More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0499 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0499  small GTP-binding protein  100 
 
 		 475 aa  947    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362987  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3291  small GTP-binding protein domain-containing protein  63.81 
 
 		 492 aa  598  1e-170  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1080  small GTP-binding protein  62.88 
 
 		 484 aa  585  1e-166  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  65.38 
 
 		 566 aa  580  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5212  small GTP-binding protein  62.58 
 
 		 489 aa  564  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000545834 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1407  small GTP-binding protein  62.34 
 
 		 479 aa  548  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1436  small GTP-binding protein  62.12 
 
 		 479 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0107  small GTP-binding protein domain-containing protein  45.97 
 
 		 472 aa  408  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1616  small GTP-binding protein  40.37 
 
 		 453 aa  326  7e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206677 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3709  small GTP-binding protein  42.15 
 
 		 462 aa  317  4e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4509  small GTP-binding protein domain-containing protein  40.91 
 
 		 457 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2342  small GTP-binding protein  37.73 
 
 		 448 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2393  small GTP-binding protein  37.73 
 
 		 448 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3839  small GTP-binding protein  37.61 
 
 		 481 aa  278  1e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.674432 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0764  GTP-binding protein HSR1-related  30.21 
 
 		 469 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  33.33 
 
 		 440 aa  193  7e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.64 
 
 		 440 aa  189  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  30.4 
 
 		 440 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0497  GTPase  33.09 
 
 		 420 aa  185  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04921  GTPase SAR1  35.14 
 
 		 441 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2178  small GTP-binding protein domain-containing protein  33.77 
 
 		 431 aa  164  4.0000000000000004e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.995116  normal  0.41065 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16231  GTPase SAR1 and related small G proteins  29.46 
 
 		 413 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.283634  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  31.96 
 
 		 531 aa  150  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1351  small GTP-binding protein  31.48 
 
 		 531 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4459  small GTP-binding protein  30.58 
 
 		 520 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16461  GTPase SAR1  27.6 
 
 		 413 aa  143  9e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16341  GTPase SAR1 and related small G protein  27.85 
 
 		 413 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1326  small GTP-binding protein  29.74 
 
 		 529 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1537  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.18 
 
 		 413 aa  137  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4593  small GTP-binding protein  29.02 
 
 		 506 aa  137  5e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.771946  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1709  small GTP-binding protein domain-containing protein  29 
 
 		 513 aa  132  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000711006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1544  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.74 
 
 		 517 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1210  small GTP-binding protein domain-containing protein  33.02 
 
 		 529 aa  122  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1904  GTP-binding protein, HSR1-related  29.44 
 
 		 545 aa  118  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0145  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.3 
 
 		 517 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07771  GTPase SAR1 and related small G proteins  29.3 
 
 		 517 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0362439 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1260  hypothetical protein  27.52 
 
 		 529 aa  114  3e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16501  GTPase SAR1 and related small G proteins  28.5 
 
 		 532 aa  114  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.569133 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09991  GTPase SAR1 and related small G proteins  26.35 
 
 		 496 aa  109  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10221  GTPase SAR1 and related small G protein  24.75 
 
 		 516 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.524471  normal  0.183753 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09441  GTPase SAR1 and related small G protein  26.15 
 
 		 499 aa  98.6  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09451  GTPase SAR1  25.4 
 
 		 499 aa  96.7  8e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0884  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.38 
 
 		 499 aa  96.3  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.102699  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4193  hypothetical protein  24.87 
 
 		 471 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.296514 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0765  hypothetical protein  25.85 
 
 		 472 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0732  hypothetical protein  28.17 
 
 		 481 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00108673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  30.8 
 
 		 585 aa  73.9  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2529  hypothetical protein  28.63 
 
 		 475 aa  72.8  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3840  hypothetical protein  26.1 
 
 		 492 aa  69.3  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.693476 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  33.33 
 
 		 548 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2527  hypothetical protein  24.56 
 
 		 463 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3579  hypothetical protein  24.56 
 
 		 463 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  29.73 
 
 		 583 aa  61.6  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  29.7 
 
 		 588 aa  61.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  33.1 
 
 		 302 aa  59.7  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  30.26 
 
 		 546 aa  57  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  28.92 
 
 		 407 aa  55.8  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  27.61 
 
 		 632 aa  55.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  25.86 
 
 		 1249 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  29.63 
 
 		 587 aa  55.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0683  small GTP-binding protein  29.32 
 
 		 408 aa  54.3  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00203334  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1862  small GTP-binding protein  26.9 
 
 		 398 aa  54.7  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.803475  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3202  putative GTPase  25.63 
 
 		 294 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0165  small GTP-binding protein  29.33 
 
 		 427 aa  53.5  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0146  small GTP-binding protein  32.61 
 
 		 398 aa  53.5  0.000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0325934  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0475  small GTP-binding protein  29.85 
 
 		 404 aa  53.5  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0490  small GTP-binding protein  29.85 
 
 		 404 aa  53.5  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1387  GTP-binding protein Era  33.82 
 
 		 308 aa  52.8  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.263237  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1510  GTP-binding protein HSR1-related  29.17 
 
 		 523 aa  53.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  28.78 
 
 		 324 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  29.7 
 
 		 303 aa  53.1  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0359  GTP-binding protein EngA  31.08 
 
 		 436 aa  52.8  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4121  GTP-binding protein Era  30.72 
 
 		 305 aa  52.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.383616  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0435  GTP-binding protein EngA  29.58 
 
 		 460 aa  52.4  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13281  GTP-binding protein Era-like protein  30.72 
 
 		 314 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.593826 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4685  putative GTPase  26.73 
 
 		 294 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3393  translation initiation factor IF-2  26.74 
 
 		 992 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.718402 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1243  small GTP-binding protein  29.76 
 
 		 425 aa  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  29.24 
 
 		 585 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3402  putative GTPase  25.37 
 
 		 294 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4797  putative GTPase  25.37 
 
 		 294 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0280  GTP-binding protein Era  31.33 
 
 		 301 aa  51.6  0.00003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1086  hypothetical protein  29.14 
 
 		 551 aa  51.6  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00952601  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1247  GTP-binding protein Era  29.93 
 
 		 300 aa  52  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.734456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0409  GTP-binding protein EngA  29.58 
 
 		 460 aa  52  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2710  translation initiation factor IF-2  26.2 
 
 		 992 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1064  GTP-binding protein Era  27.01 
 
 		 303 aa  50.8  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1122  GTP-binding protein Era  30.77 
 
 		 304 aa  50.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1401  GTP-binding protein Era  30.77 
 
 		 304 aa  50.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  31.91 
 
 		 306 aa  50.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1572  GTP-binding protein EngA  29.58 
 
 		 460 aa  50.4  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  26.05 
 
 		 605 aa  50.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  31.97 
 
 		 296 aa  50.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3787  GTP-binding protein Era  32.64 
 
 		 468 aa  50.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.0434052 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  31.39 
 
 		 297 aa  50.1  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2311  GTP-binding protein Era  26.67 
 
 		 309 aa  50.4  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.254696  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  27.45 
 
 		 303 aa  50.1  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1620  GTP-binding protein EngA  30.41 
 
 		 436 aa  50.1  0.00009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1629  GTPases  32.41 
 
 		 416 aa  50.1  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000232915  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2974  GTP-binding protein Era  31.54 
 
 		 298 aa  49.3  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0899132  hitchhiker  0.00507105 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>