183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_30365 on replicon NC_011690
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011690  PHATRDRAFT_30365  predicted protein  100 
 
 
677 aa  1402    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.660335  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35887  predicted protein  49.86 
 
 
664 aa  642    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01880  nucleolar GTP-binding protein 1, putative  47.81 
 
 
666 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05865  nucleolar GTP-binding protein (Nog1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11510)  45.69 
 
 
656 aa  543  1e-153  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.181849  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75790  predicted protein  42.92 
 
 
640 aa  529  1e-149  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.113893  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1306  small GTP-binding protein  35.49 
 
 
355 aa  182  1e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.294825  normal  0.393807 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0391  small GTP-binding protein  34.72 
 
 
334 aa  179  2e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0752  small GTP-binding protein  33.44 
 
 
344 aa  177  8e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.741374 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0918  small GTP-binding protein  34.69 
 
 
351 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.259421  normal  0.0321262 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2208  small GTP-binding protein  35.13 
 
 
345 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.739861 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0093  small GTP-binding protein  34.48 
 
 
317 aa  172  2e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.333043  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1159  GTP-binding protein HSR1-related  31.74 
 
 
322 aa  170  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2164  GTP-binding protein  33 
 
 
333 aa  169  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.311194  normal  0.912911 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0267  nucleolar GTP-binding 1  37.29 
 
 
306 aa  169  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.809465  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2010  small GTP-binding protein  33.02 
 
 
348 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2297  GTP-binding protein HSR1-related  29.91 
 
 
328 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.754733 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1755  small GTP-binding protein  29.12 
 
 
346 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0148  small GTP-binding protein  29.41 
 
 
346 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0331774  normal  0.033756 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3556  GTP-binding protein HSR1-related protein  30.27 
 
 
329 aa  166  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0708  small GTP-binding protein  29.12 
 
 
346 aa  165  3e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0641  hypothetical protein  31.21 
 
 
340 aa  163  1e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1571  GTP-binding protein HSR1-related protein  30.34 
 
 
331 aa  162  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0020  small GTP-binding protein  29.28 
 
 
347 aa  158  4e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1887  GTP-binding protein  34.14 
 
 
356 aa  155  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0801  small GTP-binding protein  32.86 
 
 
338 aa  155  2e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.911521  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2103  small GTP-binding protein  32.29 
 
 
330 aa  154  4e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1923  small GTP-binding protein  30.32 
 
 
326 aa  153  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0546  GTP-binding protein HSR1-related  30.54 
 
 
329 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1688  small GTP-binding protein  29.25 
 
 
332 aa  146  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1570  small GTP-binding protein  29.12 
 
 
354 aa  145  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2933  GTP-binding protein, HSR1-related  30.58 
 
 
324 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000336633  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1975  small GTP-binding protein  31.6 
 
 
331 aa  139  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_3188  predicted protein  26.88 
 
 
290 aa  102  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43105  predicted protein  28.63 
 
 
455 aa  90.9  8e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1541  small GTP-binding protein  34.09 
 
 
363 aa  62  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0754  small GTP-binding protein  45.61 
 
 
369 aa  60.8  0.00000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0871  small GTP-binding protein  45.61 
 
 
367 aa  60.5  0.00000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.548847  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2546  small GTP-binding protein  42.11 
 
 
370 aa  59.7  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.120198  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1230  small GTP-binding protein  43.86 
 
 
369 aa  59.7  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0135  small GTP-binding protein  43.86 
 
 
369 aa  59.7  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0688  small GTP-binding protein  43.86 
 
 
369 aa  60.1  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.629301  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0699  GTPase ObgE  30.54 
 
 
335 aa  57.4  0.0000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.244108  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02790  cytoplasm protein, putative  33.72 
 
 
368 aa  55.8  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0463275  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  25.14 
 
 
343 aa  56.6  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1400  hypothetical protein  38.6 
 
 
370 aa  56.2  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  29.59 
 
 
434 aa  55.5  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  30.47 
 
 
338 aa  54.7  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2789  small GTP-binding protein  25.27 
 
