More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0954 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2434  ferrous iron transport protein B  54.66 
 
 		 633 aa  660    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0251  ferrous IRON transport B transmembrane protein  56.93 
 
 		 621 aa  671    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.563283  normal  0.119264 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1804  ferrous iron transport protein B  54.7 
 
 		 621 aa  654    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.529813  normal  0.0419932 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4039  ferrous iron transport protein B  64.16 
 
 		 625 aa  779    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129654 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5429  ferrous iron transport B domain-containing protein  55.97 
 
 		 617 aa  649    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.895542  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2975  ferrous iron transport protein B  71.57 
 
 		 626 aa  894    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.949455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2176  ferrous iron transport protein B  56.91 
 
 		 647 aa  672    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0954  ferrous iron transport protein B  100 
 
 		 626 aa  1253    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1058  ferrous iron transport protein B  90.89 
 
 		 626 aa  1111    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1111  ferrous iron transport protein B  71.41 
 
 		 626 aa  893    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5890  Fe2+ transport system protein B  57.92 
 
 		 620 aa  696    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1443  ferrous iron transport protein B  56.66 
 
 		 631 aa  646    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0983772  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5116  ferrous iron transport protein B  90.26 
 
 		 626 aa  1113    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4061  ferrous iron transport protein B  56.61 
 
 		 621 aa  658    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6110  ferrous iron transport protein B  80.48 
 
 		 625 aa  936    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.218757  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1161  ferrous iron transport protein B  54.11 
 
 		 632 aa  640    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.233706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00098  ferrous iron transport protein B  55.59 
 
 		 621 aa  662    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.069629  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3948  ferrous iron transport protein B  56.61 
 
 		 621 aa  658    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.648078 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1471  transport protein B  55.36 
 
 		 629 aa  639    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1860  ferrous iron transport protein B  52.64 
 
 		 617 aa  614  9.999999999999999e-175  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47490  ferrous iron transport protein B  51.35 
 
 		 615 aa  607  9.999999999999999e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1329  ferrous iron transport protein B  51.49 
 
 		 637 aa  606  9.999999999999999e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1922  ferrous iron transport protein B  52.48 
 
 		 617 aa  603  1.0000000000000001e-171  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0064  ferrous iron transport protein B  52.99 
 
 		 628 aa  601  1e-170  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.956131  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0623  ferrous iron transport protein B  50.8 
 
 		 637 aa  599  1e-170  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.356093  normal  0.228705 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0676  ferrous iron transport protein B  50.32 
 
 		 636 aa  601  1e-170  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2849  ferrous iron transport protein B  50.24 
 
 		 618 aa  590  1e-167  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2451  ferrous iron transport protein B  51.85 
 
 		 621 aa  587  1e-166  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2987  ferrous iron transport protein B  53.38 
 
 		 619 aa  547  1e-154  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0512994 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0871  ferrous iron transport protein B  40.72 
 
 		 716 aa  476  1e-133  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0784  ferrous iron transport protein B  37.55 
 
 		 711 aa  460  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3827  ferrous iron transport protein B  36.01 
 
 		 700 aa  457  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.792233 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2567  ferrous iron transport protein B  39.39 
 
 		 753 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3726  ferrous iron transport protein B  35.63 
 
 		 696 aa  431  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2011  GTP-binding protein, HSR1-related  40.79 
 
 		 648 aa  431  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606318  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1078  ferrous iron transport protein B  35.61 
 
 		 665 aa  417  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.996842  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0962  ferrous iron transport protein B  36.69 
 
 		 699 aa  412  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1451  ferrous iron transport protein B  36.15 
 
 		 705 aa  399  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0248254  normal  0.0823674 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03990  ferrous iron transport protein B-like protein  35.01 
 
 		 699 aa  397  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.625523  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0779  ferrous iron transport protein B  34.58 
 
 		 688 aa  390  1e-107  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328587  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1929  ferrous iron transport protein B  32.45 
 
 		 712 aa  386  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000762105  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2434  ferrous iron transport protein B  33.1 
 
 		 711 aa  386  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0984425  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  37.57 
 
 		 676 aa  385  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2074  ferrous iron transport protein B  33.52 
 
 		 712 aa  380  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1709  ferrous iron transport protein B  39.97 
 
 		 618 aa  379  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0873  ferrous iron transport protein B  35.43 
 
 		 667 aa  373  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  33.48 
 
 		 669 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2658  ferrous iron transport protein B  35.58 
 
