More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0146 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_0146  small GTP-binding protein  100 
 
 		 398 aa  792    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0325934  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0318  small GTP-binding protein domain-containing protein  55.98 
 
 		 402 aa  426  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1243  small GTP-binding protein  56.68 
 
 		 425 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3103  small GTP-binding protein  52.54 
 
 		 396 aa  403  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2152  small GTP-binding protein  53.27 
 
 		 409 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0165  small GTP-binding protein  55.25 
 
 		 427 aa  395  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0683  small GTP-binding protein  52.78 
 
 		 408 aa  394  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00203334  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1277  small GTP-binding protein domain-containing protein  53.94 
 
 		 405 aa  393  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.038791  hitchhiker  0.00000385407 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0473  small GTP-binding protein  50.38 
 
 		 403 aa  388  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0038153  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0183  small GTP-binding protein  53.69 
 
 		 408 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1494  small GTP-binding protein  55.39 
 
 		 412 aa  386  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1843  small GTP-binding protein  53.77 
 
 		 422 aa  384  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19310  small GTP-binding protein  52.02 
 
 		 411 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00194835  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2276  small GTP-binding protein domain-containing protein  52.9 
 
 		 400 aa  376  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0042  small GTP-binding protein  49.36 
 
 		 400 aa  376  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1629  GTPases  51.01 
 
 		 416 aa  371  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000232915  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0106  GTP-binding protein  45.54 
 
 		 440 aa  364  1e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0103  GTP-binding protein  45.54 
 
 		 440 aa  364  2e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000228129  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1387  small GTP-binding protein  50.5 
 
 		 410 aa  360  2e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0637341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16490  iron-only hydrogenase maturation protein HydF  49.26 
 
 		 416 aa  359  5e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.520712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2081  small GTP-binding protein  47.87 
 
 		 416 aa  358  9e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000627073  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1569  small GTP-binding protein  48.74 
 
 		 407 aa  355  5.999999999999999e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.627873  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2638  small GTP-binding protein  46.17 
 
 		 394 aa  355  8.999999999999999e-97  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0705  small GTP-binding protein  48.1 
 
 		 412 aa  348  1e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.131335  hitchhiker  0.000692522 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3256  small GTP-binding protein  47.85 
 
 		 412 aa  346  4e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00305193  hitchhiker  0.00001491 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3926  GTP-binding protein  47.83 
 
 		 394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0490  small GTP-binding protein  46.38 
 
 		 404 aa  333  4e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0475  small GTP-binding protein  46.38 
 
 		 404 aa  333  4e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1501  small GTP-binding protein  47.72 
 
 		 408 aa  318  7.999999999999999e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.206775  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0245  small GTP-binding protein  43.91 
 
 		 403 aa  307  3e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31412  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1862  small GTP-binding protein  42.89 
 
 		 398 aa  305  1.0000000000000001e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.803475  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1361  small GTP-binding protein  42.86 
 
 		 396 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.311924  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0272  small GTP-binding protein  39.09 
 
 		 382 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.934792  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0266  small GTP-binding protein  38.96 
 
 		 377 aa  256  5e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.410874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1098  small GTP-binding protein domain-containing protein  40.49 
 
 		 262 aa  171  2e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3073  tRNA modification GTPase TrmE  34.42 
 
 		 446 aa  84.3  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2929  tRNA modification GTPase TrmE  33.49 
 
 		 446 aa  79.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0392  GTP-binding protein EngA  31.68 
 
 		 494 aa  77  0.0000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  32.53 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  30.12 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  32.53 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2775  tRNA modification GTPase TrmE  34.88 
 
 		 452 aa  73.9  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  31.61 
 
 		 447 aa  73.9  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  34.71 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2846  GTP-binding protein EngA  39.63 
 
 		 473 aa  73.2  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.64271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3984  tRNA modification GTPase TrmE  36.36 
 
 		 464 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  31.74 
 
 		 298 aa  72.8  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1753  ribosome-associated GTPase EngA  32.87 
 
 		 477 aa  72.4  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  30.3 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  31.33 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  31.33 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  31.33 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  33.9 
 
 		 297 aa  72  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  31.33 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  31.33 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  31.25 
 
 		 301 aa  72  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04098  tRNA modification GTPase  37.5 
 
 		 462 aa  72  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  31.33 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  31.33 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  33.54 
 
 		 458 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0248  tRNA modification GTPase TrmE  33.74 
 
 		 473 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0053  GTP-binding protein EngA  34.32 
 
 		 460 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1260  tRNA modification GTPase TrmE  31.85 
 
 		 449 aa  70.9  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0005  tRNA modification GTPase TrmE  35.26 
 
 		 481 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75194  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  33.33 
 
 		 458 aa  70.5  0.00000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4263  tRNA modification GTPase TrmE  35.15 
 
 		 454 aa  70.5  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226045  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  31.33 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  33.14 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  31.33 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  34.91 
 
 		 461 aa  70.5  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  29.09 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0435  GTP-binding protein EngA  32.32 
 
 		 460 aa  70.1  0.00000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0409  GTP-binding protein EngA  32.32 
 
 		 460 aa  70.1  0.00000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1572  GTP-binding protein EngA  32.32 
 
 		 460 aa  69.7  0.00000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4774  tRNA modification GTPase TrmE  33.54 
 
 		 467 aa  69.7  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  31.33 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2547  tRNA modification GTPase TrmE  33.13 
 
 		 464 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0461446  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3161  tRNA modification GTPase TrmE  33.13 
 
 		 464 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.399046  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0777  GTP-binding protein EngA  33.91 
 
 		 462 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  32.56 
 
 		 306 aa  69.3  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3302  GTP-binding protein EngA  36.2 
 
 		 474 aa  69.3  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3456  tRNA modification GTPase TrmE  33.33 
 
 		 481 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3152  tRNA modification GTPase TrmE  32.98 
 
 		 464 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000246642 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4241  tRNA modification GTPase TrmE  33.33 
 
 		 469 aa  69.3  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207719  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4469  tRNA modification GTPase TrmE  33.73 
 
 		 464 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0533201 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4292  tRNA modification GTPase TrmE  34.15 
 
 		 454 aa  69.3  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3115  GTP-binding protein EngA  39.16 
 
 		 474 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3568  GTP-binding protein EngA  28.4 
 
 		 455 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  33.33 
 
 		 456 aa  68.9  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3755  tRNA modification GTPase TrmE  33.33 
 
 		 481 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  32.3 
 
 		 458 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  38.52 
 
 		 460 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1172  small GTP-binding protein  37.78 
 
 		 438 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3097  tRNA modification GTPase TrmE  33.73 
 
 		 464 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151562  normal  0.0117151 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3161  tRNA modification GTPase TrmE  39.88 
 
 		 471 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.258894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4158  tRNA modification GTPase TrmE  34.15 
 
 		 454 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000196641  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3179  tRNA modification GTPase TrmE  33.13 
 
 		 464 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0373252  hitchhiker  0.000409063 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3213  tRNA modification GTPase TrmE  33.73 
 
 		 489 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4615  tRNA modification GTPase TrmE  33.54 
 
 		 454 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1339  GTP-binding protein EngA  42.42 
 
 		 463 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>