More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1629 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1629  GTPases  100 
 
 		 416 aa  852    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000232915  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1494  small GTP-binding protein  72.79 
 
 		 412 aa  634    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1843  small GTP-binding protein  68.97 
 
 		 422 aa  599  1e-170  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1387  small GTP-binding protein  56.44 
 
 		 410 aa  476  1e-133  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0637341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0183  small GTP-binding protein  57.28 
 
 		 408 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2152  small GTP-binding protein  54.9 
 
 		 409 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1277  small GTP-binding protein domain-containing protein  56.58 
 
 		 405 aa  447  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.038791  hitchhiker  0.00000385407 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0318  small GTP-binding protein domain-containing protein  55.45 
 
 		 402 aa  441  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1243  small GTP-binding protein  54.34 
 
 		 425 aa  437  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2276  small GTP-binding protein domain-containing protein  53.81 
 
 		 400 aa  430  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0683  small GTP-binding protein  52.45 
 
 		 408 aa  429  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00203334  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0165  small GTP-binding protein  54.11 
 
 		 427 aa  431  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0473  small GTP-binding protein  51.86 
 
 		 403 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0038153  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0042  small GTP-binding protein  50.63 
 
 		 400 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19310  small GTP-binding protein  50 
 
 		 411 aa  399  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00194835  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0705  small GTP-binding protein  48.99 
 
 		 412 aa  397  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.131335  hitchhiker  0.000692522 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3256  small GTP-binding protein  48.74 
 
 		 412 aa  395  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00305193  hitchhiker  0.00001491 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1569  small GTP-binding protein  48.27 
 
 		 407 aa  390  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.627873  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3926  GTP-binding protein  49.23 
 
 		 394 aa  387  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3103  small GTP-binding protein  49.74 
 
 		 396 aa  381  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2081  small GTP-binding protein  45.99 
 
 		 416 aa  375  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000627073  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0146  small GTP-binding protein  51.01 
 
 		 398 aa  371  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0325934  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0490  small GTP-binding protein  45.64 
 
 		 404 aa  361  1e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0475  small GTP-binding protein  45.64 
 
 		 404 aa  361  1e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0245  small GTP-binding protein  45.61 
 
 		 403 aa  351  1e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31412  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1501  small GTP-binding protein  45.57 
 
 		 408 aa  348  7e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.206775  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16490  iron-only hydrogenase maturation protein HydF  44.42 
 
 		 416 aa  343  2.9999999999999997e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.520712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1361  small GTP-binding protein  44.92 
 
 		 396 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.311924  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0106  GTP-binding protein  42.43 
 
 		 440 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0103  GTP-binding protein  42.2 
 
 		 440 aa  336  5e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000228129  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2638  small GTP-binding protein  43.51 
 
 		 394 aa  333  4e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1862  small GTP-binding protein  41.9 
 
 		 398 aa  314  1.9999999999999998e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.803475  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0272  small GTP-binding protein  39.85 
 
 		 382 aa  264  2e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.934792  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0266  small GTP-binding protein  37.86 
 
 		 377 aa  257  3e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.410874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1098  small GTP-binding protein domain-containing protein  44.95 
 
 		 262 aa  188  1e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  36.36 
 
 		 458 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  33.71 
 
 		 460 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4729  tRNA modification GTPase TrmE  34.52 
 
 		 454 aa  80.1  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  31.4 
 
 		 460 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3096  tRNA modification GTPase TrmE  38.79 
 
 		 466 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000134747 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0692  GTP-binding protein EngA  36.2 
 
 		 470 aa  77.4  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4469  tRNA modification GTPase TrmE  37.42 
 
 		 464 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0533201 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  37.04 
 
 		 459 aa  75.9  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3984  tRNA modification GTPase TrmE  36.81 
 
 		 464 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0392  GTP-binding protein EngA  34.65 
 
 		 494 aa  75.1  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4774  tRNA modification GTPase TrmE  33.52 
 
 		 467 aa  75.1  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3038  tRNA modification GTPase TrmE  34.64 
 
 		 448 aa  74.7  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.38062  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  31.88 
 
 		 464 aa  74.7  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0053  GTP-binding protein EngA  34.65 
 
