More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5116 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_3948  ferrous iron transport protein B  56.38 
 
 		 621 aa  664    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.648078 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2176  ferrous iron transport protein B  57.4 
 
 		 647 aa  683    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1443  ferrous iron transport protein B  57.3 
 
 		 631 aa  660    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0983772  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0251  ferrous IRON transport B transmembrane protein  56.63 
 
 		 621 aa  674    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.563283  normal  0.119264 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1804  ferrous iron transport protein B  54.07 
 
 		 621 aa  659    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.529813  normal  0.0419932 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5429  ferrous iron transport B domain-containing protein  56.22 
 
 		 617 aa  650    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.895542  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2975  ferrous iron transport protein B  70.93 
 
 		 626 aa  889    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.949455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0954  ferrous iron transport protein B  90.26 
 
 		 626 aa  1111    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6110  ferrous iron transport protein B  80.64 
 
 		 625 aa  932    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.218757  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4061  ferrous iron transport protein B  56.38 
 
 		 621 aa  664    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4039  ferrous iron transport protein B  63.68 
 
 		 625 aa  773    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129654 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00098  ferrous iron transport protein B  54.47 
 
 		 621 aa  662    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.069629  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1058  ferrous iron transport protein B  90.42 
 
 		 626 aa  1115    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1111  ferrous iron transport protein B  71.09 
 
 		 626 aa  899    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5890  Fe2+ transport system protein B  57.67 
 
 		 620 aa  683    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5116  ferrous iron transport protein B  100 
 
 		 626 aa  1258    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1161  ferrous iron transport protein B  54.62 
 
 		 632 aa  647    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.233706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2434  ferrous iron transport protein B  54.77 
 
 		 633 aa  661    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1471  transport protein B  54.88 
 
 		 629 aa  633  1e-180  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1860  ferrous iron transport protein B  52.9 
 
 		 617 aa  616  1e-175  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1922  ferrous iron transport protein B  52.74 
 
 		 617 aa  602  1.0000000000000001e-171  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0623  ferrous iron transport protein B  50.55 
 
 		 637 aa  597  1e-169  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.356093  normal  0.228705 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0064  ferrous iron transport protein B  52.67 
 
 		 628 aa  597  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.956131  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1329  ferrous iron transport protein B  51.69 
 
 		 637 aa  598  1e-169  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2451  ferrous iron transport protein B  52.11 
 
 		 621 aa  594  1e-168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0676  ferrous iron transport protein B  49.04 
 
 		 636 aa  592  1e-168  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47490  ferrous iron transport protein B  50.24 
 
 		 615 aa  589  1e-167  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2849  ferrous iron transport protein B  50.48 
 
 		 618 aa  581  1e-164  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2987  ferrous iron transport protein B  52.31 
 
 		 619 aa  553  1e-156  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0512994 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2567  ferrous iron transport protein B  39.78 
 
 		 753 aa  475  1e-133  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0784  ferrous iron transport protein B  38.24 
 
 		 711 aa  474  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3827  ferrous iron transport protein B  35.1 
 
 		 700 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.792233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1451  ferrous iron transport protein B  37.14 
 
 		 705 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0248254  normal  0.0823674 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3726  ferrous iron transport protein B  35.3 
 
 		 696 aa  424  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2011  GTP-binding protein, HSR1-related  40.4 
 
 		 648 aa  425  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606318  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1078  ferrous iron transport protein B  35.61 
 
 		 665 aa  423  1e-117  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.996842  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0962  ferrous iron transport protein B  36.96 
 
 		 699 aa  420  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0970  ferrous iron transport protein B  36.86 
 
 		 666 aa  413  1e-114  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0839864 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03990  ferrous iron transport protein B-like protein  34.94 
 
 		 699 aa  400  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.625523  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2434  ferrous iron transport protein B  33.8 
 
 		 711 aa  390  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0984425  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1929  ferrous iron transport protein B  33.29 
 
 		 712 aa  387  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000762105  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2843  ferrous iron transport protein B  33.7 
 
 		 712 aa  380  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0344  ferrous iron transport protein B  33.11 
 
 		 724 aa  379  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00337716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  33.19 
 
 		 669 aa  376  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4932  ferrous iron transport protein B  34.21 
 
 		 662 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4642  ferrous iron transport protein B  34.36 
 
 		 662 aa  376  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2074  ferrous iron transport protein B  33.15 
 
 		 712 aa  375  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4947  ferrous iron transport protein B  33.92 
 
 		 662 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1709  ferrous iron transport protein B  38.08 
 
