153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_09441 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0884  small GTP-binding protein domain-containing protein  91.35 
 
 		 499 aa  876    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.102699  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09451  GTPase SAR1  94.78 
 
 		 499 aa  890    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09441  GTPase SAR1 and related small G protein  100 
 
 		 499 aa  972    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09991  GTPase SAR1 and related small G proteins  64.63 
 
 		 496 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10221  GTPase SAR1 and related small G protein  38.06 
 
 		 516 aa  365  1e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.524471  normal  0.183753 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16501  GTPase SAR1 and related small G proteins  35.56 
 
 		 532 aa  342  1e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.569133 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0145  small GTP-binding protein domain-containing protein  37.91 
 
 		 517 aa  317  4e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07771  GTPase SAR1 and related small G proteins  37.39 
 
 		 517 aa  317  4e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0362439 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1210  small GTP-binding protein domain-containing protein  34.98 
 
 		 529 aa  303  5.000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1260  hypothetical protein  34.35 
 
 		 529 aa  302  9e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1544  small GTP-binding protein domain-containing protein  35.63 
 
 		 517 aa  291  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4593  small GTP-binding protein  36.61 
 
 		 506 aa  290  6e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.771946  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  35.85 
 
 		 531 aa  286  8e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1351  small GTP-binding protein  35.85 
 
 		 531 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1326  small GTP-binding protein  32.9 
 
 		 529 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4459  small GTP-binding protein  34.76 
 
 		 520 aa  279  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1709  small GTP-binding protein domain-containing protein  33.89 
 
 		 513 aa  273  4.0000000000000004e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000711006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1904  GTP-binding protein, HSR1-related  35.96 
 
 		 545 aa  272  8.000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0732  hypothetical protein  22.98 
 
 		 481 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00108673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4193  hypothetical protein  24.15 
 
 		 471 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.296514 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0765  hypothetical protein  19.82 
 
 		 472 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3840  hypothetical protein  24.26 
 
 		 492 aa  107  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.693476 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  28.25 
 
 		 440 aa  106  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5212  small GTP-binding protein  25.65 
 
 		 489 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000545834 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.99 
 
 		 440 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1080  small GTP-binding protein  27.42 
 
 		 484 aa  100  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0107  small GTP-binding protein domain-containing protein  24.5 
 
 		 472 aa  99.8  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1616  small GTP-binding protein  27.73 
 
 		 453 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206677 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0499  small GTP-binding protein  26.15 
 
 		 475 aa  98.6  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362987  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  30.19 
 
 		 440 aa  97.4  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2529  hypothetical protein  23.08 
 
 		 475 aa  95.9  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  25.96 
 
 		 566 aa  95.9  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3291  small GTP-binding protein domain-containing protein  25.48 
 
 		 492 aa  94.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3709  small GTP-binding protein  26.21 
 
 		 462 aa  93.2  9e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4509  small GTP-binding protein domain-containing protein  24.88 
 
 		 457 aa  92  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1407  small GTP-binding protein  25.47 
 
 		 479 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2178  small GTP-binding protein domain-containing protein  25.36 
 
 		 431 aa  90.9  5e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.995116  normal  0.41065 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1436  small GTP-binding protein  25.47 
 
 		 479 aa  90.5  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0993  hypothetical protein  20.78 
 
 		 459 aa  85.9  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.455493 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2393  small GTP-binding protein  25.87 
 
 		 448 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3579  hypothetical protein  23 
 
 		 463 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2342  small GTP-binding protein  25.87 
 
 		 448 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2527  hypothetical protein  21.18 
 
 		 463 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0764  GTP-binding protein HSR1-related  24.57 
 
 		 469 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0497  GTPase  23.86 
 
 		 420 aa  77.8  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16461  GTPase SAR1  26.45 
 
 		 413 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3839  small GTP-binding protein  25.59 
 
 		 481 aa  73.6  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.674432 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16341  GTPase SAR1 and related small G protein  26.45 
 
 		 413 aa  73.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04921  GTPase SAR1  24.92 
 
