 
 
340 aa  207  2e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0267  nucleolar GTP-binding 1  33.13 
 
 
306 aa  205  9e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.809465  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1159  GTP-binding protein HSR1-related  36.64 
 
 
322 aa  204  1e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2297  GTP-binding protein HSR1-related  36.77 
 
 
328 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.754733 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0546  GTP-binding protein HSR1-related  34.55 
 
 
329 aa  200  3e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3556  GTP-binding protein HSR1-related protein  35.83 
 
 
329 aa  199  9e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2933  GTP-binding protein, HSR1-related  37.27 
 
 
324 aa  197  3e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000336633  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1571  GTP-binding protein HSR1-related protein  36.21 
 
 
331 aa  192  6e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0918  small GTP-binding protein  33.12 
 
 
351 aa  185  8e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.259421  normal  0.0321262 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2010  small GTP-binding protein  33.03 
 
 
348 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35887  predicted protein  27.95 
 
 
664 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2208  small GTP-binding protein  31.8 
 
 
345 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.739861 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75790  predicted protein  29.59 
 
 
640 aa  179  8e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.113893  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1306  small GTP-binding protein  34.72 
 
 
355 aa  177  2e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.294825  normal  0.393807 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0752  small GTP-binding protein  31.8 
 
 
344 aa  176  8e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.741374 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05865  nucleolar GTP-binding protein (Nog1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11510)  28.4 
 
 
656 aa  175  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.181849  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30365  predicted protein  29.12 
 
 
677 aa  167  2.9999999999999998e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.660335  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1975  small GTP-binding protein  35.56 
 
 
331 aa  163  4.0000000000000004e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01880  nucleolar GTP-binding protein 1, putative  30.27 
 
 
666 aa  162  9e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1688  small GTP-binding protein  32.07 
 
 
332 aa  145  8.000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_3188  predicted protein  28.93 
 
 
290 aa  124  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43105  predicted protein  25.25 
 
 
455 aa  121  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0676  GTPase ObgE  31.34 
 
 
347 aa  73.6  0.000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  31.16 
 
 
427 aa  71.6  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.81 
 
 
415 aa  70.1  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0929  GTP-binding protein Obg/CgtA  27.46 
 
 
426 aa  66.6  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0009475  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  32.02 
 
 
423 aa  66.6  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  29.65 
 
 
426 aa  66.2  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1945  small GTP-binding protein  37.61 
 
 
368 aa  65.9  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0250  small GTP-binding protein  36.19 
 
 
370 aa  65.9  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.829825  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1194  ferrous iron transport protein B  30.34 
 
 
714 aa  65.1  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  29.38 
 
 
425 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2429  small GTP-binding protein  32.62 
 
 
369 aa  64.3  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15330  cytidylate kinase  34.3 
 
 
755 aa  63.5  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.201651  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2218  GTPase ObgE  26.55 
 
 
433 aa  63.5  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  28.71 
 
 
428 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1549  GTP-binding protein Obg/CgtA  27.75 
 
 
463 aa  63.2  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0418  GTPase ObgE  28.64 
 
 
333 aa  63.2  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  27.23 
 
 
437 aa  62.8  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  28.71 
 
 
428 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  29.35 
 
 
427 aa  63.2  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  28.71 
 
 
428 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3577  GTP1/OBG domain-containing protein  27.8 
 
 
439 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  29.53 
 
 
428 aa  62.8  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  29.53 
 
 
428 aa  62.8  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  29.53 
 
 
428 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  29.53 
 
 
428 aa  62.8  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  29.53 
 
 
428 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1650  GTP-binding protein Obg/CgtA  26.87 
 
 
439 aa  62.8  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1181  small GTP-binding protein  35.24 
 
 
370 aa  62.8  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  29.02 
 
 
428 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4334  GTPase ObgE  31.9 
 
 
424 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00027074  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3380  GTPase ObgE  29.67 
 
 
337 aa  62.4  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0728  GTP-binding protein Obg/CgtA  29.24 
 
 
356 aa  62.4  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.199071 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  29.02 
 
 
428 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2226  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.29 
 
 
416 aa  62  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00929863  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  31.4 
 
 
337 aa  61.6  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0532  GTPase ObgE  29.95 
 
 
433 aa  60.8  0.00000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0114887  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1726  GTPase ObgE  29.03 
 
 
376 aa  60.5  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0185  GTPase ObgE  29.41 
 
 
347 aa  60.5  0.00000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12990  ferrous iron transporter FeoB  31.58 
 
 
824 aa  60.1  0.00000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0255803  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1837  GTP-binding protein Obg/CgtA  29.31 
 
 
435 aa  60.5  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5095  GTP-binding protein Obg/CgtA  32.35 
 
 
334 aa  60.1  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0489  GTPase ObgE  27.55 
 
 
332 aa  60.1  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  27.47 
 
 
417 aa  60.1  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4265  GTP-binding protein Obg/CgtA  26.6 
 
 
454 aa  59.7  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.256023  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3459  ferrous iron transport protein B  30.12 
 
 
715 aa  59.3  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000760098  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4091  GTPase ObgE  27.27 
 
 
335 aa  59.3  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1694  GTPase ObgE  28.65 
 
 
437 aa  58.9  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1624  GTPase ObgE  25.82 
 
 
519 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.647176  normal  0.880816 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1536  GTPase ObgE  26.02 
 
 
344 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0782  small GTP-binding protein  35.24 
 
 
371 aa  58.5  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  29.34 
 
 
301 aa  58.2  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  27.72 
 
 
428 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4144  GTP-binding protein Obg/CgtA  27.57 
 
 
368 aa  58.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  28.57 
 
 
424 aa  58.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3895  GTPase ObgE  27.17 
 
 
345 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1246  GTP-binding proten HflX  28.04 
 
 
356 aa  57.4  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0574  GTP-binding protein  25.76 
 
 
364 aa  57.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.437415  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1538  GTP-binding protein EngA  30.11 
 
 
516 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000734498 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0871  small GTP-binding protein  27.38 
 
 
367 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.548847  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4208  GTP-binding protein, HSR1-related  30.84 
 
 
574 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05575  GTP-binding protein  27.41 
 
 
333 aa  57.8  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  27.46 
 
 
327 aa  57.4  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0208  GTP-binding protein Era  31.52 
 
 
297 aa  57.4  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0837  GTP-binding protein Obg/CgtA  29.03 
 
 
359 aa  57.4  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3835  GTP-binding protein Obg/CgtA  28.98 
 
 
346 aa  57  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_002936  DET0002  GTPase ObgE  31.5 
 
 
424 aa  57  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>