More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6110 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00098  ferrous iron transport protein B  55.47 
 
 		 621 aa  657    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.069629  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0251  ferrous IRON transport B transmembrane protein  57.56 
 
 		 621 aa  681    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.563283  normal  0.119264 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5429  ferrous iron transport B domain-containing protein  56.77 
 
 		 617 aa  645    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.895542  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2975  ferrous iron transport protein B  71.08 
 
 		 626 aa  877    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.949455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2434  ferrous iron transport protein B  54.2 
 
 		 633 aa  647    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3948  ferrous iron transport protein B  56.96 
 
 		 621 aa  671    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.648078 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1804  ferrous iron transport protein B  54.95 
 
 		 621 aa  657    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.529813  normal  0.0419932 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0954  ferrous iron transport protein B  80.64 
 
 		 626 aa  981    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5116  ferrous iron transport protein B  80.64 
 
 		 626 aa  979    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1058  ferrous iron transport protein B  81.6 
 
 		 626 aa  990    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1111  ferrous iron transport protein B  71.08 
 
 		 626 aa  880    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5890  Fe2+ transport system protein B  58.18 
 
 		 620 aa  686    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1443  ferrous iron transport protein B  57.33 
 
 		 631 aa  653    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0983772  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2176  ferrous iron transport protein B  55.86 
 
 		 647 aa  660    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4039  ferrous iron transport protein B  65.43 
 
 		 625 aa  782    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129654 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6110  ferrous iron transport protein B  100 
 
 		 625 aa  1249    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.218757  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1161  ferrous iron transport protein B  55.57 
 
 		 632 aa  647    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.233706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4061  ferrous iron transport protein B  56.96 
 
 		 621 aa  671    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1860  ferrous iron transport protein B  53.81 
 
 		 617 aa  631  1e-180  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1471  transport protein B  55.38 
 
 		 629 aa  632  1e-180  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1329  ferrous iron transport protein B  51.75 
 
 		 637 aa  621  1e-176  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0623  ferrous iron transport protein B  51.75 
 
 		 637 aa  620  1e-176  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.356093  normal  0.228705 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1922  ferrous iron transport protein B  53.49 
 
 		 617 aa  618  1e-175  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47490  ferrous iron transport protein B  50.89 
 
 		 615 aa  599  1e-170  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0064  ferrous iron transport protein B  53.12 
 
 		 628 aa  597  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.956131  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0676  ferrous iron transport protein B  49.03 
 
 		 636 aa  594  1e-168  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2451  ferrous iron transport protein B  51.69 
 
 		 621 aa  587  1e-166  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2849  ferrous iron transport protein B  50.4 
 
 		 618 aa  582  1.0000000000000001e-165  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2987  ferrous iron transport protein B  53.64 
 
 		 619 aa  564  1.0000000000000001e-159  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0512994 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2567  ferrous iron transport protein B  38.96 
 
 		 753 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0784  ferrous iron transport protein B  36.21 
 
 		 711 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3827  ferrous iron transport protein B  34.57 
 
 		 700 aa  439  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.792233 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3726  ferrous iron transport protein B  33.91 
 
 		 696 aa  429  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0970  ferrous iron transport protein B  36.67 
 
 		 666 aa  414  1e-114  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0839864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1451  ferrous iron transport protein B  36.05 
 
 		 705 aa  413  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0248254  normal  0.0823674 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2011  GTP-binding protein, HSR1-related  40 
 
 		 648 aa  416  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606318  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1078  ferrous iron transport protein B  35.3 
 
 		 665 aa  413  1e-114  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.996842  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  36.92 
 
 		 676 aa  388  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03990  ferrous iron transport protein B-like protein  33.91 
 
 		 699 aa  384  1e-105  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.625523  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0779  ferrous iron transport protein B  34.25 
 
 		 688 aa  379  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328587  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1709  ferrous iron transport protein B  39.84 
 
 		 618 aa  379  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  34.79 
 
 		 662 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  34.64 
 
 		 662 aa  378  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  34.5 
 
 		 662 aa  375  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  34.64 
 
 		 662 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  34.64 
 
 		 662 aa  378  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0895  ferrous iron transport protein B  34.32 
 
 		 669 aa  372  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00236216  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2325  ferrous iron transport protein B  35.32 
 
 		 666 aa  373  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.907395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4947  ferrous iron transport protein B  34.5 
 
 		 662 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0873  ferrous iron transport protein B  34.32 
 
