More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3948 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp0251  ferrous IRON transport B transmembrane protein  90.66 
 
 		 621 aa  1088    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.563283  normal  0.119264 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1804  ferrous iron transport protein B  66.88 
 
 		 621 aa  823    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.529813  normal  0.0419932 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5429  ferrous iron transport B domain-containing protein  76.96 
 
 		 617 aa  867    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.895542  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2975  ferrous iron transport protein B  57.4 
 
 		 626 aa  672    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.949455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0623  ferrous iron transport protein B  56.84 
 
 		 637 aa  678    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.356093  normal  0.228705 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1860  ferrous iron transport protein B  67.92 
 
 		 617 aa  802    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00098  ferrous iron transport protein B  67.69 
 
 		 621 aa  824    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.069629  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5116  ferrous iron transport protein B  56.07 
 
 		 626 aa  676    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0676  ferrous iron transport protein B  52.39 
 
 		 636 aa  639    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0954  ferrous iron transport protein B  56.3 
 
 		 626 aa  670    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0064  ferrous iron transport protein B  61.31 
 
 		 628 aa  677    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.956131  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1058  ferrous iron transport protein B  56.36 
 
 		 626 aa  672    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1111  ferrous iron transport protein B  57.4 
 
 		 626 aa  675    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5890  Fe2+ transport system protein B  73.54 
 
 		 620 aa  890    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2176  ferrous iron transport protein B  62 
 
 		 647 aa  741    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1329  ferrous iron transport protein B  56.89 
 
 		 637 aa  676    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47490  ferrous iron transport protein B  57.89 
 
 		 615 aa  690    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4039  ferrous iron transport protein B  58.03 
 
 		 625 aa  663    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129654 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1922  ferrous iron transport protein B  67.59 
 
 		 617 aa  787    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6110  ferrous iron transport protein B  56.87 
 
 		 625 aa  642    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.218757  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3948  ferrous iron transport protein B  100 
 
 		 621 aa  1246    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.648078 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1161  ferrous iron transport protein B  63.28 
 
 		 632 aa  743    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.233706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1471  transport protein B  60.13 
 
 		 629 aa  689    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2434  ferrous iron transport protein B  62.54 
 
 		 633 aa  751    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1443  ferrous iron transport protein B  63.45 
 
 		 631 aa  719    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0983772  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4061  ferrous iron transport protein B  100 
 
 		 621 aa  1246    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2451  ferrous iron transport protein B  56.15 
 
 		 621 aa  621  1e-176  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2849  ferrous iron transport protein B  54.93 
 
 		 618 aa  617  1e-175  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2987  ferrous iron transport protein B  54.97 
 
 		 619 aa  565  1.0000000000000001e-159  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0512994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0784  ferrous iron transport protein B  36.36 
 
 		 711 aa  442  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3726  ferrous iron transport protein B  35.59 
 
 		 696 aa  442  1e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1078  ferrous iron transport protein B  35.74 
 
 		 665 aa  414  1e-114  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.996842  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0962  ferrous iron transport protein B  36.43 
 
 		 699 aa  411  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2011  GTP-binding protein, HSR1-related  41.07 
 
 		 648 aa  402  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606318  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03990  ferrous iron transport protein B-like protein  35.48 
 
 		 699 aa  389  1e-107  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.625523  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1709  ferrous iron transport protein B  40.39 
 
 		 618 aa  392  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1631  ferrous iron transport protein B  35.02 
 
 		 587 aa  390  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000698683  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1913  ferrous iron transport protein B  34.53 
 
 		 587 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000339722  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4234  ferrous iron transport protein B  36.16 
 
 		 722 aa  382  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.322995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0110  ferrous iron transport protein B  37.08 
 
 		 668 aa  377  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0260348  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1343  ferrous iron transport protein B  35.23 
 
 		 662 aa  373  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.547756  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  33.65 
 
 		 631 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1452  ferrous iron transport protein B  35.82 
 
 		 665 aa  372  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.789379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1951  ferrous iron transport protein B  34.8 
 
 		 680 aa  370  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0016959  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  35.51 
 
 		 631 aa  361  3e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  35.42 
 
 		 676 aa  360  3e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  33.82 
 
 		 662 aa  359  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0095  ferrous iron transport protein B  35.66 
 
 		 676 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2126  ferrous iron transport protein B  33.67 
 
