More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2176 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1860  ferrous iron transport protein B  58.97 
 
 
617 aa  688    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1329  ferrous iron transport protein B  58.6 
 
 
637 aa  686    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0251  ferrous IRON transport B transmembrane protein  63.58 
 
 
621 aa  728    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.563283  normal  0.119264 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0623  ferrous iron transport protein B  57.99 
 
 
637 aa  684    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.356093  normal  0.228705 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5429  ferrous iron transport B domain-containing protein  65.21 
 
 
617 aa  726    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.895542  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2975  ferrous iron transport protein B  57.37 
 
 
626 aa  685    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.949455  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5116  ferrous iron transport protein B  57.4 
 
 
626 aa  672    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4061  ferrous iron transport protein B  63.15 
 
 
621 aa  714    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0954  ferrous iron transport protein B  56.91 
 
 
626 aa  665    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1804  ferrous iron transport protein B  60.39 
 
 
621 aa  710    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.529813  normal  0.0419932 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0064  ferrous iron transport protein B  61.77 
 
 
628 aa  681    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.956131  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2176  ferrous iron transport protein B  100 
 
 
647 aa  1284    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1058  ferrous iron transport protein B  56.57 
 
 
626 aa  665    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1111  ferrous iron transport protein B  56.57 
 
 
626 aa  677    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5890  Fe2+ transport system protein B  64.89 
 
 
620 aa  754    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4039  ferrous iron transport protein B  56.13 
 
 
625 aa  653    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129654 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00098  ferrous iron transport protein B  61.35 
 
 
621 aa  703    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.069629  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1443  ferrous iron transport protein B  69.68 
 
 
631 aa  782    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0983772  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3948  ferrous iron transport protein B  63.15 
 
 
621 aa  714    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.648078 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47490  ferrous iron transport protein B  57.76 
 
 
615 aa  672    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1161  ferrous iron transport protein B  77.46 
 
 
632 aa  889    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.233706  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1922  ferrous iron transport protein B  59.58 
 
 
617 aa  684    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1471  transport protein B  63.27 
 
 
629 aa  707    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2434  ferrous iron transport protein B  76.15 
 
 
633 aa  909    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6110  ferrous iron transport protein B  54.8 
 
 
625 aa  611  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.218757  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2849  ferrous iron transport protein B  51.77 
 
 
618 aa  593  1e-168  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2451  ferrous iron transport protein B  53.65 
 
 
621 aa  586  1e-166  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0676  ferrous iron transport protein B  47.9 
 
 
636 aa  587  1e-166  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2987  ferrous iron transport protein B  54.95 
 
 
619 aa  578  1e-164  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0512994 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3827  ferrous iron transport protein B  37.3 
 
 
700 aa  483  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.792233 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3726  ferrous iron transport protein B  36.32 
 
 
696 aa  464  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0784  ferrous iron transport protein B  35.26 
 
 
711 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2567  ferrous iron transport protein B  40.25 
 
 
753 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1451  ferrous iron transport protein B  36.78 
 
 
705 aa  426  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0248254  normal  0.0823674 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1078  ferrous iron transport protein B  34.59 
 
 
665 aa  417  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.996842  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0962  ferrous iron transport protein B  35.44 
 
 
699 aa  412  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2011  GTP-binding protein, HSR1-related  41.21 
 
 
648 aa  394  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606318  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0779  ferrous iron transport protein B  35.54 
 
 
688 aa  391  1e-107  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328587  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1140  ferrous iron transport protein B  36.46 
 
 
680 aa  389  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000225033  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  33.69 
 
 
631 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5086  ferrous iron transport protein B  35.55 
 
 
712 aa  385  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000565138  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2434  ferrous iron transport protein B  33.8 
 
 
711 aa  382  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0984425  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2074  ferrous iron transport protein B  33.8 
 
 
712 aa  380  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03990  ferrous iron transport protein B-like protein  33.52 
 
 
699 aa  380  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.625523  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0108  ferrous iron transport protein B  32.69 
 
 
712 aa  381  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1709  ferrous iron transport protein B  37.44 
 
 
618 aa  375  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1631  ferrous iron transport protein B  32.91 
 
 
587 aa  373  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000698683  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0871  ferrous iron transport protein B  47.05 
 
 
716 aa  374  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0344  ferrous iron transport protein B  32.29 
 
