More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1111 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_5116  ferrous iron transport protein B  71.09 
 
 		 626 aa  885    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0251  ferrous IRON transport B transmembrane protein  57.07 
 
 		 621 aa  656    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.563283  normal  0.119264 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4061  ferrous iron transport protein B  57.4 
 
 		 621 aa  654    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3948  ferrous iron transport protein B  57.4 
 
 		 621 aa  654    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.648078 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2975  ferrous iron transport protein B  95.21 
 
 		 626 aa  1177    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.949455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4039  ferrous iron transport protein B  65.48 
 
 		 625 aa  786    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129654 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0954  ferrous iron transport protein B  71.41 
 
 		 626 aa  881    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1058  ferrous iron transport protein B  72.04 
 
 		 626 aa  896    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1111  ferrous iron transport protein B  100 
 
 		 626 aa  1252    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5890  Fe2+ transport system protein B  56.63 
 
 		 620 aa  661    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1443  ferrous iron transport protein B  58.48 
 
 		 631 aa  668    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0983772  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2176  ferrous iron transport protein B  56.57 
 
 		 647 aa  678    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00098  ferrous iron transport protein B  53.96 
 
 		 621 aa  637    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.069629  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1161  ferrous iron transport protein B  55.86 
 
 		 632 aa  653    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.233706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1804  ferrous iron transport protein B  53.96 
 
 		 621 aa  647    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.529813  normal  0.0419932 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6110  ferrous iron transport protein B  71.08 
 
 		 625 aa  825    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.218757  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2434  ferrous iron transport protein B  53.83 
 
 		 633 aa  644    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5429  ferrous iron transport B domain-containing protein  56.77 
 
 		 617 aa  633  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.895542  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1471  transport protein B  55.59 
 
 		 629 aa  630  1e-179  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1860  ferrous iron transport protein B  52.34 
 
 		 617 aa  609  1e-173  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1329  ferrous iron transport protein B  51.27 
 
 		 637 aa  607  9.999999999999999e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1922  ferrous iron transport protein B  52.67 
 
 		 617 aa  601  1e-170  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0623  ferrous iron transport protein B  50.64 
 
 		 637 aa  596  1e-169  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.356093  normal  0.228705 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0064  ferrous iron transport protein B  54.19 
 
 		 628 aa  593  1e-168  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.956131  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2451  ferrous iron transport protein B  53.56 
 
 		 621 aa  592  1e-168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47490  ferrous iron transport protein B  51.87 
 
 		 615 aa  590  1e-167  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0676  ferrous iron transport protein B  48.95 
 
 		 636 aa  585  1e-166  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2849  ferrous iron transport protein B  50.24 
 
 		 618 aa  558  1e-158  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2987  ferrous iron transport protein B  53.77 
 
 		 619 aa  559  1e-158  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0512994 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3827  ferrous iron transport protein B  35.62 
 
 		 700 aa  460  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.792233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0784  ferrous iron transport protein B  37.13 
 
 		 711 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2567  ferrous iron transport protein B  37.57 
 
 		 753 aa  451  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3726  ferrous iron transport protein B  34.78 
 
 		 696 aa  440  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0962  ferrous iron transport protein B  34.38 
 
 		 699 aa  407  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1451  ferrous iron transport protein B  36.56 
 
 		 705 aa  407  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0248254  normal  0.0823674 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1078  ferrous iron transport protein B  33.43 
 
 		 665 aa  404  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.996842  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2011  GTP-binding protein, HSR1-related  39.31 
 
 		 648 aa  396  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606318  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1140  ferrous iron transport protein B  35.12 
 
 		 680 aa  395  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000225033  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1709  ferrous iron transport protein B  38.81 
 
 		 618 aa  393  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03990  ferrous iron transport protein B-like protein  33.53 
 
 		 699 aa  387  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.625523  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2434  ferrous iron transport protein B  33.56 
 
 		 711 aa  382  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0984425  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0970  ferrous iron transport protein B  35.88 
 
 		 666 aa  380  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0839864 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0110  ferrous iron transport protein B  35.52 
 
 		 668 aa  381  1e-104  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0260348  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2658  ferrous iron transport protein B  34.78 
 
 		 664 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  33.48 
 
 		 662 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0873  ferrous iron transport protein B  34.18 
 
 		 667 aa  378  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101727  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0895  ferrous iron transport protein B  34.18 
 
 		 669 aa  377  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00236216  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1913  ferrous iron transport protein B  35.05 
 
