More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1597 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1597  GTP-binding protein HSR1-related  100 
 
 
617 aa  1221    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1938  ferrous iron transport protein B  51.75 
 
 
647 aa  559  1e-158  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.31907  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0599  ferrous iron transport protein B  52.8 
 
 
640 aa  547  1e-154  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0621968  normal  0.0719652 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1631  ferrous iron transport protein B  33.76 
 
 
587 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000698683  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1913  ferrous iron transport protein B  33.76 
 
 
587 aa  373  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000339722  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  33.33 
 
 
631 aa  339  7e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0555  ferrous iron transport B domain-containing protein  38.85 
 
 
577 aa  334  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0856  hypothetical protein  34.98 
 
 
649 aa  334  3e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.935712  normal  0.465758 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3293  ferrous iron transport protein B  33.15 
 
 
741 aa  320  6e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.608312  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1140  ferrous iron transport protein B  32.13 
 
 
680 aa  319  7.999999999999999e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000225033  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2584  ferrous iron transporter B  31.07 
 
 
751 aa  317  5e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2711  ferrous iron transporter B  31.07 
 
 
751 aa  316  8e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3765  ferrous iron transport protein B  30.46 
 
 
743 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1951  ferrous iron transport protein B  32.03 
 
 
680 aa  314  2.9999999999999996e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0016959  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1508  ferrous iron transport protein B  32.46 
 
 
665 aa  313  6.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.225021  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3658  ferrous iron transport protein B  30.96 
 
 
741 aa  312  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0543  ferrous iron transport protein B  31.98 
 
 
669 aa  311  2e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00422143  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  33.02 
 
 
631 aa  309  8e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4258  ferrous iron transport B domain-containing protein  38.94 
 
 
577 aa  309  8e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.966603  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3546  Ferrous iron transport protein B domain protein  39.09 
 
 
574 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3474  ferrous iron transport protein B  32.07 
 
 
662 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2658  ferrous iron transport protein B  33.28 
 
 
664 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0286  Fe2+ transport system protein B  29.84 
 
 
704 aa  302  1e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3524  ferrous iron transport protein B  30.13 
 
 
697 aa  301  2e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000134401  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0970  ferrous iron transport protein B  33.43 
 
 
666 aa  301  3e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0839864 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0779  ferrous iron transport protein B  34.3 
 
 
688 aa  300  5e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328587  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  29.74 
 
 
669 aa  299  1e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  31.94 
 
 
676 aa  297  4e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0292  ferrous iron transport protein B  31.71 
 
 
784 aa  293  8e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000454012  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0108  ferrous iron transport protein B  30.62 
 
 
712 aa  291  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2843  ferrous iron transport protein B  29.96 
 
 
712 aa  290  8e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  29.02 
 
 
669 aa  288  2e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2849  ferrous iron transport protein B  33.28 
 
 
618 aa  286  9e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56680  ferrous iron transport protein B  31.01 
 
 
766 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4929  ferrous iron transport protein B  30.73 
 
 
766 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875416  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1452  ferrous iron transport protein B  31.29 
 
 
665 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.789379  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0895  ferrous iron transport protein B  30.31 
 
 
669 aa  283  8.000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00236216  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0873  ferrous iron transport protein B  30.16 
 
 
667 aa  281  2e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101727  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0623  ferrous iron transport protein B  32.34 
 
 
637 aa  282  2e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.356093  normal  0.228705 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0676  ferrous iron transport protein B  32.17 
 
 
636 aa  282  2e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1329  ferrous iron transport protein B  32.08 
 
 
637 aa  281  3e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2126  ferrous iron transport protein B  35.39 
 
 
664 aa  281  3e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0251  ferrous IRON transport B transmembrane protein  34.34 
 
 
621 aa  280  7e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.563283  normal  0.119264 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0193  Fe2+ transport system protein B  28.57 
 
 
691 aa  280  8e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0654  ferrous iron transport protein B  31.53 
 
 
693 aa  279  8e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0107  ferrous iron transport protein B  30.32 
 
 
778 aa  279  1e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.803376  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2809  ferrous iron transport protein B  32.23 
 
 
597 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.123024 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2464  ferrous iron transport protein B  28.89 
 
 
712 aa  278  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.967572  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1097  ferrous iron transport protein B  34.74 
 
 
595 aa  277  4e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0890  ferrous iron transport protein B  29.59 
 
 
684 aa  276  8e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2690  ferrous iron transport protein B  30.42 
 
