76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1086 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1086  hypothetical protein  100 
 
 
551 aa  1046    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00952601  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24740  hypothetical protein  53.86 
 
 
551 aa  455  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.043803  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1349  hypothetical protein  52.74 
 
 
566 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0928  hypothetical protein  41.51 
 
 
540 aa  304  2.0000000000000002e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2645  putative transcriptional regulator, TetR family  40.71 
 
 
526 aa  296  7e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08870  hypothetical protein  44.9 
 
 
566 aa  237  5.0000000000000005e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0706838  normal  0.0205572 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2523  putative ABC transporter  35.09 
 
 
571 aa  227  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1353  putative ABC transporter  37.29 
 
 
667 aa  222  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00435841  hitchhiker  0.000139423 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1324  hypothetical protein  33.39 
 
 
569 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7362  hypothetical protein  32.33 
 
 
564 aa  219  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0821059  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08690  hypothetical protein  36.72 
 
 
602 aa  210  7e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1520  putative ABC transporter  38.71 
 
 
576 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703438  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1549  putative ABC transporter  38.44 
 
 
586 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1572  putative ABC transporter  38.44 
 
 
586 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2560  AAA ATPase  31.02 
 
 
687 aa  205  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0932  hypothetical protein  40.24 
 
 
650 aa  203  8e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8871  putative ABC transporter  37.59 
 
 
629 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872872  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24320  hypothetical protein  34.86 
 
 
584 aa  199  9e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0079  putative ABC transporter  38.51 
 
 
565 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.459634  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1366  putative ABC transporter  38.72 
 
 
572 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1090  hypothetical protein  43.01 
 
 
737 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2641  putative ABC transporter  36.92 
 
 
669 aa  196  6e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374728  normal  0.779452 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2260  putative ABC transporter  38.94 
 
 
571 aa  192  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000139745 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3266  putative ABC transporter  35.15 
 
 
571 aa  192  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.025779  normal  0.223838 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3430  putative ABC transporter  31.16 
 
 
631 aa  182  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790282  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2220  putative ABC transporter  30.64 
 
 
619 aa  182  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24700  hypothetical protein  41 
 
 
784 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.303383  normal  0.0806263 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1736  putative ABC transporter  29.45 
 
 
556 aa  94  7e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24690  GTPase of unknown function  36.2 
 
 
539 aa  74.3  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6041  normal  0.0378138 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1350  putative ABC transporter  34.24 
 
 
524 aa  73.2  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.43815  hitchhiker  0.000106139 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08880  predicted GTPase  36.11 
 
 
564 aa  71.6  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.141009  normal  0.0562111 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2640  GTP-binding protein HSR1-related protein  33.71 
 
 
550 aa  70.1  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133942  normal  0.721182 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1735  putative ABC transporter  37.41 
 
 
552 aa  69.7  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43735  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2219  GTPase  32.21 
 
 
673 aa  69.3  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24310  hypothetical protein  32.14 
 
 
568 aa  69.7  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6775  putative ABC transporter  29.63 
 
 
589 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1394  hypothetical protein  31.18 
 
 
543 aa  67.8  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1548  putative ABC transporter  31.34 
 
 
525 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1571  putative ABC transporter  31.34 
 
 
525 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1519  putative ABC transporter  31.34 
 
 
525 aa  67.4  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3265  putative ABC transporter  31.07 
 
 
532 aa  67  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7361  putative ABC transporter  33.16 
 
 
547 aa  67  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3429  hypothetical protein  33.93 
 
 
802 aa  65.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.224896 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1354  GTP-binding protein HSR1-related protein  35.94 
 
 
542 aa  64.7  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0428896  hitchhiker  0.0000949376 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0080  GTP-binding protein HSR1-related protein  32.8 
 
 
532 aa  63.9  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.170633  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  30.99 
 
 
548 aa  63.2  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3738  hypothetical protein  33.83 
 
 
618 aa  61.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2522  putative ABC transporter  34.67 
 
 
539 aa  60.8  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.504723  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  34.23 
 
 
564 aa  60.5  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0929  hypothetical protein  30.59 
 
 
518 aa  60.1  0.00000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1091  putative ABC transporter  31.25 
 
 
585 aa  60.5  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.631509  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  26.76 
 
 
546 aa  58.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1367  putative ABC transporter  29.79 
 
 
555 aa  58.9  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.621246  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0933  hypothetical protein  29.85 
 
 
578 aa  58.5  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2259  GTP-binding protein HSR1-related  29.51 
 
 
537 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000117964 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1087  putative ABC transporter  30 
 
 
523 aa  57.8  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0151577  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08700  hypothetical protein  26.83 
 
 
586 aa  57.4  0.0000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2559  putative ABC transporter  28.57 
 
 
542 aa  56.2  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  32.47 
 
 
585 aa  56.2  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3997  hypothetical protein  25.86 
 
 
642 aa  55.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1326  hypothetical protein  27.75 
 
 
568 aa  55.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3291  small GTP-binding protein domain-containing protein  34.25 
 
 
492 aa  54.3  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8870  putative ABC transporter  29.49 
 
 
590 aa  53.5  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0939636  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  28.78 
 
 
585 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  29.59 
 
 
587 aa  53.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  27.88 
 
 
1249 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  29.3 
 
 
585 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5212  small GTP-binding protein  26.32 
 
 
489 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000545834 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0499  small GTP-binding protein  29.14 
 
 
475 aa  51.6  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362987  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24730  predicted GTPase  28.74 
 
 
517 aa  51.2  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0664672  normal  0.0671171 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2644  ATP-binding membrane protein  29.14 
 
 
453 aa  50.4  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  28.75 
 
 
632 aa  50.4  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1080  small GTP-binding protein  33.09 
 
 
484 aa  48.1  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  27.52 
 
 
583 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  26.54 
 
 
589 aa  44.7  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4951  hypothetical protein  34.23 
 
 
343 aa  43.5  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>