More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5429 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010678  Rpic_3948  ferrous iron transport protein B  77.3 
 
 
621 aa  890    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.648078 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0623  ferrous iron transport protein B  56.06 
 
 
637 aa  662    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.356093  normal  0.228705 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1922  ferrous iron transport protein B  67.75 
 
 
617 aa  785    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0251  ferrous IRON transport B transmembrane protein  78.02 
 
 
621 aa  892    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.563283  normal  0.119264 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47490  ferrous iron transport protein B  59.67 
 
 
615 aa  701    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5429  ferrous iron transport B domain-containing protein  100 
 
 
617 aa  1224    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.895542  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2975  ferrous iron transport protein B  57.42 
 
 
626 aa  673    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.949455  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1329  ferrous iron transport protein B  56.75 
 
 
637 aa  664    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0676  ferrous iron transport protein B  53.96 
 
 
636 aa  661    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0954  ferrous iron transport protein B  56.29 
 
 
626 aa  675    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0064  ferrous iron transport protein B  62.13 
 
 
628 aa  671    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.956131  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1058  ferrous iron transport protein B  56.61 
 
 
626 aa  671    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1111  ferrous iron transport protein B  56.93 
 
 
626 aa  669    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5890  Fe2+ transport system protein B  83.39 
 
 
620 aa  1030    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2176  ferrous iron transport protein B  65.7 
 
 
647 aa  764    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1443  ferrous iron transport protein B  67.8 
 
 
631 aa  758    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0983772  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4039  ferrous iron transport protein B  57.61 
 
 
625 aa  659    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129654 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1860  ferrous iron transport protein B  67.21 
 
 
617 aa  798    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2434  ferrous iron transport protein B  66.24 
 
 
633 aa  780    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1804  ferrous iron transport protein B  67.92 
 
 
621 aa  831    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.529813  normal  0.0419932 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00098  ferrous iron transport protein B  67.69 
 
 
621 aa  821    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.069629  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5116  ferrous iron transport protein B  56.38 
 
 
626 aa  677    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1161  ferrous iron transport protein B  64.91 
 
 
632 aa  741    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.233706  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1471  transport protein B  63.42 
 
 
629 aa  718    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4061  ferrous iron transport protein B  77.3 
 
 
621 aa  890    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6110  ferrous iron transport protein B  56.61 
 
 
625 aa  631  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.218757  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2451  ferrous iron transport protein B  55.28 
 
 
621 aa  597  1e-169  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2849  ferrous iron transport protein B  51.55 
 
 
618 aa  593  1e-168  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2987  ferrous iron transport protein B  55.65 
 
 
619 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0512994 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1078  ferrous iron transport protein B  38.12 
 
 
665 aa  444  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.996842  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0784  ferrous iron transport protein B  36.67 
 
 
711 aa  442  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3726  ferrous iron transport protein B  35.12 
 
 
696 aa  438  1e-121  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0962  ferrous iron transport protein B  37.16 
 
 
699 aa  419  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0779  ferrous iron transport protein B  36.26 
 
 
688 aa  403  1e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328587  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2011  GTP-binding protein, HSR1-related  41.96 
 
 
648 aa  394  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606318  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1294  ferrous iron transport protein B  34.91 
 
 
844 aa  384  1e-105  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1709  ferrous iron transport protein B  38.4 
 
 
618 aa  385  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5086  ferrous iron transport protein B  37.62 
 
 
712 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000565138  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1913  ferrous iron transport protein B  34.47 
 
 
587 aa  381  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000339722  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1631  ferrous iron transport protein B  34.94 
 
 
587 aa  381  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000698683  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  34.94 
 
 
631 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2213  ferrous iron transport protein B  33.38 
 
 
713 aa  372  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1452  ferrous iron transport protein B  34.12 
 
 
665 aa  371  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.789379  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1951  ferrous iron transport protein B  34.76 
 
 
680 aa  371  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0016959  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  35.09 
 
 
676 aa  366  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0095  ferrous iron transport protein B  36.02 
 
 
676 aa  354  2e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  34.84 
 
 
631 aa  352  8.999999999999999e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3827  ferrous iron transport protein B  38 
 
 
700 aa  351  3e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.792233 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  33.53 
 
 
662 aa  350  5e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2567  ferrous iron transport protein B  43.42 
 
 
753 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0259  ferrous iron transport protein B  34.86 
 
