More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_0304 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03261  ferrous iron transport protein B  99.87 
 
 		 773 aa  1584    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.313443  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0304  ferrous iron transport protein B  100 
 
 		 773 aa  1585    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4929  ferrous iron transport protein B  67.25 
 
 		 766 aa  1016    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875416  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3606  ferrous iron transport protein B  99.74 
 
 		 773 aa  1583    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3779  ferrous iron transport protein B  92.37 
 
 		 772 aa  1439    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2711  ferrous iron transporter B  45.86 
 
 		 751 aa  656    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2584  ferrous iron transporter B  45.72 
 
 		 751 aa  657    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1818  Fe2+ transport system protein B  46.65 
 
 		 770 aa  648    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.375819  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2071  ferrous iron transport protein B  46.91 
 
 		 774 aa  655    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0304  ferrous iron transport protein B  99.74 
 
 		 773 aa  1583    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0656913 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03213  hypothetical protein  99.87 
 
 		 773 aa  1584    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.267012  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3855  hypothetical protein  46.36 
 
 		 776 aa  673    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107886  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3690  ferrous iron transport protein B  99.87 
 
 		 773 aa  1584    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0754  ferrous iron transport protein B  44.86 
 
 		 786 aa  650    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0018483  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3875  ferrous iron transport protein B  91.98 
 
 		 772 aa  1432    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0107  ferrous iron transport protein B  46.32 
 
 		 778 aa  672    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.803376  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3790  ferrous iron transport protein B  99.87 
 
 		 773 aa  1584    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1959  ferrous iron transport protein B  47.75 
 
 		 816 aa  712    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4629  ferrous iron transport protein B  77 
 
 		 771 aa  1163    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0623  ferrous iron transport protein B  44.27 
 
 		 783 aa  645    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.626283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3884  ferrous iron transport protein B  99.74 
 
 		 773 aa  1583    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1933  ferrous iron transport protein B  46.12 
 
 		 774 aa  655    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.651093  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3746  ferrous iron transport protein B  74.42 
 
 		 771 aa  1149    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56680  ferrous iron transport protein B  66.02 
 
 		 766 aa  1025    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3813  ferrous iron transport protein B  92.5 
 
 		 772 aa  1442    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3707  ferrous iron transport protein B  92.37 
 
 		 772 aa  1439    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0239  ferrous iron transport protein B  48.33 
 
 		 816 aa  716    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4716  ferrous iron transport protein B  99.74 
 
 		 773 aa  1583    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3822  ferrous iron transport protein B  86.93 
 
 		 772 aa  1368    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.848053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3704  ferrous iron transport protein B  92.24 
 
 		 772 aa  1438    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0168  ferrous iron transport protein B  74.42 
 
 		 771 aa  1145    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.426324  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3985  ferrous iron transport protein B  74.42 
 
 		 771 aa  1145    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0465  ferrous iron transport protein B  46.72 
 
 		 770 aa  651    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0169  ferrous iron transport protein B  44.97 
 
 		 778 aa  635  1e-180  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2470  ferrous iron transport protein B  46.35 
 
 		 786 aa  627  1e-178  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22730  ferrous iron transport protein B  45.02 
 
 		 778 aa  620  1e-176  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524583  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2258  ferrous iron transport protein FeoB  42.46 
 
 		 758 aa  602  1e-170  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.694686  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1664  ferrous iron transport protein B  41.95 
 
 		 758 aa  590  1e-167  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004103  ferrous iron transport protein B  44.4 
 
 		 758 aa  591  1e-167  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01364  hypothetical protein  43.51 
 
 		 758 aa  592  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2690  ferrous iron transport protein B  42.53 
 
 		 764 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.878145  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2152  ferrous iron transport protein B  41.32 
 
 		 782 aa  566  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.264076  hitchhiker  0.0000442692 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2524  ferrous iron transport protein B  41.32 
 
 		 766 aa  566  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3122  ferrous iron transport protein B  42.34 
 
 		 764 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000440223 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0321  ferrous iron transport protein B  42.26 
 
 		 751 aa  565  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.397467  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2517  ferrous iron transport protein B  41.22 
 
 		 764 aa  561  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.487661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1618  ferrous iron transport protein B  41.88 
 
 		 764 aa  555  1e-156  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00477082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1595  ferrous iron transport protein B  41.88 
 
