More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1078 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_03990  ferrous iron transport protein B-like protein  55.26 
 
 
699 aa  749    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.625523  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0962  ferrous iron transport protein B  52.56 
 
 
699 aa  730    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1078  ferrous iron transport protein B  100 
 
 
665 aa  1365    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.996842  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3827  ferrous iron transport protein B  44.48 
 
 
700 aa  630  1e-179  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.792233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0784  ferrous iron transport protein B  44.71 
 
 
711 aa  615  1e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3726  ferrous iron transport protein B  44.23 
 
 
696 aa  598  1e-170  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1451  ferrous iron transport protein B  45.4 
 
 
705 aa  558  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0248254  normal  0.0823674 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5086  ferrous iron transport protein B  42.8 
 
 
712 aa  513  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000565138  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2567  ferrous iron transport protein B  37.8 
 
 
753 aa  480  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0871  ferrous iron transport protein B  37.73 
 
 
716 aa  467  9.999999999999999e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2451  ferrous iron transport protein B  37.31 
 
 
621 aa  443  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2698  ferrous iron transport protein B  35.06 
 
 
780 aa  444  1e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.619661  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2434  ferrous iron transport protein B  36.82 
 
 
633 aa  436  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00098  ferrous iron transport protein B  36.32 
 
 
621 aa  422  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.069629  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5890  Fe2+ transport system protein B  36.56 
 
 
620 aa  417  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1471  transport protein B  35.65 
 
 
629 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0623  ferrous iron transport protein B  36.76 
 
 
637 aa  412  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.356093  normal  0.228705 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5429  ferrous iron transport B domain-containing protein  38.12 
 
 
617 aa  414  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.895542  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2176  ferrous iron transport protein B  34.59 
 
 
647 aa  412  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1329  ferrous iron transport protein B  35.97 
 
 
637 aa  414  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5116  ferrous iron transport protein B  35.61 
 
 
626 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47490  ferrous iron transport protein B  37.88 
 
 
615 aa  407  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1804  ferrous iron transport protein B  36.14 
 
 
621 aa  409  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.529813  normal  0.0419932 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0064  ferrous iron transport protein B  36.32 
 
 
628 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.956131  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1294  ferrous iron transport protein B  32.92 
 
 
844 aa  404  1e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3948  ferrous iron transport protein B  36.34 
 
 
621 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.648078 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2975  ferrous iron transport protein B  33.28 
 
 
626 aa  402  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.949455  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4061  ferrous iron transport protein B  36.34 
 
 
621 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0954  ferrous iron transport protein B  35.61 
 
 
626 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1058  ferrous iron transport protein B  35.7 
 
 
626 aa  405  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1860  ferrous iron transport protein B  36.9 
 
 
617 aa  402  1e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0251  ferrous IRON transport B transmembrane protein  36.43 
 
 
621 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.563283  normal  0.119264 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1161  ferrous iron transport protein B  35.5 
 
 
632 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.233706  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4039  ferrous iron transport protein B  35.61 
 
 
625 aa  398  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129654 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1111  ferrous iron transport protein B  33.43 
 
 
626 aa  396  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1922  ferrous iron transport protein B  36.94 
 
 
617 aa  397  1e-109  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1443  ferrous iron transport protein B  36.47 
 
 
631 aa  393  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0983772  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2849  ferrous iron transport protein B  33.08 
 
 
618 aa  386  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2074  ferrous iron transport protein B  32.83 
 
 
712 aa  384  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0676  ferrous iron transport protein B  34.38 
 
 
636 aa  383  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2987  ferrous iron transport protein B  35.1 
 
 
619 aa  383  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0512994 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0012  ferrous iron transport protein B  34.16 
 
 
717 aa  379  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00299021  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2464  ferrous iron transport protein B  32.28 
 
 
712 aa  376  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.967572  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6110  ferrous iron transport protein B  35.23 
 
 
625 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.218757  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2011  GTP-binding protein, HSR1-related  35.78 
 
 
648 aa  378  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606318  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2843  ferrous iron transport protein B  32.05 
 
 
712 aa  373  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2669  ferrous iron transport protein B  33.47 
 
 
725 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1913  ferrous iron transport protein B  34.39 
 
 
587 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000339722  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1631  ferrous iron transport protein B  34.39 
 
 
587 aa  372  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000698683  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0316  ferrous iron transport protein B  32.16 
 
 
725 aa  367  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000873753  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2434  ferrous iron transport protein B  32.02 
 
