More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1443 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4061  ferrous iron transport protein B  64.43 
 
 		 621 aa  735    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1922  ferrous iron transport protein B  60.75 
 
 		 617 aa  690    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47490  ferrous iron transport protein B  56.42 
 
 		 615 aa  647    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0251  ferrous IRON transport B transmembrane protein  65.52 
 
 		 621 aa  757    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.563283  normal  0.119264 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0623  ferrous iron transport protein B  62 
 
 		 637 aa  724    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.356093  normal  0.228705 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5429  ferrous iron transport B domain-containing protein  67.8 
 
 		 617 aa  763    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.895542  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3948  ferrous iron transport protein B  64.43 
 
 		 621 aa  735    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.648078 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2975  ferrous iron transport protein B  59.29 
 
 		 626 aa  709    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.949455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1860  ferrous iron transport protein B  61.24 
 
 		 617 aa  708    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1443  ferrous iron transport protein B  100 
 
 		 631 aa  1256    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0983772  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5116  ferrous iron transport protein B  57.85 
 
 		 626 aa  684    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0954  ferrous iron transport protein B  56.66 
 
 		 626 aa  668    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0064  ferrous iron transport protein B  64.47 
 
 		 628 aa  713    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.956131  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1058  ferrous iron transport protein B  56.57 
 
 		 626 aa  665    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1111  ferrous iron transport protein B  58.64 
 
 		 626 aa  701    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5890  Fe2+ transport system protein B  68.36 
 
 		 620 aa  796    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4039  ferrous iron transport protein B  58.06 
 
 		 625 aa  659    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129654 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1804  ferrous iron transport protein B  63.12 
 
 		 621 aa  749    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.529813  normal  0.0419932 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00098  ferrous iron transport protein B  62.54 
 
 		 621 aa  742    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.069629  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2434  ferrous iron transport protein B  71.41 
 
 		 633 aa  857    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1329  ferrous iron transport protein B  60.9 
 
 		 637 aa  709    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1161  ferrous iron transport protein B  74.92 
 
 		 632 aa  860    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.233706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1471  transport protein B  66.45 
 
 		 629 aa  757    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2176  ferrous iron transport protein B  70.32 
 
 		 647 aa  830    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6110  ferrous iron transport protein B  57.33 
 
 		 625 aa  631  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.218757  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0676  ferrous iron transport protein B  50.56 
 
 		 636 aa  597  1e-169  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2451  ferrous iron transport protein B  55.03 
 
 		 621 aa  594  1e-168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2849  ferrous iron transport protein B  51.13 
 
 		 618 aa  577  1.0000000000000001e-163  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2987  ferrous iron transport protein B  54.18 
 
 		 619 aa  567  1e-160  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0512994 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3726  ferrous iron transport protein B  36.23 
 
 		 696 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2567  ferrous iron transport protein B  40.24 
 
 		 753 aa  443  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0784  ferrous iron transport protein B  35.86 
 
 		 711 aa  431  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1078  ferrous iron transport protein B  36.02 
 
 		 665 aa  426  1e-118  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.996842  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3827  ferrous iron transport protein B  35.06 
 
 		 700 aa  425  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.792233 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0779  ferrous iron transport protein B  36.73 
 
 		 688 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328587  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0962  ferrous iron transport protein B  34.15 
 
 		 699 aa  405  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0871  ferrous iron transport protein B  47.81 
 
 		 716 aa  395  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  34.43 
 
 		 631 aa  385  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1709  ferrous iron transport protein B  38.8 
 
 		 618 aa  385  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1294  ferrous iron transport protein B  34.57 
 
 		 844 aa  379  1e-104  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2011  GTP-binding protein, HSR1-related  39.08 
 
 		 648 aa  373  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606318  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1631  ferrous iron transport protein B  34.42 
 
 		 587 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000698683  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1913  ferrous iron transport protein B  34.42 
 
 		 587 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000339722  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2572  ferrous iron transport protein B  33.43 
 
 		 664 aa  364  2e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2626  ferrous iron transport protein B  33.43 
 
 		 664 aa  364  2e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.51649  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1951  ferrous iron transport protein B  34.74 
 
 		 680 aa  365  2e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0016959  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0095  ferrous iron transport protein B  35.75 
 
 		 676 aa  360  5e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  33.04 
 
 		 662 aa  360  5e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  33.04 
 
 		 662 aa  360  5e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  32.89 
 
 		 662 aa  359  7e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2658  ferrous iron transport protein B  34.75 
 
 		 664 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  32.89 
 
 		 662 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  34.54 
 
 		 631 aa  356  7.999999999999999e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  32.76 
 