 
628 aa  345  1e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00038951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0307  ferrous iron transport protein B  32.61 
 
 
662 aa  345  1e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0110  ferrous iron transport protein B  35.71 
 
 
668 aa  344  2.9999999999999997e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0260348  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2658  ferrous iron transport protein B  33.28 
 
 
664 aa  343  7e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2126  ferrous iron transport protein B  32.6 
 
 
664 aa  342  9e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4947  ferrous iron transport protein B  32.79 
 
 
662 aa  342  1e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1451  ferrous iron transport protein B  42.37 
 
 
705 aa  342  1e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0248254  normal  0.0823674 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0856  hypothetical protein  34.14 
 
 
649 aa  342  2e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.935712  normal  0.465758 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2074  ferrous iron transport protein B  32.68 
 
 
712 aa  340  5e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0871  ferrous iron transport protein B  46.28 
 
 
716 aa  337  3.9999999999999995e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2809  ferrous iron transport protein B  35.23 
 
 
597 aa  337  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.123024 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0890  ferrous iron transport protein B  33 
 
 
684 aa  333  6e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  30.04 
 
 
669 aa  329  7e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  30.37 
 
 
669 aa  324  3e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3459  ferrous iron transport protein B  30.36 
 
 
715 aa  321  3e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000760098  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56680  ferrous iron transport protein B  36.99 
 
 
766 aa  320  6e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4642  ferrous iron transport protein B  30.99 
 
 
662 aa  318  1e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2878  ferrous iron transport protein B  31.31 
 
 
606 aa  318  1e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0506695 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2470  ferrous iron transport protein B  35.19 
 
 
786 aa  317  3e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  31.19 
 
 
662 aa  316  7e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  31.19 
 
 
662 aa  316  7e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4234  ferrous iron transport protein B  41.2 
 
 
722 aa  316  9e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.322995  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  31.04 
 
 
662 aa  316  9e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1739  ferrous iron transport protein B  31.71 
 
 
646 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00069018  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1194  ferrous iron transport protein B  31.65 
 
 
714 aa  315  1.9999999999999998e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  31.19 
 
 
662 aa  314  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  31.04 
 
 
662 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0193  Fe2+ transport system protein B  31.91 
 
 
691 aa  313  5.999999999999999e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1458  ferrous iron transport protein B  32.08 
 
 
716 aa  311  2e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.137578  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1097  ferrous iron transport protein B  35.49 
 
 
595 aa  307  5.0000000000000004e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0654  ferrous iron transport protein B  35.41 
 
 
693 aa  304  4.0000000000000003e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2524  ferrous iron transport protein B  32.65 
 
 
766 aa  303  5.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2152  ferrous iron transport protein B  32.65 
 
 
782 aa  303  6.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.264076  hitchhiker  0.0000442692 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1653  ferrous iron transport protein B  30.25 
 
 
647 aa  303  6.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.888316 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2670  ferrous iron transport protein B  33.87 
 
 
764 aa  300  4e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.360786  normal  0.0737302 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1929  ferrous iron transport protein B  36.6 
 
 
712 aa  300  8e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000762105  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4929  ferrous iron transport protein B  36.66 
 
 
766 aa  297  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875416  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3383  ferrous iron transport protein B  35.36 
 
 
683 aa  296  7e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.378196 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1584  ferrous iron transport protein B  32.95 
 
 
764 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000129381  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0108  ferrous iron transport protein B  37.08 
 
 
712 aa  295  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1481  ferrous iron transport protein B  33.44 
 
 
764 aa  295  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.725722  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1618  ferrous iron transport protein B  32.79 
 
 
764 aa  294  3e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00477082  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2414  ferrous iron transport protein B  33.9 
 
 
772 aa  294  3e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331306  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1140  ferrous iron transport protein B  38.82 
 
 
680 aa  293  4e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000225033  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1595  ferrous iron transport protein B  32.79 
 
 
764 aa  293  5e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000195581  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03990  ferrous iron transport protein B-like protein  38.72 
 
 
699 aa  293  6e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.625523  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2759  ferrous iron transport protein B  32.37 
 
 
764 aa  293  6e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383541  hitchhiker  0.00159456 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1938  ferrous iron transport protein B  36.08 
 
 
647 aa  292  1e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.31907  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0754  ferrous iron transport protein B  31.17 
 
 
786 aa  292  2e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0018483  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0465  ferrous iron transport protein B  35.18 
 
 
770 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>