 
351 aa  54.7  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2103  GTP-binding protein EngA  30.1 
 
 
441 aa  54.3  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  25 
 
 
415 aa  53.9  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  27.54 
 
 
680 aa  53.1  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  31.25 
 
 
338 aa  53.5  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2226  GTP-binding protein Obg/CgtA  27.87 
 
 
416 aa  53.9  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00929863  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1705  GTPase ObgE  26.97 
 
 
348 aa  53.5  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.074389  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1504  GTPase ObgE  30.15 
 
 
405 aa  52.8  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0574  GTP-binding protein  28.83 
 
 
364 aa  53.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.437415  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0684  small GTP-binding protein  38.6 
 
 
369 aa  53.1  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  29.92 
 
 
434 aa  52.8  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1846  GTP1/OBG domain-containing protein  30.72 
 
 
346 aa  52.8  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  22.57 
 
 
348 aa  52.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1683  GTPase ObgE  30.15 
 
 
405 aa  52.4  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0638359  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  27.11 
 
 
435 aa  52.4  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02244  GTP binding protein (Gtp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06770)  38.18 
 
 
367 aa  52  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20124  predicted protein  31.76 
 
 
400 aa  52  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.902407  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2218  GTPase ObgE  22.67 
 
 
433 aa  52  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1699  small GTP-binding protein  36.21 
 
 
371 aa  51.6  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.473033  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0250  small GTP-binding protein  28.72 
 
 
370 aa  51.6  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.829825  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1848  small GTP-binding protein  36.84 
 
 
371 aa  51.6  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0895  GTP-binding protein Obg/CgtA  27.84 
 
 
453 aa  51.2  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000142797  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4236  GTP-binding protein Obg/CgtA  26.71 
 
 
396 aa  50.8  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000643018  hitchhiker  0.00000182471 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  28.92 
 
 
405 aa  50.8  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2283  GTPase ObgE  27.53 
 
 
344 aa  50.8  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.79982  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2203  ribosome-associated GTPase EngA  36.64 
 
 
567 aa  50.4  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  31.54 
 
 
338 aa  50.4  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03250  cytoplasm protein, putative  25.32 
 
 
367 aa  50.4  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.594558  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1945  small GTP-binding protein  23.15 
 
 
368 aa  50.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1240  GTPase ObgE  25.95 
 
 
391 aa  50.4  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155825  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0782  small GTP-binding protein  28.57 
 
 
371 aa  50.1  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81735  predicted protein  37.93 
 
 
367 aa  50.1  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  30 
 
 
338 aa  50.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1601  GTPase ObgE  29.65 
 
 
402 aa  50.4  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000135042  hitchhiker  0.000110073 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1498  GTP-binding protein EngA  27.06 
 
 
462 aa  49.3  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0627  small GTP-binding protein domain-containing protein  33.33 
 
 
370 aa  49.3  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0262779  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  31.3 
 
 
303 aa  49.3  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  28.65 
 
 
338 aa  49.7  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50671  predicted protein  38.6 
 
 
407 aa  49.7  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  25.9 
 
 
435 aa  49.3  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1748  GTPase ObgE  26.7 
 
 
382 aa  49.3  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0657373  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1145  GTPase ObgE  24.06 
 
 
352 aa  49.3  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  30.77 
 
 
338 aa  48.9  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42420  predicted protein  38.89 
 
 
368 aa  48.9  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.257266  normal  0.210698 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1181  small GTP-binding protein  28.57 
 
 
370 aa  48.9  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3895  GTPase ObgE  25.28 
 
 
345 aa  48.9  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1485  GTP-binding protein EngA  26.47 
 
 
462 aa  48.5  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2632  small GTP-binding protein  30.08 
 
 
434 aa  48.5  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  25.37 
 
 
353 aa  48.5  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0638  small GTP-binding protein  23.32 
 
 
328 aa  48.5  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1559  TGS domain-containing protein  35.85 
 
 
311 aa  48.1  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.397282  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3419  GTPase ObgE  27.93 
 
 
345 aa  48.1  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2429  small GTP-binding protein  25.53 
 
 
369 aa  47.8  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>