31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0896 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0896  hypothetical protein  100 
 
 
502 aa  1037    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128039  normal  0.710649 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1019  hypothetical protein  49.06 
 
 
556 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.927192  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0774  hypothetical protein  45.34 
 
 
529 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0344155  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1083  hypothetical protein  31.2 
 
 
494 aa  93.2  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87071  predicted protein  26.18 
 
 
445 aa  66.2  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0177704  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  25 
 
 
585 aa  61.2  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14787  predicted protein  31.58 
 
 
204 aa  59.3  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30394  predicted protein  30.07 
 
 
559 aa  58.2  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.382636  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  27.91 
 
 
583 aa  55.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8770  predicted protein  27.36 
 
 
390 aa  54.3  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  29.69 
 
 
615 aa  51.2  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  26.49 
 
 
632 aa  50.1  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  27.72 
 
 
585 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1013  hypothetical protein  22.58 
 
 
1145 aa  47.8  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.445275  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  26.67 
 
 
585 aa  47.4  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  27.57 
 
 
587 aa  47.4  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6055  hypothetical protein  29.46 
 
 
696 aa  47  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  26.37 
 
 
1219 aa  45.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  26.37 
 
 
1219 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  26.37 
 
 
1219 aa  45.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  26.37 
 
 
1219 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  26.37 
 
 
1219 aa  45.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  26.37 
 
 
1219 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  24.09 
 
 
548 aa  44.7  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  25.41 
 
 
1219 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  25.82 
 
 
1219 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  25.82 
 
 
1219 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  25.09 
 
 
599 aa  44.3  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0374  hypothetical protein  25.34 
 
 
621 aa  43.9  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0830  hypothetical protein  27.23 
 
 
712 aa  43.9  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00896739  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0815  GTPase  27.23 
 
 
712 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>