 
711 aa  368  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0984425  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0675  ferrous iron transport protein B  32.66 
 
 
732 aa  366  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.183925  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0441  ferrous iron transport protein B  32 
 
 
700 aa  365  1e-99  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2126  ferrous iron transport protein B  33.01 
 
 
664 aa  363  4e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4642  ferrous iron transport protein B  33.1 
 
 
662 aa  362  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0108  ferrous iron transport protein B  31.1 
 
 
712 aa  362  1e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0882  ferrous iron transport protein B  34.48 
 
 
720 aa  362  2e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000109469  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  33.52 
 
 
662 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  33.52 
 
 
662 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  33.19 
 
 
662 aa  357  5e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  33.52 
 
 
662 aa  356  6.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  33.52 
 
 
662 aa  356  6.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0719  ferrous iron transport protein B  31.08 
 
 
829 aa  356  6.999999999999999e-97  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0311256  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2213  ferrous iron transport protein B  30.91 
 
 
713 aa  356  6.999999999999999e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3459  ferrous iron transport protein B  31.79 
 
 
715 aa  356  8.999999999999999e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000760098  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  33.61 
 
 
662 aa  355  1e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4932  ferrous iron transport protein B  33.38 
 
 
662 aa  356  1e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2626  ferrous iron transport protein B  32.82 
 
 
664 aa  354  2e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.51649  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0307  ferrous iron transport protein B  33.52 
 
 
662 aa  355  2e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2572  ferrous iron transport protein B  32.82 
 
 
664 aa  354  2e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3474  ferrous iron transport protein B  32.86 
 
 
662 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4947  ferrous iron transport protein B  33.1 
 
 
662 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1583  ferrous iron transport protein B  32.21 
 
 
698 aa  353  4e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.983768  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1929  ferrous iron transport protein B  31.59 
 
 
712 aa  353  5.9999999999999994e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000762105  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0618  ferrous iron transport protein B  30 
 
 
721 aa  352  1e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0536695  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1622  ferrous iron transport protein B  32.43 
 
 
722 aa  348  1e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.782227  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0970  ferrous iron transport protein B  30.78 
 
 
666 aa  345  1e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0839864 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2325  ferrous iron transport protein B  32.4 
 
 
666 aa  344  4e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.907395  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1729  ferrous iron transport protein B  29.57 
 
 
717 aa  343  4e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0580785 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1088  ferrous iron transport protein B  30.18 
 
 
753 aa  343  5e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000362942  hitchhiker  0.0000000000000163165 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3524  ferrous iron transport protein B  30.67 
 
 
697 aa  343  5.999999999999999e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000134401  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1508  ferrous iron transport protein B  33.8 
 
 
665 aa  343  8e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.225021  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  31.72 
 
 
631 aa  342  1e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1709  ferrous iron transport protein B  32.48 
 
 
618 aa  341  2e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2493  ferrous iron transport protein B  32.93 
 
 
743 aa  341  2e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.9646  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1585  ferrous iron transport protein B  29.71 
 
 
723 aa  342  2e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0104102  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1458  ferrous iron transport protein B  30.92 
 
 
716 aa  341  2.9999999999999998e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.137578  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0779  ferrous iron transport protein B  33.01 
 
 
688 aa  340  4e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328587  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2658  ferrous iron transport protein B  33.24 
 
 
664 aa  340  5.9999999999999996e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4234  ferrous iron transport protein B  39.18 
 
 
722 aa  338  9.999999999999999e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.322995  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1140  ferrous iron transport protein B  32.04 
 
 
680 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000225033  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0193  Fe2+ transport system protein B  30.69 
 
 
691 aa  333  4e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1951  ferrous iron transport protein B  29.58 
 
 
680 aa  333  6e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0016959  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0110  ferrous iron transport protein B  31.15 
 
 
668 aa  333  8e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0260348  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  31.08 
 
 
676 aa  332  2e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0895  ferrous iron transport protein B  31.1 
 
 
669 aa  332  2e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00236216  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0873  ferrous iron transport protein B  30.96 
 
 
667 aa  332  2e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101727  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0856  hypothetical protein  32.23 
 
 
649 aa  331  2e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.935712  normal  0.465758 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1015  ferrous iron transport protein B  35.99 
 
 
759 aa  330  4e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.913336 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0283  ferrous iron transport protein B  30.5 
 
 
674 aa  330  5.0000000000000004e-89  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>