 		 664 aa  356  6.999999999999999e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1508  ferrous iron transport protein B  33.53 
 
 		 665 aa  355  2e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.225021  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3765  ferrous iron transport protein B  33.07 
 
 		 743 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  33.09 
 
 		 662 aa  353  5e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  33.09 
 
 		 662 aa  353  5e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1929  ferrous iron transport protein B  32.26 
 
 		 712 aa  351  2e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000762105  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  32.94 
 
 		 662 aa  351  3e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2843  ferrous iron transport protein B  31.74 
 
 		 712 aa  350  4e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0895  ferrous iron transport protein B  33.33 
 
 		 669 aa  348  2e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00236216  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0873  ferrous iron transport protein B  33 
 
 		 667 aa  347  3e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101727  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0871  ferrous iron transport protein B  46.52 
 
 		 716 aa  346  7e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0856  hypothetical protein  33.59 
 
 		 649 aa  345  1e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.935712  normal  0.465758 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0108  ferrous iron transport protein B  32.45 
 
 		 712 aa  345  2e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5086  ferrous iron transport protein B  34.99 
 
 		 712 aa  343  5e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000565138  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2434  ferrous iron transport protein B  31.56 
 
 		 711 aa  343  7e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0984425  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1739  ferrous iron transport protein B  33.23 
 
 		 646 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00069018  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  31.07 
 
 		 669 aa  338  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2464  ferrous iron transport protein B  32.08 
 
 		 712 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.967572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  31.36 
 
 		 669 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2074  ferrous iron transport protein B  31.21 
 
 		 712 aa  329  1.0000000000000001e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3827  ferrous iron transport protein B  36 
 
 		 700 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.792233 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2567  ferrous iron transport protein B  41.1 
 
 		 753 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4642  ferrous iron transport protein B  31.63 
 
 		 662 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1785  ferrous iron transport protein B  32.28 
 
 		 713 aa  327  5e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.84236  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1451  ferrous iron transport protein B  41.31 
 
 		 705 aa  325  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0248254  normal  0.0823674 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1938  ferrous iron transport protein B  36.41 
 
 		 647 aa  325  2e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.31907  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0193  Fe2+ transport system protein B  32.5 
 
 		 691 aa  325  2e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3474  ferrous iron transport protein B  31.97 
 
 		 662 aa  323  7e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  32.56 
 
 		 662 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2809  ferrous iron transport protein B  34.08 
 
 		 597 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.123024 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0307  ferrous iron transport protein B  32.31 
 
 		 662 aa  318  1e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4947  ferrous iron transport protein B  32.51 
 
 		 662 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1653  ferrous iron transport protein B  31.47 
 
 		 647 aa  317  4e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.888316 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0286  Fe2+ transport system protein B  31.85 
 
 		 704 aa  317  5e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0260  ferrous iron transport protein B  31.52 
 
 		 647 aa  310  5e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1569  ferrous iron transport protein B  30.25 
 
 		 646 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0107  ferrous iron transport protein B  34.1 
 
 		 778 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.803376  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1097  ferrous iron transport protein B  36.41 
 
 		 595 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3268  ferrous iron transport protein B  30.78 
 
 		 747 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.309598  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2878  ferrous iron transport protein B  31.3 
 
 		 606 aa  305  2.0000000000000002e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0506695 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2711  ferrous iron transporter B  31.4 
 
 		 751 aa  303  8.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3707  ferrous iron transport protein B  35.02 
 
 		 772 aa  302  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2584  ferrous iron transporter B  31.4 
 
 		 751 aa  302  1e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3875  ferrous iron transport protein B  35.02 
 
 		 772 aa  302  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0654  Fe2+ transport system protein B  32.42 
 
 		 712 aa  300  5e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3813  ferrous iron transport protein B  34.85 
 
 		 772 aa  299  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2504  ferrous iron transport protein B  32.5 
 
 		 764 aa  298  1e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00112841  hitchhiker  0.00221536 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0304  ferrous iron transport protein B  35.07 
 
 		 773 aa  298  2e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3779  ferrous iron transport protein B  34.85 
 
 		 772 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3704  ferrous iron transport protein B  34.85 
 
 		 772 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2670  ferrous iron transport protein B  32.5 
 
 		 764 aa  297  4e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.360786  normal  0.0737302 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1194  ferrous iron transport protein B  30.65 
 
 		 714 aa  297  4e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>