More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2975 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_5116  ferrous iron transport protein B  70.93 
 
 
626 aa  875    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4039  ferrous iron transport protein B  66.13 
 
 
625 aa  797    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129654 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1443  ferrous iron transport protein B  59.29 
 
 
631 aa  679    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0983772  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0251  ferrous IRON transport B transmembrane protein  56.75 
 
 
621 aa  651    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.563283  normal  0.119264 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4061  ferrous iron transport protein B  57.4 
 
 
621 aa  652    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1804  ferrous iron transport protein B  53.71 
 
 
621 aa  638    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.529813  normal  0.0419932 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5429  ferrous iron transport B domain-containing protein  57.1 
 
 
617 aa  640    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.895542  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2975  ferrous iron transport protein B  100 
 
 
626 aa  1250    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.949455  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2176  ferrous iron transport protein B  57.37 
 
 
647 aa  686    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3948  ferrous iron transport protein B  57.4 
 
 
621 aa  652    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.648078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6110  ferrous iron transport protein B  70.97 
 
 
625 aa  827    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.218757  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0954  ferrous iron transport protein B  71.57 
 
 
626 aa  882    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1058  ferrous iron transport protein B  72.04 
 
 
626 aa  888    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1111  ferrous iron transport protein B  95.21 
 
 
626 aa  1177    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5890  Fe2+ transport system protein B  57.49 
 
 
620 aa  662    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1161  ferrous iron transport protein B  56.34 
 
 
632 aa  660    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.233706  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1471  transport protein B  56.24 
 
 
629 aa  636    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2434  ferrous iron transport protein B  53.99 
 
 
633 aa  643    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00098  ferrous iron transport protein B  53.8 
 
 
621 aa  630  1e-179  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.069629  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1329  ferrous iron transport protein B  51.27 
 
 
637 aa  611  1e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1860  ferrous iron transport protein B  52.83 
 
 
617 aa  608  1e-173  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0623  ferrous iron transport protein B  50.87 
 
 
637 aa  600  1e-170  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.356093  normal  0.228705 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47490  ferrous iron transport protein B  52.03 
 
 
615 aa  598  1e-169  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1922  ferrous iron transport protein B  53.15 
 
 
617 aa  597  1e-169  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2451  ferrous iron transport protein B  53.25 
 
 
621 aa  596  1e-169  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0064  ferrous iron transport protein B  54.19 
 
 
628 aa  594  1e-168  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.956131  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0676  ferrous iron transport protein B  49.35 
 
 
636 aa  591  1e-167  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2849  ferrous iron transport protein B  49.2 
 
 
618 aa  560  1e-158  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2987  ferrous iron transport protein B  53.86 
 
 
619 aa  561  1e-158  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0512994 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2567  ferrous iron transport protein B  39.75 
 
 
753 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3726  ferrous iron transport protein B  36.55 
 
 
696 aa  460  9.999999999999999e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0784  ferrous iron transport protein B  37.59 
 
 
711 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1451  ferrous iron transport protein B  37.29 
 
 
705 aa  414  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0248254  normal  0.0823674 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1078  ferrous iron transport protein B  33.43 
 
 
665 aa  411  1e-113  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.996842  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0962  ferrous iron transport protein B  34.53 
 
 
699 aa  408  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2011  GTP-binding protein, HSR1-related  40.09 
 
 
648 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606318  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2434  ferrous iron transport protein B  35 
 
 
711 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0984425  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2843  ferrous iron transport protein B  34.55 
 
 
712 aa  396  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1709  ferrous iron transport protein B  39.14 
 
 
618 aa  395  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2464  ferrous iron transport protein B  32.59 
 
 
712 aa  395  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.967572  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03990  ferrous iron transport protein B-like protein  34.2 
 
 
699 aa  394  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.625523  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1913  ferrous iron transport protein B  35.79 
 
 
587 aa  381  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000339722  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1631  ferrous iron transport protein B  35.63 
 
 
587 aa  382  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000698683  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2126  ferrous iron transport protein B  34.26 
 
 
664 aa  376  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  37.54 
 
 
676 aa  377  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2074  ferrous iron transport protein B  33.06 
 
 
712 aa  375  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1929  ferrous iron transport protein B  33.2 
 
 
712 aa  377  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000762105  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0873  ferrous iron transport protein B  34.43 
 