 		 587 aa  376  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000339722  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1631  ferrous iron transport protein B  34.73 
 
 		 587 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000698683  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1343  ferrous iron transport protein B  34.89 
 
 		 662 aa  372  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.547756  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  37.06 
 
 		 676 aa  369  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  33.04 
 
 		 662 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4932  ferrous iron transport protein B  32.9 
 
 		 662 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4947  ferrous iron transport protein B  33.19 
 
 		 662 aa  372  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4642  ferrous iron transport protein B  33.19 
 
 		 662 aa  371  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0307  ferrous iron transport protein B  33.19 
 
 		 662 aa  369  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  33.09 
 
 		 662 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1929  ferrous iron transport protein B  32.37 
 
 		 712 aa  366  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000762105  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  33.09 
 
 		 662 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0779  ferrous iron transport protein B  33.81 
 
 		 688 aa  368  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328587  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  35.1 
 
 		 631 aa  369  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2464  ferrous iron transport protein B  31.44 
 
 		 712 aa  367  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.967572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  33.09 
 
 		 662 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1458  ferrous iron transport protein B  34.73 
 
 		 716 aa  365  1e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.137578  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  32.9 
 
 		 662 aa  364  2e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2074  ferrous iron transport protein B  31.99 
 
 		 712 aa  364  2e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2843  ferrous iron transport protein B  33.19 
 
 		 712 aa  364  3e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2126  ferrous iron transport protein B  33.09 
 
 		 664 aa  362  1e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2572  ferrous iron transport protein B  32.8 
 
 		 664 aa  361  2e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2626  ferrous iron transport protein B  32.8 
 
 		 664 aa  361  2e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.51649  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1452  ferrous iron transport protein B  34.47 
 
 		 665 aa  361  2e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.789379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2325  ferrous iron transport protein B  35.1 
 
 		 666 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.907395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  34.58 
 
 		 631 aa  356  7.999999999999999e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2213  ferrous iron transport protein B  31.22 
 
 		 713 aa  355  1e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  30.86 
 
 		 669 aa  348  2e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1583  ferrous iron transport protein B  30.48 
 
 		 698 aa  348  2e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.983768  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0890  ferrous iron transport protein B  34.5 
 
 		 684 aa  347  4e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0871  ferrous iron transport protein B  45.15 
 
 		 716 aa  346  8e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0719  ferrous iron transport protein B  31.76 
 
 		 829 aa  345  1e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0311256  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  30.98 
 
 		 669 aa  345  2e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0193  Fe2+ transport system protein B  33.87 
 
 		 691 aa  344  2e-93  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3765  ferrous iron transport protein B  30.09 
 
 		 743 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4234  ferrous iron transport protein B  43.78 
 
 		 722 aa  343  5.999999999999999e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.322995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0543  ferrous iron transport protein B  34.16 
 
 		 669 aa  343  8e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00422143  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0856  hypothetical protein  34.33 
 
 		 649 aa  342  1e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.935712  normal  0.465758 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0283  ferrous iron transport protein B  32.45 
 
 		 674 aa  340  4e-92  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0108  ferrous iron transport protein B  31.57 
 
 		 712 aa  340  5.9999999999999996e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1739  ferrous iron transport protein B  31.4 
 
 		 646 aa  335  2e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00069018  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1761  ferrous iron transport protein B  30.43 
 
 		 711 aa  334  4e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3524  ferrous iron transport protein B  31.59 
 
 		 697 aa  330  3e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000134401  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2809  ferrous iron transport protein B  32.7 
 
 		 597 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.123024 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4929  ferrous iron transport protein B  35.73 
 
 		 766 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875416  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0259  ferrous iron transport protein B  31.19 
 
 		 628 aa  315  1.9999999999999998e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00038951  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2470  ferrous iron transport protein B  35.02 
 
 		 786 aa  314  3.9999999999999997e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0901  ferrous iron transport protein B  27.85 
 
 		 708 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000608812  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56680  ferrous iron transport protein B  35.14 
 
 		 766 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2878  ferrous iron transport protein B  30.81 
 
 		 606 aa  308  1.0000000000000001e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0506695 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3368  ferrous iron transport protein B  29.95 
 
 		 740 aa  307  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1938  ferrous iron transport protein B  35.37 
 
 		 647 aa  306  6e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.31907  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1951  ferrous iron transport protein B  39.72 
 
 		 680 aa  303  5.000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0016959  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>