More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0483 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0483  small GTP-binding protein  100 
 
 		 580 aa  1126    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.742862 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1325  small GTP-binding protein  67.38 
 
 		 571 aa  697    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.936216 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0262  small GTP-binding protein  51.09 
 
 		 570 aa  499  1e-140  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0360  small GTP-binding protein  51.29 
 
 		 568 aa  491  1e-137  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.700124  normal  0.27234 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2878  ferrous iron transport protein B  28.69 
 
 		 606 aa  206  9e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0506695 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2975  ferrous iron transport protein B  29.27 
 
 		 626 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.949455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1111  ferrous iron transport protein B  29.11 
 
 		 626 aa  194  5e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1631  ferrous iron transport protein B  26.51 
 
 		 587 aa  193  7e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000698683  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1913  ferrous iron transport protein B  26.6 
 
 		 587 aa  192  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000339722  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1058  ferrous iron transport protein B  28.39 
 
 		 626 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5116  ferrous iron transport protein B  28.16 
 
 		 626 aa  178  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0954  ferrous iron transport protein B  28.27 
 
 		 626 aa  176  8e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1860  ferrous iron transport protein B  30.51 
 
 		 617 aa  172  1e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5890  Fe2+ transport system protein B  27.8 
 
 		 620 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3948  ferrous iron transport protein B  28.89 
 
 		 621 aa  169  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.648078 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4061  ferrous iron transport protein B  28.89 
 
 		 621 aa  169  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00098  ferrous iron transport protein B  29.56 
 
 		 621 aa  168  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.069629  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0251  ferrous IRON transport B transmembrane protein  27.23 
 
 		 621 aa  166  9e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.563283  normal  0.119264 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1804  ferrous iron transport protein B  30.39 
 
 		 621 aa  166  9e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.529813  normal  0.0419932 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1922  ferrous iron transport protein B  30.78 
 
 		 617 aa  164  3e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0623  ferrous iron transport protein B  26.65 
 
 		 637 aa  164  4.0000000000000004e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.356093  normal  0.228705 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6110  ferrous iron transport protein B  28.54 
 
 		 625 aa  163  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.218757  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2809  ferrous iron transport protein B  27.27 
 
 		 597 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.123024 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1329  ferrous iron transport protein B  26.66 
 
 		 637 aa  161  4e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1597  GTP-binding protein HSR1-related  29.87 
 
 		 617 aa  160  5e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5429  ferrous iron transport B domain-containing protein  28.3 
 
 		 617 aa  160  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.895542  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0064  ferrous iron transport protein B  28.23 
 
 		 628 aa  159  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.956131  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2176  ferrous iron transport protein B  28.48 
 
 		 647 aa  158  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2434  ferrous iron transport protein B  28.21 
 
 		 633 aa  157  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2451  ferrous iron transport protein B  29.3 
 
 		 621 aa  157  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1161  ferrous iron transport protein B  28.5 
 
 		 632 aa  156  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.233706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4039  ferrous iron transport protein B  26.92 
 
 		 625 aa  154  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129654 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1709  ferrous iron transport protein B  27.5 
 
 		 618 aa  152  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0676  ferrous iron transport protein B  25.67 
 
 		 636 aa  150  4e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1078  ferrous iron transport protein B  26.17 
 
 		 665 aa  150  8e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.996842  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2987  ferrous iron transport protein B  27.14 
 
 		 619 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0512994 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3383  ferrous iron transport protein B  26.57 
 
 		 683 aa  148  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.378196 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1938  ferrous iron transport protein B  28.27 
 
 		 647 aa  145  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.31907  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0970  ferrous iron transport protein B  29.49 
 
 		 666 aa  145  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0839864 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1443  ferrous iron transport protein B  28.57 
 
 		 631 aa  144  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0983772  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47490  ferrous iron transport protein B  28.48 
 
 		 615 aa  142  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2849  ferrous iron transport protein B  27.42 
 
 		 618 aa  141  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1343  ferrous iron transport protein B  29.12 
 
 		 662 aa  140  8.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.547756  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1508  ferrous iron transport protein B  29.1 
 
 		 665 aa  139  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.225021  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2658  ferrous iron transport protein B  29.71 
 
