More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2849 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2451  ferrous iron transport protein B  63.02 
 
 
621 aa  743    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2849  ferrous iron transport protein B  100 
 
 
618 aa  1234    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2987  ferrous iron transport protein B  64.18 
 
 
619 aa  725    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0512994 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0251  ferrous IRON transport B transmembrane protein  54.89 
 
 
621 aa  600  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.563283  normal  0.119264 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4061  ferrous iron transport protein B  54.86 
 
 
621 aa  588  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3948  ferrous iron transport protein B  54.86 
 
 
621 aa  588  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.648078 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5890  Fe2+ transport system protein B  52.27 
 
 
620 aa  587  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1804  ferrous iron transport protein B  51.61 
 
 
621 aa  587  1e-166  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.529813  normal  0.0419932 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1329  ferrous iron transport protein B  51.92 
 
 
637 aa  584  1.0000000000000001e-165  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00098  ferrous iron transport protein B  51.46 
 
 
621 aa  584  1.0000000000000001e-165  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.069629  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4039  ferrous iron transport protein B  50.24 
 
 
625 aa  583  1.0000000000000001e-165  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129654 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47490  ferrous iron transport protein B  52.39 
 
 
615 aa  579  1e-164  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2176  ferrous iron transport protein B  52.1 
 
 
647 aa  580  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0623  ferrous iron transport protein B  51.44 
 
 
637 aa  579  1e-164  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.356093  normal  0.228705 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2434  ferrous iron transport protein B  52.23 
 
 
633 aa  581  1e-164  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1161  ferrous iron transport protein B  53.04 
 
 
632 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.233706  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0954  ferrous iron transport protein B  50.4 
 
 
626 aa  568  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5116  ferrous iron transport protein B  50.48 
 
 
626 aa  561  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1058  ferrous iron transport protein B  49.68 
 
 
626 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1471  transport protein B  52.5 
 
 
629 aa  558  1e-157  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1860  ferrous iron transport protein B  48.79 
 
 
617 aa  557  1e-157  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5429  ferrous iron transport B domain-containing protein  51.89 
 
 
617 aa  551  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.895542  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2975  ferrous iron transport protein B  50.24 
 
 
626 aa  550  1e-155  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.949455  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1922  ferrous iron transport protein B  48.95 
 
 
617 aa  551  1e-155  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0064  ferrous iron transport protein B  52.72 
 
 
628 aa  549  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.956131  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1111  ferrous iron transport protein B  50.41 
 
 
626 aa  547  1e-154  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1443  ferrous iron transport protein B  51.21 
 
 
631 aa  539  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0983772  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6110  ferrous iron transport protein B  50.4 
 
 
625 aa  528  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.218757  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0676  ferrous iron transport protein B  45.53 
 
 
636 aa  523  1e-147  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2567  ferrous iron transport protein B  39.38 
 
 
753 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0784  ferrous iron transport protein B  34.29 
 
 
711 aa  421  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3726  ferrous iron transport protein B  33.91 
 
 
696 aa  419  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3827  ferrous iron transport protein B  33.24 
 
 
700 aa  410  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.792233 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0962  ferrous iron transport protein B  32.76 
 
 
699 aa  393  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2011  GTP-binding protein, HSR1-related  40.32 
 
 
648 aa  393  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606318  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1078  ferrous iron transport protein B  33.08 
 
 
665 aa  390  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.996842  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2325  ferrous iron transport protein B  35.78 
 
 
666 aa  386  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.907395  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2126  ferrous iron transport protein B  34.3 
 
 
664 aa  385  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3474  ferrous iron transport protein B  35.31 
 
 
662 aa  384  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  35.74 
 
 
631 aa  382  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1709  ferrous iron transport protein B  38.99 
 
 
618 aa  380  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1913  ferrous iron transport protein B  33.66 
 
 
587 aa  381  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000339722  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1631  ferrous iron transport protein B  33.28 
 
 
587 aa  380  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000698683  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  34.87 
 
 
662 aa  375  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03990  ferrous iron transport protein B-like protein  33.43 
 
 
699 aa  374  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.625523  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  37.38 
 
 
631 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0095  ferrous iron transport protein B  33.82 
 
 
676 aa  366  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4947  ferrous iron transport protein B  34.72 
 
 
662 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1929  ferrous iron transport protein B  31.15 
 
 
712 aa  362  1e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000762105  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4105  ferrous iron transport protein B  32.83 
 
