More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5086 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0784  ferrous iron transport protein B  47.55 
 
 
711 aa  688    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1451  ferrous iron transport protein B  62.62 
 
 
705 aa  885    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0248254  normal  0.0823674 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3726  ferrous iron transport protein B  51.27 
 
 
696 aa  750    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5086  ferrous iron transport protein B  100 
 
 
712 aa  1456    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000565138  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3827  ferrous iron transport protein B  49.3 
 
 
700 aa  723    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.792233 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03990  ferrous iron transport protein B-like protein  47.42 
 
 
699 aa  629  1e-179  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.625523  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0962  ferrous iron transport protein B  46.37 
 
 
699 aa  615  1e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1078  ferrous iron transport protein B  42.8 
 
 
665 aa  555  1e-156  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.996842  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2567  ferrous iron transport protein B  41.02 
 
 
753 aa  538  1e-151  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0871  ferrous iron transport protein B  40.5 
 
 
716 aa  521  1e-146  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4234  ferrous iron transport protein B  37.03 
 
 
722 aa  466  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.322995  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2434  ferrous iron transport protein B  36.02 
 
 
633 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2451  ferrous iron transport protein B  38.55 
 
 
621 aa  440  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0623  ferrous iron transport protein B  36.78 
 
 
637 aa  435  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.356093  normal  0.228705 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2975  ferrous iron transport protein B  37.32 
 
 
626 aa  431  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.949455  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2698  ferrous iron transport protein B  34.31 
 
 
780 aa  431  1e-119  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.619661  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1329  ferrous iron transport protein B  36.45 
 
 
637 aa  428  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2176  ferrous iron transport protein B  35.64 
 
 
647 aa  427  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1161  ferrous iron transport protein B  36.07 
 
 
632 aa  428  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.233706  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47490  ferrous iron transport protein B  36.43 
 
 
615 aa  420  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1294  ferrous iron transport protein B  34.68 
 
 
844 aa  416  9.999999999999999e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4039  ferrous iron transport protein B  35.69 
 
 
625 aa  411  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129654 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0676  ferrous iron transport protein B  35.12 
 
 
636 aa  412  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2843  ferrous iron transport protein B  34.52 
 
 
712 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  34.06 
 
 
662 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  34.06 
 
 
662 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  34.2 
 
 
662 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0954  ferrous iron transport protein B  34.98 
 
 
626 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1804  ferrous iron transport protein B  35.83 
 
 
621 aa  400  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.529813  normal  0.0419932 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  33.93 
 
 
662 aa  397  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  33.79 
 
 
662 aa  396  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2626  ferrous iron transport protein B  34.67 
 
 
664 aa  394  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.51649  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2126  ferrous iron transport protein B  35.36 
 
 
664 aa  393  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  33.65 
 
 
662 aa  394  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4947  ferrous iron transport protein B  33.79 
 
 
662 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1929  ferrous iron transport protein B  33.33 
 
 
712 aa  392  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000762105  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0307  ferrous iron transport protein B  33.52 
 
 
662 aa  392  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0064  ferrous iron transport protein B  35.51 
 
 
628 aa  392  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.956131  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4932  ferrous iron transport protein B  33.93 
 
 
662 aa  394  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2572  ferrous iron transport protein B  34.67 
 
 
664 aa  394  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4642  ferrous iron transport protein B  33.65 
 
 
662 aa  395  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2434  ferrous iron transport protein B  33.51 
 
 
711 aa  392  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0984425  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1058  ferrous iron transport protein B  35.22 
 
 
626 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0344  ferrous iron transport protein B  32.49 
 
 
724 aa  391  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00337716  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0719  ferrous iron transport protein B  33.69 
 
 
829 aa  391  1e-107  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0311256  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2074  ferrous iron transport protein B  33.11 
 
 
712 aa  389  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0779  ferrous iron transport protein B  33.75 
 
 
688 aa  388  1e-106  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328587  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2213  ferrous iron transport protein B  34.43 
 
 
713 aa  385  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2464  ferrous iron transport protein B  33.15 
 
 
712 aa  384  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.967572  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5890  Fe2+ transport system protein B  35.03 
 
 
620 aa  385  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0675  ferrous iron transport protein B  33.64 
 
 
732 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.183925  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3474  ferrous iron transport protein B  33.06 
 
