More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0183 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0183  small GTP-binding protein  100 
 
 		 408 aa  824    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2152  small GTP-binding protein  63.9 
 
 		 409 aa  527  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1277  small GTP-binding protein domain-containing protein  67.08 
 
 		 405 aa  520  1e-146  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.038791  hitchhiker  0.00000385407 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0165  small GTP-binding protein  64.34 
 
 		 427 aa  509  1e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1243  small GTP-binding protein  63.28 
 
 		 425 aa  501  1e-141  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0683  small GTP-binding protein  59.56 
 
 		 408 aa  487  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00203334  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0473  small GTP-binding protein  61.9 
 
 		 403 aa  484  1e-135  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0038153  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0318  small GTP-binding protein domain-containing protein  59.05 
 
 		 402 aa  474  1e-132  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1629  GTPases  57.28 
 
 		 416 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000232915  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1843  small GTP-binding protein  58.78 
 
 		 422 aa  464  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0042  small GTP-binding protein  56.39 
 
 		 400 aa  457  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1494  small GTP-binding protein  55.61 
 
 		 412 aa  449  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2081  small GTP-binding protein  53.03 
 
 		 416 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000627073  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19310  small GTP-binding protein  53.07 
 
 		 411 aa  432  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00194835  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1387  small GTP-binding protein  53.07 
 
 		 410 aa  434  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0637341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1569  small GTP-binding protein  53.22 
 
 		 407 aa  426  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.627873  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2276  small GTP-binding protein domain-containing protein  54.55 
 
 		 400 aa  412  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16490  iron-only hydrogenase maturation protein HydF  51 
 
 		 416 aa  394  1e-108  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.520712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3256  small GTP-binding protein  50.38 
 
 		 412 aa  391  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00305193  hitchhiker  0.00001491 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0705  small GTP-binding protein  49.87 
 
 		 412 aa  389  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.131335  hitchhiker  0.000692522 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3926  GTP-binding protein  51.03 
 
 		 394 aa  385  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0146  small GTP-binding protein  53.69 
 
 		 398 aa  385  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0325934  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1501  small GTP-binding protein  48.77 
 
 		 408 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.206775  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3103  small GTP-binding protein  46.1 
 
 		 396 aa  364  1e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0490  small GTP-binding protein  46.84 
 
 		 404 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0475  small GTP-binding protein  46.84 
 
 		 404 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1361  small GTP-binding protein  46.82 
 
 		 396 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.311924  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0245  small GTP-binding protein  45.23 
 
 		 403 aa  350  2e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31412  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0103  GTP-binding protein  43.02 
 
 		 440 aa  345  8.999999999999999e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000228129  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0106  GTP-binding protein  43.25 
 
 		 440 aa  345  8.999999999999999e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2638  small GTP-binding protein  44.64 
 
 		 394 aa  330  2e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1862  small GTP-binding protein  44.47 
 
 		 398 aa  327  2.0000000000000001e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.803475  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0272  small GTP-binding protein  39.8 
 
 		 382 aa  278  1e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.934792  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0266  small GTP-binding protein  41.88 
 
 		 377 aa  268  2e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.410874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1098  small GTP-binding protein domain-containing protein  40.7 
 
 		 262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  41.88 
 
 		 462 aa  96.3  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  39.51 
 
 		 460 aa  89  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1395  GTP-binding protein EngA  35.29 
 
 		 441 aa  85.9  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3213  tRNA modification GTPase TrmE  36.65 
 
 		 489 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3097  tRNA modification GTPase TrmE  36.65 
 
 		 464 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151562  normal  0.0117151 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3547  tRNA modification GTPase TrmE  35.26 
 
 		 488 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3395  tRNA modification GTPase TrmE  35.26 
 
 		 467 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.408647  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0307  tRNA modification GTPase TrmE  35.26 
 
 		 467 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2243  tRNA modification GTPase TrmE  35.26 
 
 		 488 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1204  GTP-binding protein EngA  35.54 
 
 		 442 aa  85.5  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.109244  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0096  tRNA modification GTPase TrmE  35.26 
 
 		 467 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3233  tRNA modification GTPase TrmE  34.68 
 
 		 467 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0111  tRNA modification GTPase TrmE  35.26 
 