 		 618 aa  375  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  33.04 
 
 		 669 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0095  ferrous iron transport protein B  36.23 
 
 		 676 aa  371  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  33.63 
 
 		 662 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  33.48 
 
 		 662 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  33.63 
 
 		 662 aa  372  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0307  ferrous iron transport protein B  33.77 
 
 		 662 aa  370  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1452  ferrous iron transport protein B  34.96 
 
 		 665 aa  372  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.789379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  33.48 
 
 		 662 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  33.48 
 
 		 662 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0873  ferrous iron transport protein B  34.21 
 
 		 667 aa  367  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101727  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  33.43 
 
 		 662 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0895  ferrous iron transport protein B  34.21 
 
 		 669 aa  368  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00236216  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2698  ferrous iron transport protein B  40.07 
 
 		 780 aa  366  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.619661  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  35.27 
 
 		 631 aa  363  3e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2658  ferrous iron transport protein B  34.7 
 
 		 664 aa  363  4e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1631  ferrous iron transport protein B  33.39 
 
 		 587 aa  362  1e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000698683  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  36.41 
 
 		 631 aa  362  2e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1913  ferrous iron transport protein B  33.39 
 
 		 587 aa  360  5e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000339722  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1458  ferrous iron transport protein B  32.99 
 
 		 716 aa  357  3.9999999999999996e-97  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.137578  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0316  ferrous iron transport protein B  33.06 
 
 		 725 aa  356  5.999999999999999e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000873753  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0719  ferrous iron transport protein B  32.42 
 
 		 829 aa  356  7.999999999999999e-97  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0311256  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3474  ferrous iron transport protein B  33.19 
 
 		 662 aa  356  8.999999999999999e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1973  ferrous iron transport protein B  30.66 
 
 		 718 aa  355  2e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0856  hypothetical protein  35.57 
 
 		 649 aa  352  1e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.935712  normal  0.465758 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1785  ferrous iron transport protein B  33.33 
 
 		 713 aa  348  2e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.84236  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1951  ferrous iron transport protein B  35.78 
 
 		 680 aa  347  4e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0016959  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2464  ferrous iron transport protein B  32.5 
 
 		 712 aa  347  4e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.967572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0890  ferrous iron transport protein B  33.62 
 
 		 684 aa  345  2e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4234  ferrous iron transport protein B  42.89 
 
 		 722 aa  344  2.9999999999999997e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.322995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0543  ferrous iron transport protein B  33.72 
 
 		 669 aa  343  5e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00422143  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0976  ferrous iron transport protein B  34.01 
 
 		 676 aa  342  9e-93  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00114707  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0283  ferrous iron transport protein B  30.88 
 
 		 674 aa  342  2e-92  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0966  ferrous iron transport protein B  33.33 
 
 		 669 aa  339  8e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3765  ferrous iron transport protein B  31 
 
 		 743 aa  336  1e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2325  ferrous iron transport protein B  34.37 
 
 		 666 aa  335  2e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.907395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0871  ferrous iron transport protein B  40.99 
 
 		 716 aa  332  1e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1622  ferrous iron transport protein B  31.24 
 
 		 722 aa  332  2e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.782227  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0654  Fe2+ transport system protein B  31.79 
 
 		 712 aa  332  2e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0193  Fe2+ transport system protein B  33.14 
 
 		 691 aa  330  3e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1739  ferrous iron transport protein B  31.36 
 
 		 646 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00069018  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56680  ferrous iron transport protein B  33.24 
 
 		 766 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4929  ferrous iron transport protein B  33.38 
 
 		 766 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875416  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0110  ferrous iron transport protein B  33.04 
 
 		 668 aa  318  2e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0260348  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1938  ferrous iron transport protein B  35.38 
 
 		 647 aa  318  2e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.31907  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1761  ferrous iron transport protein B  29.17 
 
 		 711 aa  316  6e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2809  ferrous iron transport protein B  33.44 
 
 		 597 aa  313  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.123024 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2878  ferrous iron transport protein B  32.39 
 
 		 606 aa  313  4.999999999999999e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0506695 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0441  ferrous iron transport protein B  29.65 
 
 		 700 aa  313  5.999999999999999e-84  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3459  ferrous iron transport protein B  30.79 
 
 		 715 aa  312  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000760098  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0434  ferrous iron transport protein B  31.94 
 
 		 665 aa  312  1e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0259  ferrous iron transport protein B  32.62 
 
 		 628 aa  306  7e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00038951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>