 		 669 aa  350  5e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  32.56 
 
 		 669 aa  347  5e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1973  ferrous iron transport protein B  31.4 
 
 		 718 aa  346  8e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0856  hypothetical protein  34.58 
 
 		 649 aa  345  1e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.935712  normal  0.465758 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1140  ferrous iron transport protein B  34.05 
 
 		 680 aa  345  2e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000225033  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0882  ferrous iron transport protein B  32.78 
 
 		 720 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000109469  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5086  ferrous iron transport protein B  33.9 
 
 		 712 aa  342  1e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000565138  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0970  ferrous iron transport protein B  34.22 
 
 		 666 aa  341  2e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0839864 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0890  ferrous iron transport protein B  33.91 
 
 		 684 aa  340  2.9999999999999998e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0654  Fe2+ transport system protein B  33.24 
 
 		 712 aa  340  2.9999999999999998e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0193  Fe2+ transport system protein B  33.78 
 
 		 691 aa  340  5e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3412  ferrous iron transport protein B  33.06 
 
 		 740 aa  333  4e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1451  ferrous iron transport protein B  40.59 
 
 		 705 aa  332  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0248254  normal  0.0823674 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  33.29 
 
 		 676 aa  331  2e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3368  ferrous iron transport protein B  32.74 
 
 		 740 aa  331  3e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1088  ferrous iron transport protein B  30.86 
 
 		 753 aa  328  2.0000000000000001e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000362942  hitchhiker  0.0000000000000163165 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0976  ferrous iron transport protein B  34.94 
 
 		 676 aa  323  5e-87  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00114707  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1458  ferrous iron transport protein B  31.63 
 
 		 716 aa  323  6e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.137578  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0873  ferrous iron transport protein B  31.39 
 
 		 667 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101727  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0895  ferrous iron transport protein B  31.39 
 
 		 669 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00236216  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1785  ferrous iron transport protein B  32.15 
 
 		 713 aa  320  5e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.84236  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4234  ferrous iron transport protein B  40.05 
 
 		 722 aa  317  3e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.322995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56680  ferrous iron transport protein B  33.43 
 
 		 766 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3293  ferrous iron transport protein B  32.75 
 
 		 741 aa  313  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.608312  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2071  ferrous iron transport protein B  34.72 
 
 		 774 aa  313  5.999999999999999e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1929  ferrous iron transport protein B  37.87 
 
 		 712 aa  311  2e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000762105  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4929  ferrous iron transport protein B  32.7 
 
 		 766 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875416  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0754  ferrous iron transport protein B  34.54 
 
 		 786 aa  311  2.9999999999999997e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0018483  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3459  ferrous iron transport protein B  32.28 
 
 		 715 aa  310  4e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000760098  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20050  ferrous iron transporter FeoB  33.29 
 
 		 749 aa  310  5e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.558981  normal  0.661098 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0259  ferrous iron transport protein B  32.87 
 
 		 628 aa  310  5.9999999999999995e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00038951  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1194  ferrous iron transport protein B  32.03 
 
 		 714 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1761  ferrous iron transport protein B  29.8 
 
 		 711 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0434  ferrous iron transport protein B  30.99 
 
 		 665 aa  305  2.0000000000000002e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3383  ferrous iron transport protein B  36.74 
 
 		 683 aa  303  5.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.378196 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2809  ferrous iron transport protein B  34.19 
 
 		 597 aa  303  9e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.123024 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0654  ferrous iron transport protein B  33.54 
 
 		 693 aa  301  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0286  Fe2+ transport system protein B  30.48 
 
 		 704 aa  301  2e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0107  ferrous iron transport protein B  32.35 
 
 		 778 aa  301  3e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.803376  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1938  ferrous iron transport protein B  34.28 
 
 		 647 aa  301  3e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.31907  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0108  ferrous iron transport protein B  36.3 
 
 		 712 aa  300  5e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2878  ferrous iron transport protein B  31.08 
 
 		 606 aa  299  8e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0506695 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0735  ferrous iron transport protein B  30.86 
 
 		 648 aa  298  2e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.56734  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03990  ferrous iron transport protein B-like protein  39.07 
 
 		 699 aa  298  2e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.625523  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1933  ferrous iron transport protein B  33.28 
 
 		 774 aa  297  4e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.651093  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2152  ferrous iron transport protein B  32.03 
 
 		 782 aa  296  7e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.264076  hitchhiker  0.0000442692 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2434  ferrous iron transport protein B  37.16 
 
 		 711 aa  296  9e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0984425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>