 		 467 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2842  tRNA modification GTPase TrmE  35.26 
 
 		 488 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00155334  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2547  tRNA modification GTPase TrmE  36.65 
 
 		 464 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0461446  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3161  tRNA modification GTPase TrmE  36.65 
 
 		 464 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.399046  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3179  tRNA modification GTPase TrmE  36.65 
 
 		 464 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0373252  hitchhiker  0.000409063 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  36.02 
 
 		 461 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0886  tRNA modification GTPase TrmE  39.26 
 
 		 478 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00940326 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3152  tRNA modification GTPase TrmE  36.02 
 
 		 464 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000246642 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1177  GTP-binding protein  34.12 
 
 		 441 aa  84  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3149  GTP-binding protein EngA  33.33 
 
 		 441 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.421281  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2757  tRNA modification GTPase TrmE  33.18 
 
 		 446 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3038  tRNA modification GTPase TrmE  36.13 
 
 		 448 aa  82.8  0.000000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.38062  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4200  tRNA modification GTPase TrmE  37.65 
 
 		 448 aa  82.4  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0153583 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  32.93 
 
 		 306 aa  82.8  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6518  tRNA modification GTPase TrmE  36.02 
 
 		 464 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3656  tRNA modification GTPase TrmE  36.65 
 
 		 460 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  35.93 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4469  tRNA modification GTPase TrmE  35.67 
 
 		 464 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0533201 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2263  GTP-binding protein EngA  36.42 
 
 		 506 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3096  tRNA modification GTPase TrmE  34.3 
 
 		 466 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000134747 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2453  tRNA modification GTPase TrmE  41.88 
 
 		 450 aa  79.7  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3984  tRNA modification GTPase TrmE  34.5 
 
 		 464 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  37.18 
 
 		 447 aa  79.3  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2136  tRNA modification GTPase TrmE  37.34 
 
 		 451 aa  78.6  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0062  GTP-binding protein EngA  36.2 
 
 		 455 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2392  tRNA modification GTPase TrmE  38.2 
 
 		 468 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0118764  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3610  tRNA modification GTPase TrmE  33.33 
 
 		 475 aa  78.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0005  tRNA modification GTPase TrmE  36.9 
 
 		 481 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75194  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  35.62 
 
 		 455 aa  77.8  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  34.81 
 
 		 458 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0117  tRNA modification GTPase TrmE  36.31 
 
 		 455 aa  77.8  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1783  tRNA modification GTPase TrmE  37.65 
 
 		 454 aa  77.4  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.028326  normal  0.377376 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4729  tRNA modification GTPase TrmE  36.2 
 
 		 454 aa  77.8  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2008  GTP-binding protein EngA  31.33 
 
 		 438 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1726  GTP-binding protein EngA  31.33 
 
 		 438 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138722  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49818  predicted protein  37.21 
 
 		 525 aa  77.4  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2314  GTP-binding protein EngA  31.48 
 
 		 439 aa  77  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3456  tRNA modification GTPase TrmE  37.06 
 
 		 481 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5298  tRNA modification GTPase TrmE  34.94 
 
 		 471 aa  77  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3073  tRNA modification GTPase TrmE  38.22 
 
 		 446 aa  77  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2929  tRNA modification GTPase TrmE  37.11 
 
 		 446 aa  77  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  31.67 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  35 
 
 		 458 aa  77  0.0000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  36.71 
 
 		 460 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0104  tRNA modification GTPase TrmE  37.85 
 
 		 462 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3755  tRNA modification GTPase TrmE  37.06 
 
 		 481 aa  76.6  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02181  tRNA modification GTPase TrmE  34.29 
 
 		 461 aa  76.6  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5011  tRNA modification GTPase TrmE  34.05 
 
 		 490 aa  76.6  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3159  tRNA modification GTPase TrmE  39.55 
 
 		 457 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4133  tRNA modification GTPase TrmE  34.53 
 
 		 456 aa  76.6  0.0000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  33.12 
 
 		 458 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3161  tRNA modification GTPase TrmE  39.64 
 
 		 471 aa  76.3  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.258894  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0857  GTP-binding protein EngA  32.42 
 
 		 487 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>