More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0915 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0915  small GTP-binding protein  100 
 
 		 184 aa  369  1e-101  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.793666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1029  small GTP-binding protein  98.91 
 
 		 184 aa  366  1e-101  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1766  small GTP-binding protein  97.28 
 
 		 184 aa  360  4e-99  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0947  small GTP-binding protein  84.24 
 
 		 184 aa  315  2e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.445595  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0351  small GTP-binding protein  67.21 
 
 		 189 aa  259  1e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0271058  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1458  GTP-binding protein EngA  31.07 
 
 		 445 aa  78.2  0.00000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548717  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3103  small GTP-binding protein  36.54 
 
 		 396 aa  69.3  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0208  GTP-binding protein Era  27.59 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6613  GTP-binding protein Era  29.17 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1243  small GTP-binding protein  33.52 
 
 		 425 aa  64.7  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  30.23 
 
 		 459 aa  65.1  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0683  small GTP-binding protein  31.67 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00203334  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7362  GTP-binding protein Era  28.57 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448501  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0577  GTP-binding protein EngA  30.11 
 
 		 435 aa  62.8  0.000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.416412  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0106  GTP-binding protein  33.16 
 
 		 440 aa  62.8  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1758  small GTP-binding protein  31.35 
 
 		 448 aa  62.4  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1851  GTP-binding protein Era  27.43 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0103  GTP-binding protein  33.68 
 
 		 440 aa  62.4  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000228129  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16490  iron-only hydrogenase maturation protein HydF  32.86 
 
 		 416 aa  62  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.520712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2008  GTP-binding protein EngA  28.73 
 
 		 438 aa  61.6  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1726  GTP-binding protein EngA  28.73 
 
 		 438 aa  61.6  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138722  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  27.75 
 
 		 294 aa  61.2  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0053  GTP-binding protein EngA  33.51 
 
 		 460 aa  60.5  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3591  GTP-binding protein Era  25.7 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1617  GTP-binding protein EngA  27.81 
 
 		 460 aa  60.1  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  26.7 
 
 		 451 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3233  tRNA modification GTPase TrmE  29.41 
 
 		 467 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3096  tRNA modification GTPase TrmE  29.1 
 
 		 466 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000134747 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0137  tRNA modification GTPase TrmE  27.94 
 
 		 457 aa  60.1  0.00000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0027  tRNA modification GTPase TrmE  27.21 
 
 		 454 aa  60.1  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11728  GTP-binding protein EngA  30.54 
 
 		 463 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000105319  normal  0.501933 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0490  small GTP-binding protein  31.82 
 
 		 404 aa  59.7  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0475  small GTP-binding protein  31.82 
 
 		 404 aa  59.7  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  30.29 
 
 		 439 aa  59.3  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0548  tRNA modification GTPase TrmE  32.84 
 
 		 442 aa  59.3  0.00000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2547  tRNA modification GTPase TrmE  29.1 
 
 		 464 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0461446  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3179  tRNA modification GTPase TrmE  29.1 
 
 		 464 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0373252  hitchhiker  0.000409063 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2081  small GTP-binding protein  30.27 
 
 		 416 aa  59.3  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000627073  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3161  tRNA modification GTPase TrmE  29.1 
 
 		 464 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.399046  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0750  GTP-binding protein EngA  28.98 
 
 		 451 aa  59.3  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524371  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1369  GTP-binding protein EngA  28.25 
 
 		 434 aa  58.9  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.911808  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0789  small GTP-binding protein  28.25 
 
 		 443 aa  58.9  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000826073  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1458  GTP-binding protein EngA  31.39 
 
 		 487 aa  58.9  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.961762  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09700  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  26.74 
 
 		 438 aa  58.9  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.253075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4292  tRNA modification GTPase TrmE  28.68 
 
 		 454 aa  58.9  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1323  GTP-binding protein Era  28.08 
 
 		 298 aa  58.5  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0411499  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0743  GTP-binding protein Era  26.52 
 
 		 294 aa  58.5  0.00000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1159  GTP-binding protein EngA  31.71 
 
 		 436 aa  58.5  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427593  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0319  small GTP-binding protein  28.27 
 
