More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2451 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2849  ferrous iron transport protein B  63.18 
 
 
618 aa  757    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2987  ferrous iron transport protein B  69.31 
 
 
619 aa  766    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0512994 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2451  ferrous iron transport protein B  100 
 
 
621 aa  1232    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2434  ferrous iron transport protein B  55.17 
 
 
633 aa  622  1e-177  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4039  ferrous iron transport protein B  54.07 
 
 
625 aa  615  1e-175  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129654 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1161  ferrous iron transport protein B  56.34 
 
 
632 aa  616  1e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.233706  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1471  transport protein B  57.54 
 
 
629 aa  615  1e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1329  ferrous iron transport protein B  52.46 
 
 
637 aa  610  1e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4061  ferrous iron transport protein B  56.51 
 
 
621 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2975  ferrous iron transport protein B  53.25 
 
 
626 aa  604  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.949455  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3948  ferrous iron transport protein B  56.51 
 
 
621 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.648078 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1804  ferrous iron transport protein B  52.43 
 
 
621 aa  602  1.0000000000000001e-171  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.529813  normal  0.0419932 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0623  ferrous iron transport protein B  51.83 
 
 
637 aa  603  1.0000000000000001e-171  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.356093  normal  0.228705 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0251  ferrous IRON transport B transmembrane protein  55.77 
 
 
621 aa  598  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.563283  normal  0.119264 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47490  ferrous iron transport protein B  53.65 
 
 
615 aa  600  1e-170  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1111  ferrous iron transport protein B  53.56 
 
 
626 aa  599  1e-170  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00098  ferrous iron transport protein B  52.43 
 
 
621 aa  598  1e-170  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.069629  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5890  Fe2+ transport system protein B  54.95 
 
 
620 aa  597  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2176  ferrous iron transport protein B  53.65 
 
 
647 aa  589  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5116  ferrous iron transport protein B  52.11 
 
 
626 aa  589  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1860  ferrous iron transport protein B  52.17 
 
 
617 aa  585  1e-166  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0954  ferrous iron transport protein B  51.95 
 
 
626 aa  586  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1058  ferrous iron transport protein B  51.79 
 
 
626 aa  581  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0064  ferrous iron transport protein B  53.62 
 
 
628 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.956131  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1443  ferrous iron transport protein B  54.89 
 
 
631 aa  576  1.0000000000000001e-163  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0983772  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1922  ferrous iron transport protein B  51.62 
 
 
617 aa  575  1.0000000000000001e-163  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5429  ferrous iron transport B domain-containing protein  54.89 
 
 
617 aa  568  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.895542  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6110  ferrous iron transport protein B  51.52 
 
 
625 aa  548  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.218757  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0676  ferrous iron transport protein B  47.42 
 
 
636 aa  524  1e-147  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3726  ferrous iron transport protein B  37.87 
 
 
696 aa  458  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3827  ferrous iron transport protein B  35.4 
 
 
700 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.792233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0784  ferrous iron transport protein B  36.6 
 
 
711 aa  452  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1078  ferrous iron transport protein B  37.31 
 
 
665 aa  451  1e-125  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.996842  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2567  ferrous iron transport protein B  38.47 
 
 
753 aa  438  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1451  ferrous iron transport protein B  36.39 
 
 
705 aa  417  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0248254  normal  0.0823674 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5086  ferrous iron transport protein B  38.55 
 
 
712 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000565138  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0962  ferrous iron transport protein B  35.16 
 
 
699 aa  397  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0779  ferrous iron transport protein B  37.57 
 
 
688 aa  393  1e-108  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328587  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  36.44 
 
 
662 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2325  ferrous iron transport protein B  37.7 
 
 
666 aa  393  1e-108  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.907395  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4642  ferrous iron transport protein B  36.14 
 
 
662 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  36.01 
 
 
662 aa  390  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  36.3 
 
 
662 aa  392  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  36.3 
 
 
662 aa  391  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  36.3 
 
 
662 aa  389  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  36.3 
 
 
662 aa  392  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4932  ferrous iron transport protein B  36.3 
 
 
662 aa  390  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2011  GTP-binding protein, HSR1-related  41.15 
 
 
648 aa  389  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606318  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4947  ferrous iron transport protein B  36.3 
 
 
662 aa  389  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03990  ferrous iron transport protein B-like protein  35.36 
 
 
699 aa  387  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.625523  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  37.19 
 
