More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1329 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00098  ferrous iron transport protein B  54.39 
 
 		 621 aa  644    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.069629  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4061  ferrous iron transport protein B  57.07 
 
 		 621 aa  656    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0251  ferrous IRON transport B transmembrane protein  56.56 
 
 		 621 aa  660    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.563283  normal  0.119264 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2176  ferrous iron transport protein B  58.6 
 
 		 647 aa  689    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1329  ferrous iron transport protein B  100 
 
 		 637 aa  1275    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5429  ferrous iron transport B domain-containing protein  57.1 
 
 		 617 aa  637    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.895542  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1804  ferrous iron transport protein B  55.22 
 
 		 621 aa  657    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.529813  normal  0.0419932 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1443  ferrous iron transport protein B  60.74 
 
 		 631 aa  676    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0983772  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0623  ferrous iron transport protein B  90.74 
 
 		 637 aa  1148    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.356093  normal  0.228705 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0064  ferrous iron transport protein B  57.89 
 
 		 628 aa  645    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.956131  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2434  ferrous iron transport protein B  58.48 
 
 		 633 aa  700    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5890  Fe2+ transport system protein B  58.55 
 
 		 620 aa  694    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1161  ferrous iron transport protein B  59.65 
 
 		 632 aa  685    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.233706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1471  transport protein B  59.35 
 
 		 629 aa  679    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3948  ferrous iron transport protein B  57.07 
 
 		 621 aa  656    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.648078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4039  ferrous iron transport protein B  54.19 
 
 		 625 aa  626  1e-178  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129654 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1860  ferrous iron transport protein B  54.86 
 
 		 617 aa  622  1e-177  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1922  ferrous iron transport protein B  55.02 
 
 		 617 aa  619  1e-176  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2975  ferrous iron transport protein B  51.27 
 
 		 626 aa  612  9.999999999999999e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.949455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1111  ferrous iron transport protein B  51.27 
 
 		 626 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2451  ferrous iron transport protein B  52.46 
 
 		 621 aa  607  9.999999999999999e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0954  ferrous iron transport protein B  51.49 
 
 		 626 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1058  ferrous iron transport protein B  51.36 
 
 		 626 aa  599  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2849  ferrous iron transport protein B  51.92 
 
 		 618 aa  598  1e-169  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5116  ferrous iron transport protein B  51.69 
 
 		 626 aa  589  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47490  ferrous iron transport protein B  50.55 
 
 		 615 aa  590  1e-167  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6110  ferrous iron transport protein B  52.08 
 
 		 625 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.218757  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2987  ferrous iron transport protein B  51.26 
 
 		 619 aa  564  1.0000000000000001e-159  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0512994 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0676  ferrous iron transport protein B  45.79 
 
 		 636 aa  538  1e-151  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2567  ferrous iron transport protein B  38.36 
 
 		 753 aa  474  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3827  ferrous iron transport protein B  36.69 
 
 		 700 aa  468  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.792233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0784  ferrous iron transport protein B  36.57 
 
 		 711 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3726  ferrous iron transport protein B  36.26 
 
 		 696 aa  437  1e-121  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1078  ferrous iron transport protein B  35.97 
 
 		 665 aa  421  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.996842  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1451  ferrous iron transport protein B  36.74 
 
 		 705 aa  414  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0248254  normal  0.0823674 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4234  ferrous iron transport protein B  34.26 
 
 		 722 aa  399  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.322995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2011  GTP-binding protein, HSR1-related  37.09 
 
 		 648 aa  397  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606318  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0962  ferrous iron transport protein B  36.76 
 
 		 699 aa  398  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03990  ferrous iron transport protein B-like protein  36.65 
 
 		 699 aa  390  1e-107  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.625523  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0779  ferrous iron transport protein B  35.32 
 
 		 688 aa  380  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328587  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2434  ferrous iron transport protein B  34.26 
 
 		 711 aa  380  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0984425  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2126  ferrous iron transport protein B  33.33 
 
 		 664 aa  377  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5086  ferrous iron transport protein B  36.45 
 
 		 712 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000565138  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1951  ferrous iron transport protein B  34.29 
 
 		 680 aa  378  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0016959  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2843  ferrous iron transport protein B  34.62 
 
 		 712 aa  373  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2626  ferrous iron transport protein B  34.44 
 
 		 664 aa  372  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.51649  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1929  ferrous iron transport protein B  33.38 
 
 		 712 aa  370  1e-101  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000762105  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2572  ferrous iron transport protein B  34.44 
 