 
724 aa  371  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00337716  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1913  ferrous iron transport protein B  32.1 
 
 
587 aa  369  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000339722  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2572  ferrous iron transport protein B  34.9 
 
 
664 aa  367  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2626  ferrous iron transport protein B  34.9 
 
 
664 aa  367  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.51649  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0970  ferrous iron transport protein B  33.88 
 
 
666 aa  369  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0839864 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0882  ferrous iron transport protein B  33.7 
 
 
720 aa  365  1e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000109469  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  36.55 
 
 
676 aa  363  6e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2126  ferrous iron transport protein B  33.28 
 
 
664 aa  361  2e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  34.46 
 
 
631 aa  361  3e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0895  ferrous iron transport protein B  33.68 
 
 
669 aa  360  5e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00236216  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  32.08 
 
 
669 aa  360  6e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0873  ferrous iron transport protein B  33.53 
 
 
667 aa  359  7e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101727  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0719  ferrous iron transport protein B  31.19 
 
 
829 aa  359  8e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0311256  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  32.61 
 
 
662 aa  355  1e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  32.47 
 
 
662 aa  355  1e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  32.61 
 
 
662 aa  355  1e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  31.94 
 
 
669 aa  355  1e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  32.47 
 
 
662 aa  354  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  33.09 
 
 
662 aa  353  5e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  32.47 
 
 
662 aa  353  8e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1458  ferrous iron transport protein B  31.93 
 
 
716 aa  352  8.999999999999999e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.137578  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2658  ferrous iron transport protein B  34.89 
 
 
664 aa  352  1e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4642  ferrous iron transport protein B  32.36 
 
 
662 aa  351  2e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3474  ferrous iron transport protein B  32.51 
 
 
662 aa  351  2e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2669  ferrous iron transport protein B  32.51 
 
 
725 aa  351  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4947  ferrous iron transport protein B  32.32 
 
 
662 aa  350  4e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4932  ferrous iron transport protein B  32.65 
 
 
662 aa  350  7e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0307  ferrous iron transport protein B  32.46 
 
 
662 aa  349  8e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1951  ferrous iron transport protein B  35.24 
 
 
680 aa  349  9e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0016959  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0316  ferrous iron transport protein B  32.33 
 
 
725 aa  348  1e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000873753  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0110  ferrous iron transport protein B  34.79 
 
 
668 aa  348  2e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0260348  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1343  ferrous iron transport protein B  34.64 
 
 
662 aa  345  2e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.547756  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3765  ferrous iron transport protein B  32.43 
 
 
743 aa  342  1e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0193  Fe2+ transport system protein B  32.79 
 
 
691 aa  339  9e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0283  ferrous iron transport protein B  29.93 
 
 
674 aa  336  9e-91  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0543  ferrous iron transport protein B  32.95 
 
 
669 aa  335  1e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00422143  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1508  ferrous iron transport protein B  31.59 
 
 
665 aa  335  2e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.225021  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0890  ferrous iron transport protein B  32.45 
 
 
684 aa  333  5e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3412  ferrous iron transport protein B  33.24 
 
 
740 aa  332  9e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3368  ferrous iron transport protein B  33.51 
 
 
740 aa  330  7e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1973  ferrous iron transport protein B  29.75 
 
 
718 aa  329  9e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1739  ferrous iron transport protein B  31.88 
 
 
646 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00069018  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4105  ferrous iron transport protein B  32.97 
 
 
738 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281443  normal  0.296674 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1785  ferrous iron transport protein B  31.97 
 
 
713 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.84236  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1452  ferrous iron transport protein B  31.52 
 
 
665 aa  326  6e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.789379  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0856  hypothetical protein  33.28 
 
 
649 aa  326  7e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.935712  normal  0.465758 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3268  ferrous iron transport protein B  32.74 
 
 
747 aa  325  2e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.309598  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4234  ferrous iron transport protein B  43.08 
 
 
722 aa  325  2e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.322995  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0618  ferrous iron transport protein B  31.2 
 
 
721 aa  324  3e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0536695  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3524  ferrous iron transport protein B  29.18 
 
 
697 aa  323  6e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000134401  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3293  ferrous iron transport protein B  33.33 
 
 
741 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.608312  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1583  ferrous iron transport protein B  30.62 
 
 
698 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.983768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>