More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp0251 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4039  ferrous iron transport protein B  58.85 
 
 		 625 aa  676    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129654 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00098  ferrous iron transport protein B  66.93 
 
 		 621 aa  812    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.069629  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0251  ferrous IRON transport B transmembrane protein  100 
 
 		 621 aa  1236    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.563283  normal  0.119264 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2176  ferrous iron transport protein B  62.4 
 
 		 647 aa  742    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1329  ferrous iron transport protein B  55.7 
 
 		 637 aa  670    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5429  ferrous iron transport B domain-containing protein  77.45 
 
 		 617 aa  871    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.895542  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2975  ferrous iron transport protein B  56.75 
 
 		 626 aa  663    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.949455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4061  ferrous iron transport protein B  90.66 
 
 		 621 aa  1085    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0623  ferrous iron transport protein B  57.32 
 
 		 637 aa  683    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.356093  normal  0.228705 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0676  ferrous iron transport protein B  54.15 
 
 		 636 aa  645    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1804  ferrous iron transport protein B  65.75 
 
 		 621 aa  810    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.529813  normal  0.0419932 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1922  ferrous iron transport protein B  68.19 
 
 		 617 aa  786    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0954  ferrous iron transport protein B  56.84 
 
 		 626 aa  673    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0064  ferrous iron transport protein B  62.11 
 
 		 628 aa  688    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.956131  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47490  ferrous iron transport protein B  58.54 
 
 		 615 aa  685    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1443  ferrous iron transport protein B  65.41 
 
 		 631 aa  733    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0983772  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1860  ferrous iron transport protein B  68.52 
 
 		 617 aa  803    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1058  ferrous iron transport protein B  56.59 
 
 		 626 aa  670    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1111  ferrous iron transport protein B  57.07 
 
 		 626 aa  667    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5890  Fe2+ transport system protein B  74.47 
 
 		 620 aa  896    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2434  ferrous iron transport protein B  62.36 
 
 		 633 aa  750    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5116  ferrous iron transport protein B  56.55 
 
 		 626 aa  676    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1161  ferrous iron transport protein B  64.39 
 
 		 632 aa  757    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.233706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3948  ferrous iron transport protein B  90.66 
 
 		 621 aa  1085    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.648078 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1471  transport protein B  61.21 
 
 		 629 aa  697    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6110  ferrous iron transport protein B  57.26 
 
 		 625 aa  644    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.218757  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2849  ferrous iron transport protein B  54.89 
 
 		 618 aa  617  1e-175  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2451  ferrous iron transport protein B  55.74 
 
 		 621 aa  610  1e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2987  ferrous iron transport protein B  55.14 
 
 		 619 aa  565  1.0000000000000001e-159  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0512994 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2567  ferrous iron transport protein B  39.19 
 
 		 753 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3726  ferrous iron transport protein B  35.97 
 
 		 696 aa  443  1e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0784  ferrous iron transport protein B  35.74 
 
 		 711 aa  413  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1078  ferrous iron transport protein B  36.43 
 
 		 665 aa  415  1e-114  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.996842  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0962  ferrous iron transport protein B  36.19 
 
 		 699 aa  408  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1929  ferrous iron transport protein B  34.64 
 
 		 712 aa  401  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000762105  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03990  ferrous iron transport protein B-like protein  35.29 
 
 		 699 aa  399  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.625523  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1294  ferrous iron transport protein B  35.84 
 
 		 844 aa  395  1e-108  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1709  ferrous iron transport protein B  40.55 
 
 		 618 aa  394  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2011  GTP-binding protein, HSR1-related  40.22 
 
 		 648 aa  392  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606318  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1631  ferrous iron transport protein B  35.4 
 
 		 587 aa  388  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000698683  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1913  ferrous iron transport protein B  35.07 
 
 		 587 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000339722  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1343  ferrous iron transport protein B  35.14 
 
 		 662 aa  380  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.547756  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0110  ferrous iron transport protein B  36.93 
 
 		 668 aa  378  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0260348  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  34.37 
 
 		 631 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1452  ferrous iron transport protein B  35.84 
 
 		 665 aa  368  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.789379  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0095  ferrous iron transport protein B  36.23 
 
 		 676 aa  365  2e-99  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3765  ferrous iron transport protein B  33.74 
 
 		 743 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2843  ferrous iron transport protein B  32.68 
 
 		 712 aa  362  1e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  35.42 
 
 		 631 aa  361  2e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2434  ferrous iron transport protein B  31.76 
 