 		 664 aa  372  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0108  ferrous iron transport protein B  33.56 
 
 		 712 aa  371  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1140  ferrous iron transport protein B  34.1 
 
 		 680 aa  369  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000225033  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0344  ferrous iron transport protein B  31.84 
 
 		 724 aa  365  2e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00337716  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1729  ferrous iron transport protein B  31.77 
 
 		 717 aa  361  2e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0580785 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2325  ferrous iron transport protein B  33.73 
 
 		 666 aa  360  5e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.907395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0970  ferrous iron transport protein B  33.33 
 
 		 666 aa  360  6e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0839864 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  34.68 
 
 		 631 aa  360  6e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1913  ferrous iron transport protein B  33.07 
 
 		 587 aa  359  7e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000339722  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0890  ferrous iron transport protein B  34.98 
 
 		 684 aa  359  9.999999999999999e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0882  ferrous iron transport protein B  32.1 
 
 		 720 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000109469  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1631  ferrous iron transport protein B  32.59 
 
 		 587 aa  358  1.9999999999999998e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000698683  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2464  ferrous iron transport protein B  32.82 
 
 		 712 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.967572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0012  ferrous iron transport protein B  32.32 
 
 		 717 aa  356  8.999999999999999e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00299021  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3474  ferrous iron transport protein B  32.66 
 
 		 662 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0307  ferrous iron transport protein B  33.38 
 
 		 662 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1583  ferrous iron transport protein B  32.3 
 
 		 698 aa  354  2.9999999999999997e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.983768  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4932  ferrous iron transport protein B  33.53 
 
 		 662 aa  353  4e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  31.4 
 
 		 669 aa  353  5e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1585  ferrous iron transport protein B  32.3 
 
 		 723 aa  352  8.999999999999999e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0104102  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  33.38 
 
 		 662 aa  352  1e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  33.24 
 
 		 662 aa  351  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  33.24 
 
 		 662 aa  351  2e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  32.8 
 
 		 662 aa  351  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  33.24 
 
 		 662 aa  351  2e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4642  ferrous iron transport protein B  33.38 
 
 		 662 aa  351  3e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  32.13 
 
 		 669 aa  350  3e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1452  ferrous iron transport protein B  35.05 
 
 		 665 aa  350  4e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.789379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2669  ferrous iron transport protein B  31.78 
 
 		 725 aa  349  8e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  33.09 
 
 		 662 aa  349  1e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1458  ferrous iron transport protein B  32.13 
 
 		 716 aa  348  1e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.137578  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0873  ferrous iron transport protein B  32.69 
 
 		 667 aa  348  3e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101727  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  33.38 
 
 		 676 aa  347  5e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2074  ferrous iron transport protein B  33.75 
 
 		 712 aa  346  7e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  34.84 
 
 		 631 aa  346  8e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4947  ferrous iron transport protein B  33.09 
 
 		 662 aa  346  1e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0095  ferrous iron transport protein B  33.67 
 
 		 676 aa  345  2e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0895  ferrous iron transport protein B  32.54 
 
 		 669 aa  345  2e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00236216  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0675  ferrous iron transport protein B  32.29 
 
 		 732 aa  345  2e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.183925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1709  ferrous iron transport protein B  36.01 
 
 		 618 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0856  hypothetical protein  34.87 
 
 		 649 aa  343  8e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.935712  normal  0.465758 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0316  ferrous iron transport protein B  31.61 
 
 		 725 aa  342  1e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000873753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2493  ferrous iron transport protein B  31.36 
 
 		 743 aa  342  2e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.9646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1973  ferrous iron transport protein B  30.85 
 
 		 718 aa  337  5e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0871  ferrous iron transport protein B  42.48 
 
 		 716 aa  336  9e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1508  ferrous iron transport protein B  31.73 
 
 		 665 aa  333  6e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.225021  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0193  Fe2+ transport system protein B  32.8 
 
 		 691 aa  331  3e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1761  ferrous iron transport protein B  30.42 
 
 		 711 aa  330  5.0000000000000004e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0618  ferrous iron transport protein B  31.26 
 
 		 721 aa  330  6e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0536695  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0966  ferrous iron transport protein B  32.8 
 
 		 669 aa  329  9e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0719  ferrous iron transport protein B  29.85 
 
 		 829 aa  326  7e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0311256  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1739  ferrous iron transport protein B  31.29 
 
 		 646 aa  325  2e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00069018  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0283  ferrous iron transport protein B  30.81 
 
 		 674 aa  325  2e-87  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>