 
662 aa  382  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2658  ferrous iron transport protein B  34.86 
 
 
664 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0012  ferrous iron transport protein B  34.97 
 
 
717 aa  381  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00299021  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2325  ferrous iron transport protein B  34.55 
 
 
666 aa  377  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.907395  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4061  ferrous iron transport protein B  34.85 
 
 
621 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0316  ferrous iron transport protein B  33.24 
 
 
725 aa  378  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000873753  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0108  ferrous iron transport protein B  32.65 
 
 
712 aa  379  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3948  ferrous iron transport protein B  34.85 
 
 
621 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.648078 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1140  ferrous iron transport protein B  33.66 
 
 
680 aa  373  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000225033  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1015  ferrous iron transport protein B  33.46 
 
 
759 aa  372  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.913336 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0970  ferrous iron transport protein B  34.1 
 
 
666 aa  372  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0839864 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2669  ferrous iron transport protein B  32.08 
 
 
725 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  34.75 
 
 
676 aa  369  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1729  ferrous iron transport protein B  31.38 
 
 
717 aa  371  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0580785 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0441  ferrous iron transport protein B  31.25 
 
 
700 aa  370  1e-101  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1452  ferrous iron transport protein B  33.66 
 
 
665 aa  369  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.789379  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0283  ferrous iron transport protein B  32.91 
 
 
674 aa  366  1e-100  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2493  ferrous iron transport protein B  33.6 
 
 
743 aa  367  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.9646  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1922  ferrous iron transport protein B  34.34 
 
 
617 aa  365  1e-99  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0882  ferrous iron transport protein B  33.24 
 
 
720 aa  364  2e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000109469  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1585  ferrous iron transport protein B  35.08 
 
 
723 aa  365  2e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0104102  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5116  ferrous iron transport protein B  33.29 
 
 
626 aa  365  2e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  32.01 
 
 
669 aa  363  6e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1761  ferrous iron transport protein B  31.77 
 
 
711 aa  363  8e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1951  ferrous iron transport protein B  33.01 
 
 
680 aa  363  9e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0016959  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1508  ferrous iron transport protein B  33.1 
 
 
665 aa  362  1e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.225021  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  32.01 
 
 
669 aa  362  2e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0890  ferrous iron transport protein B  31.99 
 
 
684 aa  356  1e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1973  ferrous iron transport protein B  30.8 
 
 
718 aa  353  5e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1343  ferrous iron transport protein B  31.48 
 
 
662 aa  352  1e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.547756  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0856  hypothetical protein  35.27 
 
 
649 aa  352  2e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.935712  normal  0.465758 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1458  ferrous iron transport protein B  31.04 
 
 
716 aa  349  1e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.137578  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0095  ferrous iron transport protein B  33.52 
 
 
676 aa  348  2e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1709  ferrous iron transport protein B  33.01 
 
 
618 aa  348  2e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1622  ferrous iron transport protein B  33.24 
 
 
722 aa  346  7e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.782227  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0873  ferrous iron transport protein B  31.75 
 
 
667 aa  346  8e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101727  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0895  ferrous iron transport protein B  31.47 
 
 
669 aa  346  8.999999999999999e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00236216  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1088  ferrous iron transport protein B  31.18 
 
 
753 aa  344  2.9999999999999997e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000362942  hitchhiker  0.0000000000000163165 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0543  ferrous iron transport protein B  33.29 
 
 
669 aa  344  2.9999999999999997e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00422143  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3524  ferrous iron transport protein B  29.47 
 
 
697 aa  341  2.9999999999999998e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000134401  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00098  ferrous iron transport protein B  41.1 
 
 
621 aa  339  8e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.069629  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3459  ferrous iron transport protein B  31.32 
 
 
715 aa  339  8e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000760098  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0110  ferrous iron transport protein B  31.48 
 
 
668 aa  339  9.999999999999999e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0260348  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0292  ferrous iron transport protein B  31.79 
 
 
784 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000454012  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  32.54 
 
 
631 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3293  ferrous iron transport protein B  31.24 
 
 
741 aa  337  5e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.608312  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1583  ferrous iron transport protein B  30.46 
 
 
698 aa  337  5.999999999999999e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.983768  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1471  transport protein B  40.32 
 
 
629 aa  334  4e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3658  ferrous iron transport protein B  30.61 
 
 
741 aa  332  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>