More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1709 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1709  ferrous iron transport protein B  100 
 
 		 618 aa  1252    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5890  Fe2+ transport system protein B  40.06 
 
 		 620 aa  415  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1804  ferrous iron transport protein B  39.1 
 
 		 621 aa  399  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.529813  normal  0.0419932 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2975  ferrous iron transport protein B  39.14 
 
 		 626 aa  392  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.949455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1111  ferrous iron transport protein B  38.81 
 
 		 626 aa  390  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0251  ferrous IRON transport B transmembrane protein  40.55 
 
 		 621 aa  386  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.563283  normal  0.119264 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3948  ferrous iron transport protein B  40.07 
 
 		 621 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.648078 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4061  ferrous iron transport protein B  40.07 
 
 		 621 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47490  ferrous iron transport protein B  37.89 
 
 		 615 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2849  ferrous iron transport protein B  39.48 
 
 		 618 aa  380  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2176  ferrous iron transport protein B  37.44 
 
 		 647 aa  373  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0676  ferrous iron transport protein B  36.92 
 
 		 636 aa  374  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0954  ferrous iron transport protein B  39.97 
 
 		 626 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1058  ferrous iron transport protein B  38.14 
 
 		 626 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0784  ferrous iron transport protein B  36.14 
 
 		 711 aa  371  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3726  ferrous iron transport protein B  33.38 
 
 		 696 aa  370  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5116  ferrous iron transport protein B  38.08 
 
 		 626 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00098  ferrous iron transport protein B  37.94 
 
 		 621 aa  366  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.069629  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4039  ferrous iron transport protein B  38.93 
 
 		 625 aa  367  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129654 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1443  ferrous iron transport protein B  38.61 
 
 		 631 aa  365  1e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0983772  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1860  ferrous iron transport protein B  38.62 
 
 		 617 aa  364  3e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1451  ferrous iron transport protein B  36.09 
 
 		 705 aa  360  4e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0248254  normal  0.0823674 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5429  ferrous iron transport B domain-containing protein  38.28 
 
 		 617 aa  360  4e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.895542  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1922  ferrous iron transport protein B  38.68 
 
 		 617 aa  356  6.999999999999999e-97  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2434  ferrous iron transport protein B  36.71 
 
 		 633 aa  355  1e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1078  ferrous iron transport protein B  33.08 
 
 		 665 aa  354  2.9999999999999997e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.996842  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3827  ferrous iron transport protein B  33.38 
 
 		 700 aa  352  1e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.792233 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1471  transport protein B  37.03 
 
 		 629 aa  350  5e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6110  ferrous iron transport protein B  39.7 
 
 		 625 aa  349  9e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.218757  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1161  ferrous iron transport protein B  36.36 
 
 		 632 aa  348  2e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.233706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0064  ferrous iron transport protein B  37.16 
 
 		 628 aa  346  7e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.956131  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1329  ferrous iron transport protein B  36.01 
 
 		 637 aa  343  4e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0307  ferrous iron transport protein B  34.73 
 
 		 662 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0623  ferrous iron transport protein B  35.09 
 
 		 637 aa  338  1.9999999999999998e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.356093  normal  0.228705 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0962  ferrous iron transport protein B  33.43 
 
 		 699 aa  337  5e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1343  ferrous iron transport protein B  34.46 
 
 		 662 aa  336  5.999999999999999e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.547756  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2451  ferrous iron transport protein B  35.02 
 
 		 621 aa  329  8e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4932  ferrous iron transport protein B  34.58 
 
 		 662 aa  329  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2987  ferrous iron transport protein B  35.71 
 
 		 619 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0512994 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0283  ferrous iron transport protein B  32.31 
 
 		 674 aa  324  3e-87  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  33.73 
 
 		 676 aa  323  4e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0873  ferrous iron transport protein B  32.5 
 
 		 667 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101727  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0895  ferrous iron transport protein B  32.36 
 
 		 669 aa  321  3e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00236216  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1631  ferrous iron transport protein B  32.03 
 
 		 587 aa  320  5e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000698683  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2011  GTP-binding protein, HSR1-related  36.49 
 
 		 648 aa  319  7.999999999999999e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606318  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1913  ferrous iron transport protein B  31.87 
 
 		 587 aa  317  6e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000339722  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2126  ferrous iron transport protein B  34.23 
 
 		 664 aa  315  9.999999999999999e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0344  ferrous iron transport protein B  30.56 
 