 		 664 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0895  ferrous iron transport protein B  35.43 
 
 		 669 aa  374  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00236216  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  33.92 
 
 		 662 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  34.26 
 
 		 662 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  33.92 
 
 		 662 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  34.06 
 
 		 662 aa  371  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  34.16 
 
 		 662 aa  371  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4947  ferrous iron transport protein B  34.06 
 
 		 662 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4642  ferrous iron transport protein B  34.4 
 
 		 662 aa  371  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  33.92 
 
 		 662 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  33.48 
 
 		 669 aa  372  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1913  ferrous iron transport protein B  34.19 
 
 		 587 aa  371  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000339722  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1631  ferrous iron transport protein B  34.03 
 
 		 587 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000698683  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4932  ferrous iron transport protein B  34.06 
 
 		 662 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0307  ferrous iron transport protein B  33.92 
 
 		 662 aa  366  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  35.47 
 
 		 631 aa  368  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1508  ferrous iron transport protein B  33.63 
 
 		 665 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.225021  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1452  ferrous iron transport protein B  33.88 
 
 		 665 aa  365  1e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.789379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  35.78 
 
 		 631 aa  365  2e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2213  ferrous iron transport protein B  32.5 
 
 		 713 aa  363  4e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5086  ferrous iron transport protein B  34.94 
 
 		 712 aa  363  7.0000000000000005e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000565138  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0344  ferrous iron transport protein B  32.84 
 
 		 724 aa  362  9e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00337716  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0856  hypothetical protein  36.34 
 
 		 649 aa  362  1e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.935712  normal  0.465758 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1458  ferrous iron transport protein B  33.77 
 
 		 716 aa  361  3e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.137578  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1140  ferrous iron transport protein B  34.1 
 
 		 680 aa  361  3e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000225033  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3474  ferrous iron transport protein B  34.26 
 
 		 662 aa  359  8e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0719  ferrous iron transport protein B  34.11 
 
 		 829 aa  359  8e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0311256  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3293  ferrous iron transport protein B  32.75 
 
 		 741 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.608312  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0095  ferrous iron transport protein B  35.52 
 
 		 676 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2843  ferrous iron transport protein B  33.24 
 
 		 712 aa  354  2e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2325  ferrous iron transport protein B  34.47 
 
 		 666 aa  352  8.999999999999999e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.907395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0890  ferrous iron transport protein B  33.77 
 
 		 684 aa  352  1e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0543  ferrous iron transport protein B  34.34 
 
 		 669 aa  350  4e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00422143  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0283  ferrous iron transport protein B  31.71 
 
 		 674 aa  350  5e-95  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1785  ferrous iron transport protein B  33.29 
 
 		 713 aa  350  6e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.84236  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2464  ferrous iron transport protein B  32.78 
 
 		 712 aa  348  1e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.967572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2572  ferrous iron transport protein B  32.51 
 
 		 664 aa  345  1e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4234  ferrous iron transport protein B  43.21 
 
 		 722 aa  345  1e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.322995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2626  ferrous iron transport protein B  32.51 
 
 		 664 aa  345  1e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.51649  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1761  ferrous iron transport protein B  30.66 
 
 		 711 aa  339  7e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0193  Fe2+ transport system protein B  33.38 
 
 		 691 aa  335  1e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0675  ferrous iron transport protein B  31.17 
 
 		 732 aa  335  1e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.183925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3368  ferrous iron transport protein B  32.88 
 
 		 740 aa  335  2e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0618  ferrous iron transport protein B  31.88 
 
 		 721 aa  334  2e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0536695  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0976  ferrous iron transport protein B  33.19 
 
 		 676 aa  333  7.000000000000001e-90  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00114707  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1739  ferrous iron transport protein B  32.43 
 
 		 646 aa  331  2e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00069018  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2126  ferrous iron transport protein B  33.24 
 
 		 664 aa  330  4e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1585  ferrous iron transport protein B  32.5 
 
 		 723 aa  324  3e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0104102  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0966  ferrous iron transport protein B  32.59 
 
 		 669 aa  322  1.9999999999999998e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2809  ferrous iron transport protein B  33.66 
 
 		 597 aa  321  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.123024 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56680  ferrous iron transport protein B  33.33 
 
 		 766 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4929  ferrous iron transport protein B  33.06 
 
 		 766 aa  317  6e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875416  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0316  ferrous iron transport protein B  31.29 
 
 		 725 aa  316  9.999999999999999e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000873753  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>