 		 664 aa  137  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1097  ferrous iron transport protein B  31.49 
 
 		 595 aa  137  5e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0434  ferrous iron transport protein B  26.33 
 
 		 665 aa  134  3.9999999999999996e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3524  ferrous iron transport protein B  27.45 
 
 		 697 aa  134  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000134401  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  24.01 
 
 		 631 aa  133  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  26.34 
 
 		 631 aa  130  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  27.69 
 
 		 662 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  27.69 
 
 		 662 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  27.69 
 
 		 662 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  27.69 
 
 		 662 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1951  ferrous iron transport protein B  29.69 
 
 		 680 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0016959  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  27.38 
 
 		 662 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1140  ferrous iron transport protein B  27.9 
 
 		 680 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000225033  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4947  ferrous iron transport protein B  27.38 
 
 		 662 aa  128  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  27.76 
 
 		 662 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0890  ferrous iron transport protein B  29.88 
 
 		 684 aa  128  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4932  ferrous iron transport protein B  27.76 
 
 		 662 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4642  ferrous iron transport protein B  27.44 
 
 		 662 aa  127  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0307  ferrous iron transport protein B  27.76 
 
 		 662 aa  127  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2325  ferrous iron transport protein B  29.83 
 
 		 848 aa  127  7e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16120  ferrous iron transporter FeoB  28.29 
 
 		 785 aa  125  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000453744 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2126  ferrous iron transport protein B  27.86 
 
 		 664 aa  125  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1139  small GTP-binding protein  27.84 
 
 		 610 aa  124  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0779  ferrous iron transport protein B  28.36 
 
 		 688 aa  124  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328587  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0895  ferrous iron transport protein B  29.64 
 
 		 669 aa  124  4e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00236216  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0873  ferrous iron transport protein B  29.64 
 
 		 667 aa  124  5e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101727  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2626  ferrous iron transport protein B  25.72 
 
 		 664 aa  124  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.51649  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2572  ferrous iron transport protein B  25.72 
 
 		 664 aa  124  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0292  ferrous iron transport protein B  26.65 
 
 		 784 aa  123  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000454012  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2325  ferrous iron transport protein B  27.43 
 
 		 666 aa  123  8e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.907395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3474  ferrous iron transport protein B  26.46 
 
 		 662 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0654  ferrous iron transport protein B  25 
 
 		 693 aa  121  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  25.59 
 
 		 669 aa  120  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0543  ferrous iron transport protein B  26.3 
 
 		 669 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00422143  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1997  small GTP-binding protein  25.33 
 
 		 607 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0191527  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0850  ferrous iron transport protein B  28.73 
 
 		 695 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0239  ferrous iron transport protein B  27 
 
 		 816 aa  117  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1959  ferrous iron transport protein B  27.23 
 
 		 816 aa  117  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0555  ferrous iron transport B domain-containing protein  32.77 
 
 		 577 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0901  ferrous iron transport protein B  29.96 
 
 		 708 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000608812  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0259  ferrous iron transport protein B  28.43 
 
 		 628 aa  114  4.0000000000000004e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00038951  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1739  ferrous iron transport protein B  29.6 
 
 		 646 aa  114  5e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00069018  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  29.18 
 
 		 676 aa  113  7.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  24.8 
 
 		 669 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0344  ferrous iron transport protein B  24.23 
 
 		 724 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00337716  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3293  ferrous iron transport protein B  32.56 
 
 		 741 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.608312  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2157  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.15 
 
 		 571 aa  112  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0321  ferrous iron transport protein B  28.01 
 
 		 751 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.397467  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1452  ferrous iron transport protein B  28.53 
 
 		 665 aa  109  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.789379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3827  ferrous iron transport protein B  22.07 
 
 		 700 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.792233 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56680  ferrous iron transport protein B  28.35 
 
 		 766 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0976  ferrous iron transport protein B  28.61 
 
 		 676 aa  108  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00114707  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3875  ferrous iron transport protein B  28.76 
 
 		 772 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4105  ferrous iron transport protein B  30.68 
 
 		 738 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281443  normal  0.296674 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3822  ferrous iron transport protein B  26.28 
 
 		 772 aa  108  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.848053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3746  ferrous iron transport protein B  29.93 
 
 		 771 aa  108  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>