More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0322 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  100 
 
 		 585 aa  1134    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  39.83 
 
 		 585 aa  362  1e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  37.7 
 
 		 583 aa  361  2e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  36.41 
 
 		 589 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  38.88 
 
 		 585 aa  344  2e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  35.43 
 
 		 587 aa  300  5e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  36.91 
 
 		 564 aa  273  6e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  33.79 
 
 		 546 aa  222  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  33.16 
 
 		 548 aa  217  4e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  38.1 
 
 		 632 aa  211  2e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  30.28 
 
 		 620 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  28.69 
 
 		 444 aa  124  6e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1510  GTP-binding protein HSR1-related  28.09 
 
 		 523 aa  113  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  25.78 
 
 		 614 aa  106  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  25.78 
 
 		 614 aa  106  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  30.94 
 
 		 588 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  31.54 
 
 		 605 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  32.89 
 
 		 614 aa  103  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  33.81 
 
 		 1164 aa  99  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  25.63 
 
 		 686 aa  92.8  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  25.22 
 
 		 952 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  33.02 
 
 		 407 aa  88.6  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  29.7 
 
 		 674 aa  85.9  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  29.19 
 
 		 1249 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  28.84 
 
 		 615 aa  82.4  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0969  Dynamin family protein  35.1 
 
 		 648 aa  80.9  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  30.05 
 
 		 1219 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  30.18 
 
 		 1219 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  30.18 
 
 		 1219 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  30.18 
 
 		 1219 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0404  glucosamine fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  30.34 
 
 		 610 aa  80.1  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  31.76 
 
 		 1219 aa  79  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  28.25 
 
 		 666 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  28.12 
 
 		 599 aa  77.4  0.0000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  29.59 
 
 		 1219 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  29.59 
 
 		 1219 aa  77  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  29.59 
 
 		 1219 aa  77  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  31.54 
 
 		 1219 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  28.99 
 
 		 1219 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  28.99 
 
 		 1219 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  27.87 
 
 		 1228 aa  73.9  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0499  small GTP-binding protein  30.8 
 
 		 475 aa  73.9  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362987  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  29.38 
 
 		 605 aa  72  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  28.96 
 
 		 603 aa  72.4  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2196  dynamin family protein  30.18 
 
 		 506 aa  72.8  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1530  hypothetical protein  24.29 
 
 		 1146 aa  70.5  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.532706  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1501  hypothetical protein  24.29 
 
 		 1146 aa  70.5  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6053  hypothetical protein  32.64 
 
 		 570 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1546  GTP-binding protein  21.86 
 
 		 728 aa  68.9  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0435  GTP-binding protein  21.86 
 
 		 728 aa  67.4  0.0000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0460  GTP-binding protein  21.56 
 
 		 728 aa  65.9  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.839985  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  25.94 
 
 		 679 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0859  GTP-binding protein  25.76 
 
 		 692 aa  65.5  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.547864  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0923  hypothetical protein  25.58 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169029 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0813  hypothetical protein  26.27 
 
 		 516 aa  63.9  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2547  dynamin  26.27 
 
 		 551 aa  63.9  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0828  hypothetical protein  25.75 
 
 		 516 aa  63.5  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000529126  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0700  hypothetical protein  30.7 
 
 		 652 aa  63.2  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7004  GTP-binding protein HSR1-related  26.82 
 
 		 610 aa  62.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.793634  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0764  GTP-binding protein HSR1-related  35.77 
 
 		 469 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1013  hypothetical protein  23.93 
 
 		 1145 aa  62  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.445275  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1762  Miro domain protein  26.19 
 
 		 555 aa  62  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  25.82 
 
 		 524 aa  61.6  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0754256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  28.41 
 
 		 693 aa  61.2  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0896  hypothetical protein  25 
 
 		 502 aa  61.2  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128039  normal  0.710649 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0372  hypothetical protein  29.32 
 
 		 587 aa  60.8  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2393  small GTP-binding protein  33.81 
 
 		 448 aa  60.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2342  small GTP-binding protein  33.81 
 
 		 448 aa  60.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0774  hypothetical protein  27.23 
 
 		 529 aa  60.5  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0344155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  23.08 
 
 		 655 aa  59.7  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3291  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.96 
 
 		 492 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0403  dynamin family protein  22.71 
 
 		 693 aa  59.7  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16501  GTPase SAR1 and related small G proteins  30.04 
 
 		 532 aa  58.9  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.569133 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1966  GTP-binding protein Era  28.57 
 
 		 319 aa  59.3  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000219392 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  28.21 
 
 		 390 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4509  small GTP-binding protein domain-containing protein  31.49 
 
 		 457 aa  58.9  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1096  GTP-binding protein, HSR1-related  25.25 
 
 		 664 aa  58.9  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  26.94 
 
 		 719 aa  58.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2229  GTP-binding protein Era  28.57 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00352178  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3839  small GTP-binding protein  30.43 
 
 		 481 aa  58.5  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.674432 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2751  GTP-binding protein, HSR1-related  27.36 
 
 		 549 aa  58.2  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.859645  normal  0.205011 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  35 
 
 		 456 aa  57.8  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  28.15 
 
 		 601 aa  58.2  0.0000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1080  small GTP-binding protein  31.69 
 
 		 484 aa  57.4  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3787  GTP-binding protein Era  30.23 
 
 		 468 aa  57.4  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.0434052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1616  small GTP-binding protein  31.33 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206677 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1086  hypothetical protein  32.47 
 
 		 551 aa  56.2  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00952601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0830  hypothetical protein  24.78 
 
 		 712 aa  55.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00896739  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1407  small GTP-binding protein  30.29 
 
 		 479 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0815  GTPase  24.78 
 
 		 712 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1733  hypothetical protein  27.2 
 
 		 976 aa  56.2  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0437  GTP-binding protein  21.41 
 
 		 692 aa  55.8  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  30.66 
 
 		 451 aa  55.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  23.44 
 
 		 569 aa  55.5  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1545  GTP-binding protein  23.44 
 
 		 569 aa  55.1  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.712051  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0397  Dynamin family protein  43.55 
 
 		 789 aa  55.1  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0111735  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1436  small GTP-binding protein  31.33 
 
 		 479 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  30.64 
 
 		 324 aa  55.1  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5313  hypothetical protein  28.35 
 
 		 743 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  31.93 
 
 		 450 aa  54.7  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>