More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2011 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2011  GTP-binding protein, HSR1-related  100 
 
 		 648 aa  1268    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606318  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5116  ferrous iron transport protein B  41.01 
 
 		 626 aa  428  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0954  ferrous iron transport protein B  40.79 
 
 		 626 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1058  ferrous iron transport protein B  41.01 
 
 		 626 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2975  ferrous iron transport protein B  40.53 
 
 		 626 aa  418  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.949455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1804  ferrous iron transport protein B  41.55 
 
 		 621 aa  414  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.529813  normal  0.0419932 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1860  ferrous iron transport protein B  40.76 
 
 		 617 aa  414  1e-114  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00098  ferrous iron transport protein B  41.83 
 
 		 621 aa  411  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.069629  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3948  ferrous iron transport protein B  41.93 
 
 		 621 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.648078 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4061  ferrous iron transport protein B  41.93 
 
 		 621 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1111  ferrous iron transport protein B  39.47 
 
 		 626 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1922  ferrous iron transport protein B  40.92 
 
 		 617 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0623  ferrous iron transport protein B  36.92 
 
 		 637 aa  404  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.356093  normal  0.228705 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2849  ferrous iron transport protein B  40.89 
 
 		 618 aa  402  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2434  ferrous iron transport protein B  40.43 
 
 		 633 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1329  ferrous iron transport protein B  37.21 
 
 		 637 aa  402  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2176  ferrous iron transport protein B  41.04 
 
 		 647 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3726  ferrous iron transport protein B  34.73 
 
 		 696 aa  397  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1471  transport protein B  40.99 
 
 		 629 aa  398  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4039  ferrous iron transport protein B  40 
 
 		 625 aa  398  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129654 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0251  ferrous IRON transport B transmembrane protein  40.96 
 
 		 621 aa  393  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.563283  normal  0.119264 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2451  ferrous iron transport protein B  41.01 
 
 		 621 aa  395  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0676  ferrous iron transport protein B  36.97 
 
 		 636 aa  395  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6110  ferrous iron transport protein B  39.97 
 
 		 625 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.218757  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5890  Fe2+ transport system protein B  40.23 
 
 		 620 aa  391  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1078  ferrous iron transport protein B  35.61 
 
 		 665 aa  389  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.996842  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2987  ferrous iron transport protein B  40.87 
 
 		 619 aa  389  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0512994 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5429  ferrous iron transport B domain-containing protein  42.22 
 
 		 617 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.895542  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1161  ferrous iron transport protein B  39.07 
 
 		 632 aa  382  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.233706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47490  ferrous iron transport protein B  39.84 
 
 		 615 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0784  ferrous iron transport protein B  33.8 
 
 		 711 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0064  ferrous iron transport protein B  41.12 
 
 		 628 aa  374  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.956131  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2567  ferrous iron transport protein B  35.68 
 
 		 753 aa  370  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1443  ferrous iron transport protein B  38.7 
 
 		 631 aa  353  4e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0983772  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1709  ferrous iron transport protein B  36.33 
 
 		 618 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4234  ferrous iron transport protein B  43.41 
 
 		 722 aa  322  1.9999999999999998e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.322995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  33.43 
 
 		 631 aa  316  8e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  33.03 
 
 		 631 aa  307  5.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1913  ferrous iron transport protein B  30.24 
 
 		 587 aa  306  8.000000000000001e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000339722  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1631  ferrous iron transport protein B  29.92 
 
 		 587 aa  305  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000698683  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1739  ferrous iron transport protein B  29.91 
 
 		 646 aa  301  2e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00069018  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3827  ferrous iron transport protein B  35.08 
 
 		 700 aa  300  8e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.792233 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  31.02 
 
 		 662 aa  298  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1451  ferrous iron transport protein B  40.83 
 
 		 705 aa  298  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0248254  normal  0.0823674 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4932  ferrous iron transport protein B  31.15 
 
 		 662 aa  298  3e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  31.59 
 
 		 662 aa  298  3e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0307  ferrous iron transport protein B  31.15 
 
 		 662 aa  298  3e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  31.21 
 
 		 662 aa  297  4e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4947  ferrous iron transport protein B  31.3 
 
 		 662 aa  296  5e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  31.16 
 
 		 662 aa  296  9e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  31.31 
 
 		 662 aa  296  1e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  31.31 
 
 		 662 aa  296  1e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4642  ferrous iron transport protein B  30.87 
 
 		 662 aa  295  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0856  hypothetical protein  33.08 
 