 		 724 aa  313  6.999999999999999e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00337716  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03990  ferrous iron transport protein B-like protein  31.85 
 
 		 699 aa  312  1e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.625523  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5086  ferrous iron transport protein B  33.29 
 
 		 712 aa  312  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000565138  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4642  ferrous iron transport protein B  33.59 
 
 		 662 aa  312  1e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2325  ferrous iron transport protein B  32.84 
 
 		 666 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.907395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  34.39 
 
 		 631 aa  302  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  33.49 
 
 		 631 aa  302  1e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0856  hypothetical protein  33.89 
 
 		 649 aa  300  6e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.935712  normal  0.465758 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1729  ferrous iron transport protein B  28.59 
 
 		 717 aa  295  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0580785 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0779  ferrous iron transport protein B  32.5 
 
 		 688 aa  294  2e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328587  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1452  ferrous iron transport protein B  33.18 
 
 		 665 aa  294  3e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.789379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0110  ferrous iron transport protein B  33.63 
 
 		 668 aa  291  2e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0260348  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2626  ferrous iron transport protein B  33.62 
 
 		 664 aa  290  4e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.51649  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2572  ferrous iron transport protein B  33.62 
 
 		 664 aa  290  4e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0193  Fe2+ transport system protein B  32.35 
 
 		 691 aa  288  2e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2567  ferrous iron transport protein B  38.14 
 
 		 753 aa  287  4e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1508  ferrous iron transport protein B  32.47 
 
 		 665 aa  286  9e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.225021  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1785  ferrous iron transport protein B  31.81 
 
 		 713 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.84236  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2878  ferrous iron transport protein B  29.73 
 
 		 606 aa  284  3.0000000000000004e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0506695 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2809  ferrous iron transport protein B  31.14 
 
 		 597 aa  283  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.123024 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4234  ferrous iron transport protein B  38.57 
 
 		 722 aa  282  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.322995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1938  ferrous iron transport protein B  33.99 
 
 		 647 aa  281  3e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.31907  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  30.19 
 
 		 669 aa  281  4e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0543  ferrous iron transport protein B  32.59 
 
 		 669 aa  280  6e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00422143  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16120  ferrous iron transporter FeoB  31.94 
 
 		 785 aa  279  9e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000453744 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2711  ferrous iron transporter B  30.84 
 
 		 751 aa  278  2e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2584  ferrous iron transporter B  33.5 
 
 		 751 aa  278  3e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1097  ferrous iron transport protein B  32.57 
 
 		 595 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  39.9 
 
 		 662 aa  271  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  39.76 
 
 		 662 aa  269  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  40.31 
 
 		 662 aa  269  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  40.31 
 
 		 662 aa  269  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  39.76 
 
 		 662 aa  269  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  39.76 
 
 		 662 aa  269  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4947  ferrous iron transport protein B  40.71 
 
 		 662 aa  269  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0259  ferrous iron transport protein B  30.99 
 
 		 628 aa  269  1e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00038951  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0441  ferrous iron transport protein B  28.57 
 
 		 700 aa  268  2e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1585  ferrous iron transport protein B  29.49 
 
 		 723 aa  266  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0104102  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0970  ferrous iron transport protein B  39.56 
 
 		 666 aa  266  1e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0839864 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1088  ferrous iron transport protein B  28.1 
 
 		 753 aa  265  2e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000362942  hitchhiker  0.0000000000000163165 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0871  ferrous iron transport protein B  40.43 
 
 		 716 aa  262  1e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1597  GTP-binding protein HSR1-related  31.25 
 
 		 617 aa  261  3e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0719  ferrous iron transport protein B  28.67 
 
 		 829 aa  258  2e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0311256  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1951  ferrous iron transport protein B  40.2 
 
 		 680 aa  257  3e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0016959  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1739  ferrous iron transport protein B  29.97 
 
 		 646 aa  257  4e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00069018  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3474  ferrous iron transport protein B  38.93 
 
 		 662 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1458  ferrous iron transport protein B  29.93 
 
 		 716 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.137578  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3606  ferrous iron transport protein B  32.37 
 
 		 773 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3790  ferrous iron transport protein B  32.37 
 
 		 773 aa  253  5.000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0304  ferrous iron transport protein B  32.37 
 
 		 773 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0656913 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4716  ferrous iron transport protein B  32.37 
 
 		 773 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3884  ferrous iron transport protein B  32.37 
 
 		 773 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3690  ferrous iron transport protein B  32.37 
 
 		 773 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>