 		 464 aa  58.5  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.236663 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0764  GTP-binding protein EngA  27.59 
 
 		 437 aa  58.5  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000517804  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0808  GTP-binding protein Era  33.15 
 
 		 299 aa  58.5  0.00000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3152  tRNA modification GTPase TrmE  28.36 
 
 		 464 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000246642 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0146  small GTP-binding protein  32.22 
 
 		 398 aa  58.2  0.00000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0325934  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4615  tRNA modification GTPase TrmE  28.49 
 
 		 454 aa  58.2  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3568  GTP-binding protein EngA  25.7 
 
 		 455 aa  58.2  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4148  tRNA modification GTPase TrmE  26.95 
 
 		 454 aa  58.2  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.421634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf303  GTP-binding protein EngA  27.37 
 
 		 434 aa  58.2  0.00000007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.778638  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3097  tRNA modification GTPase TrmE  29.1 
 
 		 464 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151562  normal  0.0117151 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1152  GTP-binding protein Era  29.05 
 
 		 313 aa  57.8  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2131  GTP-binding protein EngA  29.26 
 
 		 441 aa  57.8  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000643599  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  29.48 
 
 		 458 aa  57.8  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3213  tRNA modification GTPase TrmE  29.1 
 
 		 489 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  24.58 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4263  tRNA modification GTPase TrmE  28.17 
 
 		 454 aa  57.4  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226045  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3395  tRNA modification GTPase TrmE  29.1 
 
 		 467 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.408647  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0307  tRNA modification GTPase TrmE  29.1 
 
 		 467 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3984  tRNA modification GTPase TrmE  28.36 
 
 		 464 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0990  GTP-binding protein Era  28.92 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0313697 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0490  small GTP-binding protein  32.73 
 
 		 429 aa  57.8  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4928  tRNA modification GTPase TrmE  30.43 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0035842  hitchhiker  0.00000248868 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3865  tRNA modification GTPase TrmE  28.25 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000363316 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1075  small GTP-binding protein  32.41 
 
 		 438 aa  57  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0999  GTP-binding protein Era  32.14 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17106  normal  0.215056 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  25.28 
 
 		 464 aa  57.4  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1338  GTP-binding protein EngA  32.19 
 
 		 439 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.53279  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1172  small GTP-binding protein  30.37 
 
 		 438 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  27.37 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56161  predicted protein  28.19 
 
 		 478 aa  57.4  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0096  tRNA modification GTPase TrmE  29.1 
 
 		 467 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0111  tRNA modification GTPase TrmE  29.1 
 
 		 467 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4260  tRNA modification GTPase TrmE  27.94 
 
 		 454 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4127  tRNA modification GTPase TrmE  26.95 
 
 		 454 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3115  GTP-binding protein EngA  28.47 
 
 		 474 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6518  tRNA modification GTPase TrmE  28.36 
 
 		 464 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03534  hypothetical protein  27.94 
 
 		 454 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1841  ferrous iron transport protein B  26.09 
 
 		 769 aa  57  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.547404  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4070  tRNA modification GTPase TrmE  26.95 
 
 		 467 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125734  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4234  tRNA modification GTPase TrmE  26.95 
 
 		 467 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4469  tRNA modification GTPase TrmE  29.1 
 
 		 464 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0533201 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2973  GTP-binding protein Era  26.79 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1738  GTP-binding protein Era  24.48 
 
 		 329 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.355873  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4073  tRNA modification GTPase TrmE  27.94 
 
 		 454 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.420944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2927  GTP-binding protein EngA  29.79 
 
 		 471 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1428  GTP-binding protein EngA  28.99 
 
 		 436 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0692  GTP-binding protein EngA  27.54 
 
 		 470 aa  57  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4219  tRNA modification GTPase TrmE  27.94 
 
 		 454 aa  56.6  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.99545  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2846  GTP-binding protein EngA  28.47 
 
 		 473 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.64271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2842  tRNA modification GTPase TrmE  29.1 
 
 		 488 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00155334  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2243  tRNA modification GTPase TrmE  29.1 
 
 		 488 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2942  GTP-binding protein EngA  29.79 
 
 		 471 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>