 		 649 aa  294  3e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.935712  normal  0.465758 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0793  ferrous iron transport protein B  31.39 
 
 		 728 aa  293  6e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.585929  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1597  GTP-binding protein HSR1-related  35.24 
 
 		 617 aa  293  8e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2074  ferrous iron transport protein B  31.01 
 
 		 712 aa  293  9e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1583  ferrous iron transport protein B  28.01 
 
 		 698 aa  291  3e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.983768  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2878  ferrous iron transport protein B  30.02 
 
 		 606 aa  290  4e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0506695 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0871  ferrous iron transport protein B  40.9 
 
 		 716 aa  290  5.0000000000000004e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1140  ferrous iron transport protein B  29.99 
 
 		 680 aa  290  6e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000225033  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0599  ferrous iron transport protein B  38.46 
 
 		 640 aa  288  2e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0621968  normal  0.0719652 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1938  ferrous iron transport protein B  39.16 
 
 		 647 aa  287  5e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.31907  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1929  ferrous iron transport protein B  33.4 
 
 		 712 aa  276  9e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000762105  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2434  ferrous iron transport protein B  34.19 
 
 		 711 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0984425  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1761  ferrous iron transport protein B  28.53 
 
 		 711 aa  274  3e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03990  ferrous iron transport protein B-like protein  37.3 
 
 		 699 aa  270  5.9999999999999995e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.625523  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2809  ferrous iron transport protein B  31.27 
 
 		 597 aa  270  7e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.123024 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0108  ferrous iron transport protein B  33.18 
 
 		 712 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0344  ferrous iron transport protein B  36.04 
 
 		 724 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00337716  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2464  ferrous iron transport protein B  33.26 
 
 		 712 aa  266  8e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.967572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0962  ferrous iron transport protein B  36.83 
 
 		 699 aa  266  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2213  ferrous iron transport protein B  34.74 
 
 		 713 aa  265  3e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3383  ferrous iron transport protein B  34.03 
 
 		 683 aa  264  4.999999999999999e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.378196 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1194  ferrous iron transport protein B  28.47 
 
 		 714 aa  263  6e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1294  ferrous iron transport protein B  34.69 
 
 		 844 aa  262  1e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1097  ferrous iron transport protein B  34.34 
 
 		 595 aa  261  2e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2698  ferrous iron transport protein B  35.44 
 
 		 780 aa  261  2e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.619661  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0259  ferrous iron transport protein B  28.44 
 
 		 628 aa  260  5.0000000000000005e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00038951  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0618  ferrous iron transport protein B  26.47 
 
 		 721 aa  260  6e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0536695  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2843  ferrous iron transport protein B  33.86 
 
 		 712 aa  258  3e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0735  ferrous iron transport protein B  28.67 
 
 		 648 aa  253  7e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.56734  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0283  ferrous iron transport protein B  30.95 
 
 		 674 aa  251  3e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0441  ferrous iron transport protein B  31.44 
 
 		 700 aa  251  3e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2470  ferrous iron transport protein B  32.43 
 
 		 786 aa  249  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0970  ferrous iron transport protein B  37.16 
 
 		 666 aa  249  1e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0839864 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0895  ferrous iron transport protein B  33.11 
 
 		 669 aa  248  3e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00236216  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0873  ferrous iron transport protein B  33.11 
 
 		 667 aa  248  3e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101727  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0754  ferrous iron transport protein B  31.8 
 
 		 786 aa  246  6.999999999999999e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0018483  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0654  ferrous iron transport protein B  33.1 
 
 		 693 aa  246  8e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  35.01 
 
 		 676 aa  245  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16120  ferrous iron transporter FeoB  29.5 
 
 		 785 aa  244  3e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000453744 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1429  ferrous iron transport protein B  27.45 
 
 		 697 aa  244  3.9999999999999997e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000934837  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1951  ferrous iron transport protein B  34.17 
 
 		 680 aa  241  2.9999999999999997e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0016959  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1458  ferrous iron transport protein B  26.46 
 
 		 716 aa  240  5e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.137578  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1729  ferrous iron transport protein B  31.89 
 
 		 717 aa  239  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0580785 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4929  ferrous iron transport protein B  30.82 
 
 		 766 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875416  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5086  ferrous iron transport protein B  37.47 
 
 		 712 aa  237  5.0000000000000005e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000565138  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0779  ferrous iron transport protein B  33.41 
 
 		 688 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328587  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3765  ferrous iron transport protein B  31.42 
 
 		 743 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>