 
764 aa  276  9e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.878145  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4061  ferrous iron transport protein B  35.13 
 
 
621 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3948  ferrous iron transport protein B  35.13 
 
 
621 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.648078 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1785  ferrous iron transport protein B  34.08 
 
 
713 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.84236  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3368  ferrous iron transport protein B  36.73 
 
 
740 aa  272  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1595  ferrous iron transport protein B  29.22 
 
 
764 aa  270  5e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000195581  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1618  ferrous iron transport protein B  29.22 
 
 
764 aa  270  5e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00477082  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3383  ferrous iron transport protein B  31.53 
 
 
683 aa  270  7e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.378196 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3875  ferrous iron transport protein B  30.97 
 
 
772 aa  270  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551384  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1532  ferrous iron transport protein B  29.82 
 
 
764 aa  270  8e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2759  ferrous iron transport protein B  29.22 
 
 
764 aa  270  8e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383541  hitchhiker  0.00159456 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2011  GTP-binding protein, HSR1-related  34.84 
 
 
648 aa  269  8.999999999999999e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606318  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4039  ferrous iron transport protein B  34.08 
 
 
625 aa  269  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129654 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3813  ferrous iron transport protein B  30.83 
 
 
772 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3707  ferrous iron transport protein B  30.83 
 
 
772 aa  269  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3779  ferrous iron transport protein B  30.83 
 
 
772 aa  269  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0754  ferrous iron transport protein B  29.17 
 
 
786 aa  269  1e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0018483  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4105  ferrous iron transport protein B  34.24 
 
 
738 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281443  normal  0.296674 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3704  ferrous iron transport protein B  30.83 
 
 
772 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2176  ferrous iron transport protein B  33.55 
 
 
647 aa  268  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2451  ferrous iron transport protein B  33.72 
 
 
621 aa  268  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1584  ferrous iron transport protein B  29.09 
 
 
764 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000129381  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2878  ferrous iron transport protein B  30.11 
 
 
606 aa  266  7e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0506695 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2414  ferrous iron transport protein B  28.3 
 
 
772 aa  266  8e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331306  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1860  ferrous iron transport protein B  34.5 
 
 
617 aa  266  1e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1458  ferrous iron transport protein B  27.67 
 
 
716 aa  266  1e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.137578  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2572  ferrous iron transport protein B  30.12 
 
 
764 aa  265  1e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.148151  normal  0.0102392 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2258  ferrous iron transport protein FeoB  29.06 
 
 
758 aa  265  2e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.694686  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2975  ferrous iron transport protein B  30.97 
 
 
626 aa  264  3e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.949455  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3122  ferrous iron transport protein B  29.49 
 
 
764 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000440223 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0623  ferrous iron transport protein B  29.28 
 
 
783 aa  263  6e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.626283  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1111  ferrous iron transport protein B  31.01 
 
 
626 aa  263  6e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2504  ferrous iron transport protein B  30.12 
 
 
764 aa  263  6e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00112841  hitchhiker  0.00221536 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5890  Fe2+ transport system protein B  34.72 
 
 
620 aa  263  6.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3459  ferrous iron transport protein B  28.35 
 
 
715 aa  263  8.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000760098  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1933  ferrous iron transport protein B  28.26 
 
 
774 aa  262  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.651093  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0954  ferrous iron transport protein B  32.59 
 
 
626 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2670  ferrous iron transport protein B  30.03 
 
 
764 aa  263  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.360786  normal  0.0737302 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0793  ferrous iron transport protein B  33.64 
 
 
728 aa  262  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.585929  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0784  ferrous iron transport protein B  28.61 
 
 
711 aa  262  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  36.36 
 
 
662 aa  261  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3985  ferrous iron transport protein B  28.79 
 
 
771 aa  261  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1058  ferrous iron transport protein B  32.23 
 
 
626 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4947  ferrous iron transport protein B  36.36 
 
 
662 aa  261  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1161  ferrous iron transport protein B  34.71 
 
 
632 aa  261  3e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.233706  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0168  ferrous iron transport protein B  28.79 
 
 
771 aa  260  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.426324  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1922  ferrous iron transport protein B  34.44 
 
 
617 aa  260  6e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1784  ferrous iron transport protein B  29.78 
 
 
764 aa  260  6e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3746  ferrous iron transport protein B  28.79 
 
 
771 aa  260  6e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  36.6 
 
 
662 aa  259  7e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>