 		 460 aa  74.3  0.000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3302  GTP-binding protein EngA  33.13 
 
 		 474 aa  73.9  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3115  GTP-binding protein EngA  31.79 
 
 		 474 aa  74.3  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  33.77 
 
 		 459 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0314  tRNA modification GTPase TrmE  34.36 
 
 		 450 aa  74.3  0.000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00576337  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0291  tRNA modification GTPase TrmE  37.82 
 
 		 449 aa  74.3  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  36.48 
 
 		 461 aa  73.9  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  34.93 
 
 		 460 aa  73.6  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2846  GTP-binding protein EngA  31.95 
 
 		 473 aa  73.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.64271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1753  ribosome-associated GTPase EngA  33.86 
 
 		 477 aa  73.6  0.000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0435  GTP-binding protein EngA  34.38 
 
 		 460 aa  73.2  0.000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0409  GTP-binding protein EngA  34.38 
 
 		 460 aa  73.2  0.000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0886  tRNA modification GTPase TrmE  34.38 
 
 		 478 aa  73.2  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00940326 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1387  GTP-binding protein Era  34.59 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.263237  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  31.58 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2974  GTP-binding protein Era  34.83 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0899132  hitchhiker  0.00507105 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3560  GTP-binding protein Era  31.58 
 
 		 314 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3152  tRNA modification GTPase TrmE  36.81 
 
 		 464 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000246642 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  34.34 
 
 		 463 aa  72.4  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3656  tRNA modification GTPase TrmE  33.74 
 
 		 460 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1582  tRNA modification GTPase TrmE  33.95 
 
 		 462 aa  72.4  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3213  tRNA modification GTPase TrmE  34.78 
 
 		 489 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0319  small GTP-binding protein  30.32 
 
 		 464 aa  72.4  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.236663 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3161  tRNA modification GTPase TrmE  34.78 
 
 		 464 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.399046  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6518  tRNA modification GTPase TrmE  34.78 
 
 		 464 aa  72  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49818  predicted protein  35.84 
 
 		 525 aa  72  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2791  tRNA modification GTPase TrmE  35.19 
 
 		 459 aa  72.4  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2734  tRNA modification GTPase TrmE  35.19 
 
 		 459 aa  72.4  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3097  tRNA modification GTPase TrmE  34.78 
 
 		 464 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151562  normal  0.0117151 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2547  tRNA modification GTPase TrmE  34.78 
 
 		 464 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0461446  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3560  tRNA modification GTPase TrmE  33.09 
 
 		 457 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1572  GTP-binding protein EngA  33.59 
 
 		 460 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  34.46 
 
 		 454 aa  70.9  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1201  hypothetical protein  36.59 
 
 		 455 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128445 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1556  tRNA modification GTPase TrmE  37.4 
 
 		 464 aa  70.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  34.05 
 
 		 450 aa  70.9  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02641  tRNA modification GTPase TrmE  38.02 
 
 		 464 aa  70.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3179  tRNA modification GTPase TrmE  34.78 
 
 		 464 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0373252  hitchhiker  0.000409063 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  35.26 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1401  GTP-binding protein Era  33.56 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  33.33 
 
 		 461 aa  70.5  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17011  GTP-binding protein Era  33.14 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.205656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1122  GTP-binding protein Era  33.56 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0777  GTP-binding protein EngA  34.09 
 
 		 462 aa  70.5  0.00000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4133  tRNA modification GTPase TrmE  32.52 
 
 		 456 aa  70.1  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2498  GTP-binding protein EngA  33.15 
 
 		 602 aa  70.1  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04098  tRNA modification GTPase  32.77 
 
 		 462 aa  69.7  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4514  GTP-binding protein EngA  30.86 
 
 		 477 aa  69.7  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.194124 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4200  tRNA modification GTPase TrmE  33.33 
 
 		 448 aa  69.7  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0153583 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19471  GTP-binding protein Era  33.15 
 
 		 343 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0536  GTP-binding protein EngA  34.38 
 
 		 461 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2453  tRNA modification GTPase TrmE  37.7 
 
 		 450 aa  69.3  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>