 		 711 aa  356  5.999999999999999e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0984425  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0871  ferrous iron transport protein B  47 
 
 		 716 aa  352  1e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  32.31 
 
 		 669 aa  351  2e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  31.88 
 
 		 669 aa  348  2e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1458  ferrous iron transport protein B  33.77 
 
 		 716 aa  348  2e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.137578  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4105  ferrous iron transport protein B  35.05 
 
 		 738 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281443  normal  0.296674 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0108  ferrous iron transport protein B  32.87 
 
 		 712 aa  345  2e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2213  ferrous iron transport protein B  31.37 
 
 		 713 aa  341  2e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2074  ferrous iron transport protein B  31.51 
 
 		 712 aa  341  2e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2464  ferrous iron transport protein B  31.59 
 
 		 712 aa  341  2e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.967572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0856  hypothetical protein  34.95 
 
 		 649 aa  341  2.9999999999999998e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.935712  normal  0.465758 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1951  ferrous iron transport protein B  34.46 
 
 		 680 aa  332  1e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0016959  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0873  ferrous iron transport protein B  32.8 
 
 		 667 aa  332  1e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101727  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0895  ferrous iron transport protein B  32.6 
 
 		 669 aa  331  3e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00236216  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1451  ferrous iron transport protein B  41.5 
 
 		 705 aa  330  4e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0248254  normal  0.0823674 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3827  ferrous iron transport protein B  36.56 
 
 		 700 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.792233 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  31.5 
 
 		 662 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4642  ferrous iron transport protein B  32.46 
 
 		 662 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  31.21 
 
 		 662 aa  328  3e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  31.21 
 
 		 662 aa  328  3e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  31.46 
 
 		 662 aa  323  6e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2878  ferrous iron transport protein B  32.27 
 
 		 606 aa  321  3e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0506695 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1938  ferrous iron transport protein B  37.44 
 
 		 647 aa  320  5e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.31907  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1761  ferrous iron transport protein B  30.44 
 
 		 711 aa  317  4e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1569  ferrous iron transport protein B  30.59 
 
 		 646 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1097  ferrous iron transport protein B  37 
 
 		 595 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2809  ferrous iron transport protein B  34.41 
 
 		 597 aa  314  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.123024 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1739  ferrous iron transport protein B  32.12 
 
 		 646 aa  313  9e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00069018  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2711  ferrous iron transporter B  31.58 
 
 		 751 aa  310  5e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4234  ferrous iron transport protein B  40.85 
 
 		 722 aa  306  6e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.322995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1653  ferrous iron transport protein B  31.18 
 
 		 647 aa  306  9.000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.888316 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2126  ferrous iron transport protein B  37.19 
 
 		 664 aa  305  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0259  ferrous iron transport protein B  32.52 
 
 		 628 aa  303  7.000000000000001e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00038951  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0754  ferrous iron transport protein B  32.3 
 
 		 786 aa  302  1e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0018483  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0260  ferrous iron transport protein B  30.88 
 
 		 647 aa  301  3e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1194  ferrous iron transport protein B  30.81 
 
 		 714 aa  300  5e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0304  ferrous iron transport protein B  36.64 
 
 		 773 aa  300  6e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03261  ferrous iron transport protein B  36.48 
 
 		 773 aa  299  1e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.313443  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03213  hypothetical protein  36.48 
 
 		 773 aa  299  1e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.267012  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0304  ferrous iron transport protein B  36.48 
 
 		 773 aa  299  1e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0656913 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3790  ferrous iron transport protein B  36.48 
 
 		 773 aa  299  1e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3884  ferrous iron transport protein B  36.48 
 
 		 773 aa  299  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3606  ferrous iron transport protein B  36.48 
 
 		 773 aa  299  1e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3690  ferrous iron transport protein B  36.48 
 
 		 773 aa  299  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4716  ferrous iron transport protein B  36.48 
 
 		 773 aa  299  1e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0719  ferrous iron transport protein B  29.22 
 
 		 829 aa  297  3e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0311256  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1933  ferrous iron transport protein B  34.03 
 
 		 774 aa  297  4e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.651093  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0637  ferrous iron transport protein B  30.31 
 
 		 739 aa  297  4e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000736261  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3875  ferrous iron transport protein B  35.89 
 
 		 772 aa  296  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3813  ferrous iron transport protein B  35.89 
 
 		 772 aa  296  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1088  ferrous iron transport protein B  29.7 
 
 		 753 aa  295  1e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000362942  hitchhiker  0.0000000000000163165 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>