 		 441 aa  70.5  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16231  GTPase SAR1 and related small G proteins  28.09 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.283634  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1537  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.27 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6543  GTP-binding protein Era  26.29 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  31.61 
 
 		 297 aa  55.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1029  small GTP-binding protein  31.88 
 
 		 184 aa  54.3  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0036  hypothetical protein  28.95 
 
 		 451 aa  53.5  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0777  GTP-binding protein EngA  25.5 
 
 		 462 aa  53.5  0.000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06561  hypothetical protein  28.95 
 
 		 451 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0586116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18671  hypothetical protein  25.36 
 
 		 454 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0915  small GTP-binding protein  31.16 
 
 		 184 aa  53.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.793666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0577  GTP-binding protein EngA  29.06 
 
 		 435 aa  52.8  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.416412  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1766  small GTP-binding protein  31.88 
 
 		 184 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0947  small GTP-binding protein  32.14 
 
 		 184 aa  52.4  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.445595  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1640  GTP-binding protein Era  29.51 
 
 		 307 aa  52  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0258714  hitchhiker  0.00261121 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  31.13 
 
 		 301 aa  52  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0053  GTP-binding protein EngA  27 
 
 		 460 aa  51.2  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0208  GTP-binding protein Era  27.49 
 
 		 297 aa  50.4  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1186  GTP-binding protein EngA  25.48 
 
 		 461 aa  50.4  0.00007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  29.29 
 
 		 303 aa  49.7  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  24.66 
 
 		 300 aa  50.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0942  hypothetical protein  24.37 
 
 		 409 aa  48.9  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2250  GTP-binding protein Era  27.92 
 
 		 305 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2303  GTP-binding protein Era  23.93 
 
 		 306 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  26.67 
 
 		 303 aa  49.3  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  28.72 
 
 		 302 aa  48.9  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  27.64 
 
 		 308 aa  48.9  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2973  GTP-binding protein Era  27.27 
 
 		 307 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1806  GTP-binding protein Era  26.64 
 
 		 297 aa  48.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0584484  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0372  GTP-binding protein Era  27.78 
 
 		 297 aa  48.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0680727  normal  0.750756 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1339  GTP-binding protein EngA  30.4 
 
 		 463 aa  48.1  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3074  GTP-binding protein Era  25.77 
 
 		 298 aa  47.8  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  26.53 
 
 		 299 aa  48.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  26.53 
 
 		 299 aa  48.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10501  hypothetical protein  28.95 
 
 		 452 aa  48.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.546761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14801  GTP-binding protein Era  26.13 
 
 		 303 aa  47.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3787  GTP-binding protein Era  29.66 
 
 		 468 aa  47.4  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.0434052 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3828  GTP-binding protein Era  22.44 
 
 		 300 aa  47.4  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0285855 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0483  small GTP-binding protein  31.36 
 
 		 580 aa  47  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.742862 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2664  GTP-binding protein, HSR1-like  26.04 
 
 		 581 aa  47  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0819  tRNA modification GTPase TrmE  31.82 
 
 		 452 aa  47  0.0009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62149  predicted protein  31.36 
 
 		 625 aa  47  0.0009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.127466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1917  GTP-binding protein Era  30.95 
 
 		 303 aa  46.6  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.697548 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14661  GTP-binding protein Era  26.13 
 
 		 303 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3856  GTP-binding protein Era  28.89 
 
 		 308 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00601446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0656  GTP-binding protein Era  27.64 
 
 		 311 aa  46.2  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.582352  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7362  GTP-binding protein Era  24.68 
 
 		 320 aa  46.6  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448501  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0245  small GTP-binding protein  27.91 
 
 		 403 aa  46.2  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31412  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2875  GTP-binding protein Era  28.57 
 
 		 318 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158281 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0758  GTP-binding protein Era  33.07 
 
 		 290 aa  46.6  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.334312  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0663  GTP-binding protein Era  27.64 
 
 		 311 aa  45.8  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.747923  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0409  GTP-binding protein EngA  29.03 
 
 		 460 aa  46.2  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>