More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_19310 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_19310  small GTP-binding protein  100 
 
 
411 aa  832    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00194835  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1277  small GTP-binding protein domain-containing protein  56.13 
 
 
405 aa  473  1e-132  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.038791  hitchhiker  0.00000385407 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0318  small GTP-binding protein domain-containing protein  56.39 
 
 
402 aa  471  1e-132  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0683  small GTP-binding protein  56.47 
 
 
408 aa  451  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00203334  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2152  small GTP-binding protein  54.39 
 
 
409 aa  451  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1569  small GTP-binding protein  54.19 
 
 
407 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.627873  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1243  small GTP-binding protein  55.5 
 
 
425 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0473  small GTP-binding protein  55.28 
 
 
403 aa  443  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0038153  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0183  small GTP-binding protein  53.07 
 
 
408 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0165  small GTP-binding protein  51.69 
 
 
427 aa  421  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0042  small GTP-binding protein  51.38 
 
 
400 aa  409  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1629  GTPases  50 
 
 
416 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000232915  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1843  small GTP-binding protein  49.39 
 
 
422 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1494  small GTP-binding protein  48.92 
 
 
412 aa  393  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2081  small GTP-binding protein  48.65 
 
 
416 aa  390  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000627073  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3103  small GTP-binding protein  49.75 
 
 
396 aa  385  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2276  small GTP-binding protein domain-containing protein  49.62 
 
 
400 aa  383  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0705  small GTP-binding protein  48.53 
 
 
412 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.131335  hitchhiker  0.000692522 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0146  small GTP-binding protein  52.02 
 
 
398 aa  380  1e-104  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0325934  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16490  iron-only hydrogenase maturation protein HydF  48.4 
 
 
416 aa  379  1e-104  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.520712  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3256  small GTP-binding protein  48.28 
 
 
412 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00305193  hitchhiker  0.00001491 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1387  small GTP-binding protein  47.07 
 
 
410 aa  373  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0637341  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0475  small GTP-binding protein  46.84 
 
 
404 aa  364  2e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0490  small GTP-binding protein  46.84 
 
 
404 aa  364  2e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3926  GTP-binding protein  47.21 
 
 
394 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0106  GTP-binding protein  45.08 
 
 
440 aa  356  3.9999999999999996e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0245  small GTP-binding protein  45.43 
 
 
403 aa  354  1e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31412  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0103  GTP-binding protein  44.39 
 
 
440 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000228129  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1501  small GTP-binding protein  45.61 
 
 
408 aa  349  6e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.206775  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2638  small GTP-binding protein  45.2 
 
 
394 aa  347  3e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1361  small GTP-binding protein  46.06 
 
 
396 aa  344  1e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.311924  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1862  small GTP-binding protein  44.58 
 
 
398 aa  341  1e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.803475  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0272  small GTP-binding protein  39.9 
 
 
382 aa  275  7e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.934792  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0266  small GTP-binding protein  39.85 
 
 
377 aa  260  3e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.410874  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1098  small GTP-binding protein domain-containing protein  40.4 
 
 
262 aa  175  9.999999999999999e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0435  GTP-binding protein EngA  27.95 
 
 
460 aa  87  6e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0409  GTP-binding protein EngA  27.95 
 
 
460 aa  87  6e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1204  GTP-binding protein EngA  35.09 
 
 
442 aa  86.3  9e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.109244  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2945  tRNA modification GTPase TrmE  34.55 
 
 
465 aa  86.3  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0139032  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3115  GTP-binding protein EngA  37.06 
 
 
474 aa  86.3  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1572  GTP-binding protein EngA  27.95 
 
 
460 aa  86.3  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1937  GTP-binding protein EngA  36.81 
 
 
449 aa  85.9  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1609  GTP-binding protein EngA  36.81 
 
 
449 aa  85.9  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0528486 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3302  GTP-binding protein EngA  34.57 
 
 
474 aa  85.5  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0863  GTP-binding protein EngA  34.97 
 