 		 764 aa  555  1e-156  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000195581  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1584  ferrous iron transport protein B  41.74 
 
 		 764 aa  555  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000129381  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2759  ferrous iron transport protein B  42.31 
 
 		 764 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383541  hitchhiker  0.00159456 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2414  ferrous iron transport protein B  41.2 
 
 		 772 aa  550  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331306  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2616  ferrous iron transport protein B  41.26 
 
 		 770 aa  549  1e-155  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1481  ferrous iron transport protein B  41.55 
 
 		 764 aa  545  1e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.725722  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2504  ferrous iron transport protein B  41.26 
 
 		 764 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00112841  hitchhiker  0.00221536 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2572  ferrous iron transport protein B  41.26 
 
 		 764 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.148151  normal  0.0102392 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1841  ferrous iron transport protein B  41.22 
 
 		 769 aa  537  1e-151  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.547404  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1532  ferrous iron transport protein B  41.57 
 
 		 764 aa  536  1e-151  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1784  ferrous iron transport protein B  40.55 
 
 		 764 aa  534  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2670  ferrous iron transport protein B  40.93 
 
 		 764 aa  535  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.360786  normal  0.0737302 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1215  ferrous iron transport protein B  41.09 
 
 		 764 aa  525  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0654  ferrous iron transport protein B  38.11 
 
 		 693 aa  502  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0648  ferrous iron transport protein B  38.43 
 
 		 727 aa  491  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1140  ferrous iron transport protein B  38.78 
 
 		 680 aa  490  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000225033  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3268  ferrous iron transport protein B  39.42 
 
 		 747 aa  486  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.309598  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3658  ferrous iron transport protein B  37.85 
 
 		 741 aa  481  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3765  ferrous iron transport protein B  37.24 
 
 		 743 aa  474  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1951  ferrous iron transport protein B  38.34 
 
 		 680 aa  475  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0016959  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  38.15 
 
 		 669 aa  472  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  38.15 
 
 		 669 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1785  ferrous iron transport protein B  37.96 
 
 		 713 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.84236  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1508  ferrous iron transport protein B  38.44 
 
 		 665 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.225021  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0793  ferrous iron transport protein B  38.38 
 
 		 728 aa  467  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.585929  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1088  ferrous iron transport protein B  37.77 
 
 		 753 aa  464  1e-129  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000362942  hitchhiker  0.0000000000000163165 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3293  ferrous iron transport protein B  37.98 
 
 		 741 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.608312  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3368  ferrous iron transport protein B  37.36 
 
 		 740 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2658  ferrous iron transport protein B  37.64 
 
 		 664 aa  455  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  37.5 
 
 		 662 aa  449  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0970  ferrous iron transport protein B  37.64 
 
 		 666 aa  449  1e-125  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0839864 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3412  ferrous iron transport protein B  37.04 
 
 		 740 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4105  ferrous iron transport protein B  38.71 
 
 		 738 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281443  normal  0.296674 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  37.69 
 
 		 662 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  37.36 
 
 		 662 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4947  ferrous iron transport protein B  37.85 
 
 		 662 aa  449  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0307  ferrous iron transport protein B  37.64 
 
 		 662 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4932  ferrous iron transport protein B  37.85 
 
 		 662 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4642  ferrous iron transport protein B  37.22 
 
 		 662 aa  445  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  37.69 
 
 		 662 aa  446  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1194  ferrous iron transport protein B  36.32 
 
 		 714 aa  446  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  37.69 
 
 		 662 aa  446  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3459  ferrous iron transport protein B  36.32 
 
 		 715 aa  444  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000760098  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  37.69 
 
 		 662 aa  446  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0095  ferrous iron transport protein B  36.54 
 
 		 676 aa  441  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  37.59 
 
 		 631 aa  442  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3524  ferrous iron transport protein B  34.27 
 
 		 697 aa  437  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000134401  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3474  ferrous iron transport protein B  36.46 
 
 		 662 aa  437  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2325  ferrous iron transport protein B  37.04 
 
 		 666 aa  434  1e-120  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.907395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  36.79 
 
 		 631 aa  435  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0901  ferrous iron transport protein B  36.39 
 
 		 708 aa  432  1e-119  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000608812  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  36.83 
 
 		 676 aa  428  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0618  ferrous iron transport protein B  33.68 
 
 		 721 aa  426  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0536695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>