 
667 aa  373  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101727  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0895  ferrous iron transport protein B  34.43 
 
 
669 aa  373  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00236216  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1343  ferrous iron transport protein B  34.65 
 
 
662 aa  374  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.547756  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0779  ferrous iron transport protein B  33.67 
 
 
688 aa  374  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328587  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  34.78 
 
 
631 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  33.28 
 
 
662 aa  372  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1452  ferrous iron transport protein B  34.67 
 
 
665 aa  371  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.789379  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2658  ferrous iron transport protein B  34.94 
 
 
664 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  32.89 
 
 
662 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  32.7 
 
 
662 aa  366  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  32.89 
 
 
662 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  32.89 
 
 
662 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4947  ferrous iron transport protein B  33.14 
 
 
662 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2213  ferrous iron transport protein B  30.97 
 
 
713 aa  369  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4932  ferrous iron transport protein B  32.99 
 
 
662 aa  365  1e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  32.7 
 
 
662 aa  364  2e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4642  ferrous iron transport protein B  32.85 
 
 
662 aa  365  2e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2572  ferrous iron transport protein B  33.38 
 
 
664 aa  364  3e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2626  ferrous iron transport protein B  33.38 
 
 
664 aa  364  3e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.51649  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0108  ferrous iron transport protein B  32.28 
 
 
712 aa  364  3e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0307  ferrous iron transport protein B  32.7 
 
 
662 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2325  ferrous iron transport protein B  35.56 
 
 
666 aa  361  2e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.907395  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1508  ferrous iron transport protein B  33.58 
 
 
665 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.225021  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  34.74 
 
 
631 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3827  ferrous iron transport protein B  38.53 
 
 
700 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.792233 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0871  ferrous iron transport protein B  43 
 
 
716 aa  354  2e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  31.8 
 
 
669 aa  355  2e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  31.44 
 
 
669 aa  354  2.9999999999999997e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5086  ferrous iron transport protein B  35.72 
 
 
712 aa  353  4e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000565138  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0283  ferrous iron transport protein B  32.01 
 
 
674 aa  351  2e-95  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0890  ferrous iron transport protein B  34.11 
 
 
684 aa  351  2e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0856  hypothetical protein  34.78 
 
 
649 aa  351  2e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.935712  normal  0.465758 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0654  Fe2+ transport system protein B  32.14 
 
 
712 aa  350  5e-95  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0719  ferrous iron transport protein B  32.04 
 
 
829 aa  350  6e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0311256  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1458  ferrous iron transport protein B  34.05 
 
 
716 aa  349  1e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.137578  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4234  ferrous iron transport protein B  44.32 
 
 
722 aa  347  4e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.322995  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0976  ferrous iron transport protein B  35.13 
 
 
676 aa  343  4e-93  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00114707  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1761  ferrous iron transport protein B  31.33 
 
 
711 aa  343  7e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1739  ferrous iron transport protein B  31.71 
 
 
646 aa  342  1e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00069018  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0193  Fe2+ transport system protein B  32.75 
 
 
691 aa  342  1e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3293  ferrous iron transport protein B  31.12 
 
 
741 aa  335  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.608312  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1583  ferrous iron transport protein B  29.99 
 
 
698 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.983768  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2809  ferrous iron transport protein B  33.28 
 
 
597 aa  327  3e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.123024 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2470  ferrous iron transport protein B  36.24 
 
 
786 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1973  ferrous iron transport protein B  30.46 
 
 
718 aa  321  3e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0259  ferrous iron transport protein B  31.49 
 
 
628 aa  315  9.999999999999999e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00038951  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1938  ferrous iron transport protein B  35.41 
 
 
647 aa  315  1.9999999999999998e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.31907  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56680  ferrous iron transport protein B  35.78 
 
 
766 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4929  ferrous iron transport protein B  32.33 
 
 
766 aa  312  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875416  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0901  ferrous iron transport protein B  28.26 
 
 
708 aa  310  5e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000608812  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2878  ferrous iron transport protein B  30.58 
 
 
606 aa  310  6.999999999999999e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0506695 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0434  ferrous iron transport protein B  31.02 
 
 
665 aa  308  2.0000000000000002e-82  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1294  ferrous iron transport protein B  38.79 
 
 
844 aa  306  1.0000000000000001e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>