23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1019 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1019  hypothetical protein  100 
 
 
556 aa  1139    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.927192  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0896  hypothetical protein  49.06 
 
 
502 aa  452  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128039  normal  0.710649 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0774  hypothetical protein  43.7 
 
 
529 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0344155  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1083  hypothetical protein  31.69 
 
 
494 aa  92.8  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87071  predicted protein  26.56 
 
 
445 aa  60.8  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0177704  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30394  predicted protein  29.35 
 
 
559 aa  58.9  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.382636  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8770  predicted protein  26.78 
 
 
390 aa  57.8  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14787  predicted protein  27.81 
 
 
204 aa  55.1  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  24 
 
 
1219 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  24 
 
 
1219 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  24 
 
 
1219 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  28.57 
 
 
407 aa  48.5  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  26.76 
 
 
615 aa  48.5  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  24 
 
 
1219 aa  48.9  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  24 
 
 
1219 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  24 
 
 
1219 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  25.99 
 
 
583 aa  48.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  23.43 
 
 
1219 aa  47  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  22.99 
 
 
1219 aa  47  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  23.43 
 
 
1219 aa  47  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  22.99 
 
 
1219 aa  47  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  25.54 
 
 
585 aa  46.6  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  22.41 
 
 
1219 aa  43.9  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>