 
738 aa  360  4e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281443  normal  0.296674 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1785  ferrous iron transport protein B  32.69 
 
 
713 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.84236  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4642  ferrous iron transport protein B  33.53 
 
 
662 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4932  ferrous iron transport protein B  34.12 
 
 
662 aa  353  4e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0856  hypothetical protein  33.18 
 
 
649 aa  353  5.9999999999999994e-96  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.935712  normal  0.465758 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  33.98 
 
 
662 aa  351  2e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  33.98 
 
 
662 aa  351  2e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  33.98 
 
 
662 aa  351  2e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0283  ferrous iron transport protein B  31.07 
 
 
674 aa  351  2e-95  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2843  ferrous iron transport protein B  32 
 
 
712 aa  350  3e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0307  ferrous iron transport protein B  34.12 
 
 
662 aa  351  3e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  33.83 
 
 
662 aa  351  3e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0793  ferrous iron transport protein B  31.94 
 
 
728 aa  351  3e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.585929  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  33.68 
 
 
662 aa  350  4e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0344  ferrous iron transport protein B  32.3 
 
 
724 aa  348  1e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00337716  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1508  ferrous iron transport protein B  34.26 
 
 
665 aa  348  2e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.225021  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0871  ferrous iron transport protein B  45.78 
 
 
716 aa  347  5e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2213  ferrous iron transport protein B  32.03 
 
 
713 aa  344  2.9999999999999997e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0108  ferrous iron transport protein B  31.14 
 
 
712 aa  344  4e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5086  ferrous iron transport protein B  35.09 
 
 
712 aa  342  8e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000565138  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1739  ferrous iron transport protein B  31.97 
 
 
646 aa  336  7.999999999999999e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00069018  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0976  ferrous iron transport protein B  36.38 
 
 
676 aa  335  2e-90  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00114707  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0719  ferrous iron transport protein B  30.26 
 
 
829 aa  335  2e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0311256  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2698  ferrous iron transport protein B  38.58 
 
 
780 aa  333  5e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.619661  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0543  ferrous iron transport protein B  33.88 
 
 
669 aa  332  2e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00422143  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0890  ferrous iron transport protein B  33.43 
 
 
684 aa  331  3e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2074  ferrous iron transport protein B  31.15 
 
 
712 aa  329  7e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0873  ferrous iron transport protein B  31 
 
 
667 aa  327  3e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101727  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3268  ferrous iron transport protein B  31.04 
 
 
747 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.309598  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0895  ferrous iron transport protein B  30.7 
 
 
669 aa  324  3e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00236216  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0259  ferrous iron transport protein B  32.82 
 
 
628 aa  322  9.999999999999999e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00038951  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2470  ferrous iron transport protein B  35.09 
 
 
786 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0754  ferrous iron transport protein B  31 
 
 
786 aa  318  1e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0018483  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0193  Fe2+ transport system protein B  31.56 
 
 
691 aa  318  2e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1088  ferrous iron transport protein B  30.4 
 
 
753 aa  317  5e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000362942  hitchhiker  0.0000000000000163165 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2626  ferrous iron transport protein B  37.7 
 
 
664 aa  315  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.51649  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3459  ferrous iron transport protein B  29.78 
 
 
715 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000760098  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2572  ferrous iron transport protein B  37.7 
 
 
664 aa  315  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3855  hypothetical protein  33.49 
 
 
776 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107886  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20050  ferrous iron transporter FeoB  31.34 
 
 
749 aa  310  4e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.558981  normal  0.661098 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1458  ferrous iron transport protein B  31.49 
 
 
716 aa  310  5e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.137578  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0901  ferrous iron transport protein B  28.31 
 
 
708 aa  309  1.0000000000000001e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000608812  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1451  ferrous iron transport protein B  39.49 
 
 
705 aa  308  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0248254  normal  0.0823674 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2658  ferrous iron transport protein B  33.09 
 
 
664 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1938  ferrous iron transport protein B  35.14 
 
 
647 aa  306  7e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.31907  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2878  ferrous iron transport protein B  30.97 
 
 
606 aa  305  1.0000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0506695 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1951  ferrous iron transport protein B  38.06 
 
 
680 aa  305  1.0000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0016959  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4234  ferrous iron transport protein B  39 
 
 
722 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.322995  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1097  ferrous iron transport protein B  36.28 
 
 
595 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2711  ferrous iron transporter B  30.25 
 
 
751 aa  303  9e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3822  ferrous iron transport protein B  34.29 
 
 
772 aa  301  3e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.848053  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>