 
461 aa  85.5  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.145711  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0536  GTP-binding protein EngA  28.19 
 
 
461 aa  84.3  0.000000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1177  GTP-binding protein  34.5 
 
 
441 aa  83.6  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  29.7 
 
 
460 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0692  GTP-binding protein EngA  36.65 
 
 
470 aa  84  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1395  GTP-binding protein EngA  34.5 
 
 
441 aa  83.6  0.000000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3126  GTP-binding protein EngA  36.21 
 
 
454 aa  83.6  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  30.6 
 
 
460 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2392  tRNA modification GTPase TrmE  34.34 
 
 
468 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0118764  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2131  GTP-binding protein EngA  30.14 
 
 
441 aa  82.8  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000643599  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  31.4 
 
 
455 aa  82.4  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2008  GTP-binding protein EngA  33.74 
 
 
438 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1726  GTP-binding protein EngA  33.74 
 
 
438 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138722  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  33.33 
 
 
299 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  31.33 
 
 
458 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  33.13 
 
 
294 aa  81.6  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2159  GTP-binding protein EngA  31.58 
 
 
436 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000018961  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2846  GTP-binding protein EngA  36.53 
 
 
473 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.64271  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  32.08 
 
 
461 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  31.58 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1753  ribosome-associated GTPase EngA  29.14 
 
 
477 aa  81.3  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0359  GTP-binding protein EngA  32.57 
 
 
436 aa  81.3  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  31.05 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  28.42 
 
 
444 aa  80.5  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4514  GTP-binding protein EngA  37.11 
 
 
477 aa  80.5  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.194124 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  31.14 
 
 
439 aa  80.5  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1043  GTP-binding protein EngA  29.65 
 
 
436 aa  80.5  0.00000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.617691  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0488  GTP-binding protein EngA  32.11 
 
 
483 aa  80.1  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1620  GTP-binding protein EngA  31.43 
 
 
436 aa  80.5  0.00000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0460  GTP-binding protein EngA  32.16 
 
 
436 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  36.2 
 
 
460 aa  80.1  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1203  small GTP-binding protein  37.35 
 
 
490 aa  80.1  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.996743  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4774  tRNA modification GTPase TrmE  31.4 
 
 
467 aa  79.7  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0392  GTP-binding protein EngA  29.12 
 
 
494 aa  79.7  0.00000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  30.53 
 
 
301 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1160  GTP-binding protein EngA  31.4 
 
 
439 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0769833  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0375  GTP-binding protein EngA  34.38 
 
 
483 aa  79  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  30.54 
 
 
464 aa  79.3  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0752  GTP-binding protein EngA  32.95 
 
 
440 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00177757 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1325  hypothetical protein  34.95 
 
 
441 aa  79.3  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1416  GTP-binding protein EngA  33.12 
 
 
446 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000592606 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0764  GTP-binding protein EngA  33.54 
 
 
437 aa  79  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000517804  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2824  tRNA modification GTPase TrmE  32.08 
 
 
446 aa  78.6  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3386  GTP-binding protein EngA  32.47 
 
 
442 aa  78.6  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0390  GTP-binding protein EngA  34.38 
 
 
483 aa  78.6  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.270758  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0737  GTP-binding protein EngA  32.37 
 
 
440 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3785  GTP-binding protein EngA  27.13 
 
 
436 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0456792  normal  0.0699486 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1428  GTP-binding protein EngA  27.13 
 
 
436 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2498  GTP-binding protein EngA  35.29 
 
 
602 aa  78.2  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  31.85 
 
 
458 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  31.85 
 
 
458 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0886  tRNA modification GTPase TrmE  31.29 
 
 
478 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00940326 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0751  GTP-binding protein EngA  30.77 
 
 
440 aa  78.6  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1631  GTP-binding protein EngA  28.47 
 
 
436 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1598  GTP-binding protein EngA  28.47 
 
 
436 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000589883 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1525  GTP-binding protein EngA  28.47 
 
 
436 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>