 
676 aa  386  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0307  ferrous iron transport protein B  35.86 
 
 
662 aa  384  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3474  ferrous iron transport protein B  34.69 
 
 
662 aa  378  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  33.28 
 
 
669 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2126  ferrous iron transport protein B  34.06 
 
 
664 aa  369  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0871  ferrous iron transport protein B  47.12 
 
 
716 aa  371  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1343  ferrous iron transport protein B  36.63 
 
 
662 aa  371  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.547756  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  33.14 
 
 
669 aa  371  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1729  ferrous iron transport protein B  33.38 
 
 
717 aa  372  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0580785 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1631  ferrous iron transport protein B  34.2 
 
 
587 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000698683  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  34.8 
 
 
631 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0719  ferrous iron transport protein B  32.23 
 
 
829 aa  367  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0311256  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1913  ferrous iron transport protein B  34.04 
 
 
587 aa  365  2e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000339722  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  36.01 
 
 
631 aa  362  9e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0095  ferrous iron transport protein B  35.64 
 
 
676 aa  362  1e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0110  ferrous iron transport protein B  34.88 
 
 
668 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0260348  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1951  ferrous iron transport protein B  34.69 
 
 
680 aa  355  1e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0016959  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0793  ferrous iron transport protein B  32.18 
 
 
728 aa  352  1e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.585929  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2434  ferrous iron transport protein B  32.35 
 
 
711 aa  346  7e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0984425  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0108  ferrous iron transport protein B  31.46 
 
 
712 aa  346  7e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3268  ferrous iron transport protein B  32.04 
 
 
747 aa  339  9.999999999999999e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.309598  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1140  ferrous iron transport protein B  32.71 
 
 
680 aa  339  9.999999999999999e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000225033  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3293  ferrous iron transport protein B  32.7 
 
 
741 aa  336  7.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.608312  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0856  hypothetical protein  34.78 
 
 
649 aa  335  1e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.935712  normal  0.465758 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0890  ferrous iron transport protein B  33.38 
 
 
684 aa  335  2e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2464  ferrous iron transport protein B  30.21 
 
 
712 aa  334  2e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.967572  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2843  ferrous iron transport protein B  31.34 
 
 
712 aa  334  3e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3412  ferrous iron transport protein B  32.21 
 
 
740 aa  333  4e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0618  ferrous iron transport protein B  31.63 
 
 
721 aa  333  6e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0536695  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3368  ferrous iron transport protein B  32.88 
 
 
740 aa  333  8e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1709  ferrous iron transport protein B  34.97 
 
 
618 aa  332  1e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1458  ferrous iron transport protein B  31.24 
 
 
716 aa  331  2e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.137578  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1973  ferrous iron transport protein B  30.03 
 
 
718 aa  329  9e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0754  ferrous iron transport protein B  32.17 
 
 
786 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0018483  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0193  Fe2+ transport system protein B  31.1 
 
 
691 aa  327  5e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0543  ferrous iron transport protein B  34.42 
 
 
669 aa  325  1e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00422143  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0286  Fe2+ transport system protein B  30.61 
 
 
704 aa  321  3e-86  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1739  ferrous iron transport protein B  31.24 
 
 
646 aa  319  9e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00069018  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0675  ferrous iron transport protein B  31.58 
 
 
732 aa  318  2e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.183925  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4234  ferrous iron transport protein B  40.04 
 
 
722 aa  318  3e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.322995  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1761  ferrous iron transport protein B  30.74 
 
 
711 aa  315  9.999999999999999e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20050  ferrous iron transporter FeoB  31.66 
 
 
749 aa  316  9.999999999999999e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.558981  normal  0.661098 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2658  ferrous iron transport protein B  33.72 
 
 
664 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1569  ferrous iron transport protein B  30.7 
 
 
646 aa  313  6.999999999999999e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0107  ferrous iron transport protein B  32.89 
 
 
778 aa  312  1e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.803376  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3855  hypothetical protein  33.97 
 
 
776 aa  312  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107886  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1713  ferrous iron transport protein B  29.02 
 
 
645 aa  310  4e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.340113  normal  0.969498 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1583  ferrous iron transport protein B  31.93 
 
 
698 aa  310  5e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.983768  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0198  ferrous iron transport protein B  29.9 
 
 
645 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0259  ferrous iron transport protein B  32.06 
 
 
628 aa  308  2.0000000000000002e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00038951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>