 		 667 aa  372  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101727  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4642  ferrous iron transport protein B  34.84 
 
 		 662 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  34.35 
 
 		 662 aa  372  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2658  ferrous iron transport protein B  34.98 
 
 		 664 aa  372  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  35.84 
 
 		 631 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1343  ferrous iron transport protein B  33.04 
 
 		 662 aa  368  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.547756  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  31.16 
 
 		 669 aa  368  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1913  ferrous iron transport protein B  33.55 
 
 		 587 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000339722  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  31.16 
 
 		 669 aa  368  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1631  ferrous iron transport protein B  33.39 
 
 		 587 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000698683  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0543  ferrous iron transport protein B  34.44 
 
 		 669 aa  364  3e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00422143  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1452  ferrous iron transport protein B  33.23 
 
 		 665 aa  363  4e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.789379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0882  ferrous iron transport protein B  32.87 
 
 		 720 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000109469  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  33.8 
 
 		 631 aa  362  1e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2074  ferrous iron transport protein B  32.03 
 
 		 712 aa  360  6e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4932  ferrous iron transport protein B  34.93 
 
 		 662 aa  359  7e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2626  ferrous iron transport protein B  33.09 
 
 		 664 aa  357  2.9999999999999997e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.51649  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2572  ferrous iron transport protein B  33.09 
 
 		 664 aa  357  2.9999999999999997e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0719  ferrous iron transport protein B  32.68 
 
 		 829 aa  355  2e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0311256  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0283  ferrous iron transport protein B  32.16 
 
 		 674 aa  352  1e-95  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1508  ferrous iron transport protein B  32.94 
 
 		 665 aa  350  3e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.225021  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0856  hypothetical protein  34.29 
 
 		 649 aa  350  6e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.935712  normal  0.465758 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3765  ferrous iron transport protein B  32.56 
 
 		 743 aa  349  9e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0890  ferrous iron transport protein B  33.77 
 
 		 684 aa  347  4e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1785  ferrous iron transport protein B  32.6 
 
 		 713 aa  345  2e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.84236  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3474  ferrous iron transport protein B  34.26 
 
 		 662 aa  340  5e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1951  ferrous iron transport protein B  34.34 
 
 		 680 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0016959  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0307  ferrous iron transport protein B  32.9 
 
 		 662 aa  335  1e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0871  ferrous iron transport protein B  39.8 
 
 		 716 aa  334  3e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1938  ferrous iron transport protein B  37.42 
 
 		 647 aa  332  1e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.31907  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4234  ferrous iron transport protein B  39.78 
 
 		 722 aa  330  6e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.322995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1761  ferrous iron transport protein B  30.06 
 
 		 711 aa  328  3e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1739  ferrous iron transport protein B  31.74 
 
 		 646 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00069018  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1458  ferrous iron transport protein B  32.37 
 
 		 716 aa  327  4.0000000000000003e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.137578  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0193  Fe2+ transport system protein B  31.75 
 
 		 691 aa  326  6e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3368  ferrous iron transport protein B  31.44 
 
 		 740 aa  323  4e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0434  ferrous iron transport protein B  32.47 
 
 		 665 aa  323  4e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3268  ferrous iron transport protein B  31 
 
 		 747 aa  319  9e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.309598  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56680  ferrous iron transport protein B  33.15 
 
 		 766 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0259  ferrous iron transport protein B  32.52 
 
 		 628 aa  318  2e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00038951  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3855  hypothetical protein  36.41 
 
 		 776 aa  317  4e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107886  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2669  ferrous iron transport protein B  31.11 
 
 		 725 aa  316  7e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2470  ferrous iron transport protein B  35.52 
 
 		 786 aa  316  7e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0966  ferrous iron transport protein B  31.73 
 
 		 669 aa  316  7e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3412  ferrous iron transport protein B  30.89 
 
 		 740 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2809  ferrous iron transport protein B  33.33 
 
 		 597 aa  311  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.123024 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0286  Fe2+ transport system protein B  31.44 
 
 		 704 aa  310  6.999999999999999e-83  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1088  ferrous iron transport protein B  29.89 
 
 		 753 aa  309  1.0000000000000001e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000362942  hitchhiker  0.0000000000000163165 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0754  ferrous iron transport protein B  34.27 
 
 		 786 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0018483  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4929  ferrous iron transport protein B  32.75 
 
 		 766 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875416  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0962  ferrous iron transport protein B  39.17 
 
 		 699 aa  308  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>