More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1569 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_1569  small GTP-binding protein  100 
 
 		 407 aa  828    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.627873  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19310  small GTP-binding protein  54.19 
 
 		 411 aa  465  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00194835  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0683  small GTP-binding protein  56.05 
 
 		 408 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00203334  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0473  small GTP-binding protein  57.07 
 
 		 403 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0038153  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1277  small GTP-binding protein domain-containing protein  53.6 
 
 		 405 aa  450  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.038791  hitchhiker  0.00000385407 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0318  small GTP-binding protein domain-containing protein  53.63 
 
 		 402 aa  445  1.0000000000000001e-124  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0183  small GTP-binding protein  53.22 
 
 		 408 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0042  small GTP-binding protein  55.14 
 
 		 400 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2152  small GTP-binding protein  53.77 
 
 		 409 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2081  small GTP-binding protein  54.34 
 
 		 416 aa  435  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000627073  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1243  small GTP-binding protein  53 
 
 		 425 aa  431  1e-119  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0165  small GTP-binding protein  50 
 
 		 427 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1843  small GTP-binding protein  48.76 
 
 		 422 aa  410  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1629  GTPases  48.27 
 
 		 416 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000232915  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16490  iron-only hydrogenase maturation protein HydF  47.65 
 
 		 416 aa  403  1e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.520712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3103  small GTP-binding protein  51.26 
 
 		 396 aa  394  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1494  small GTP-binding protein  46.06 
 
 		 412 aa  393  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1387  small GTP-binding protein  45.43 
 
 		 410 aa  383  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0637341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0490  small GTP-binding protein  44.92 
 
 		 404 aa  379  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2276  small GTP-binding protein domain-containing protein  45.06 
 
 		 400 aa  379  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3256  small GTP-binding protein  46.46 
 
 		 412 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00305193  hitchhiker  0.00001491 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0475  small GTP-binding protein  44.92 
 
 		 404 aa  379  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3926  GTP-binding protein  46.27 
 
 		 394 aa  375  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0106  GTP-binding protein  46.92 
 
 		 440 aa  375  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0705  small GTP-binding protein  45.61 
 
 		 412 aa  376  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.131335  hitchhiker  0.000692522 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0103  GTP-binding protein  47.38 
 
 		 440 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000228129  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0146  small GTP-binding protein  49.49 
 
 		 398 aa  366  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0325934  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1862  small GTP-binding protein  47.21 
 
 		 398 aa  365  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.803475  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1361  small GTP-binding protein  45.9 
 
 		 396 aa  350  2e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.311924  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0245  small GTP-binding protein  44.05 
 
 		 403 aa  345  8.999999999999999e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31412  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2638  small GTP-binding protein  47.98 
 
 		 394 aa  341  1e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1501  small GTP-binding protein  40.1 
 
 		 408 aa  334  2e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.206775  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0266  small GTP-binding protein  42.3 
 
 		 377 aa  296  5e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.410874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0272  small GTP-binding protein  43.51 
 
 		 382 aa  293  4e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.934792  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1098  small GTP-binding protein domain-containing protein  44.44 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0005  tRNA modification GTPase TrmE  33.33 
 
 		 481 aa  88.2  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75194  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0392  GTP-binding protein EngA  33.14 
 
 		 494 aa  89  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0062  GTP-binding protein EngA  36.69 
 
 		 455 aa  86.3  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3456  tRNA modification GTPase TrmE  33.93 
 
 		 481 aa  86.3  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1753  ribosome-associated GTPase EngA  33.53 
 
 		 477 aa  86.3  9e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3755  tRNA modification GTPase TrmE  33.33 
 
 		 481 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3456  tRNA modification GTPase TrmE  36.08 
 
 		 475 aa  83.6  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2263  GTP-binding protein EngA  38.71 
 
 		 506 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0193  GTP-binding protein EngA  37.18 
 
 		 495 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl199  GTP-binding protein EngA  37.13 
 
 		 435 aa  82.8  0.00000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.316366  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3152  tRNA modification GTPase TrmE  29.59 
 
 		 464 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000246642 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0199  tRNA modification GTPase TrmE  33.76 
 
 		 473 aa  81.6  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3610  tRNA modification GTPase TrmE  32 
 
 		 475 aa  81.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3097  tRNA modification GTPase TrmE  30.18 
 
 		 464 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151562  normal  0.0117151 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3213  tRNA modification GTPase TrmE  30.18 
 
 		 489 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3984  tRNA modification GTPase TrmE  33.54 
 
 		 464 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0409  GTP-binding protein EngA  34 
 
 		 460 aa  80.9  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4200  tRNA modification GTPase TrmE  34.36 
 
 		 448 aa  81.3  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0153583 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6518  tRNA modification GTPase TrmE  29.59 
 
 		 464 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2124  tRNA modification GTPase TrmE  33.76 
 
 		 452 aa  81.6  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0435  GTP-binding protein EngA  34 
 
 		 460 aa  80.9  0.00000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2547  tRNA modification GTPase TrmE  29.59 
 
 		 464 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0461446  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3161  tRNA modification GTPase TrmE  29.59 
 
 		 464 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.399046  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4133  tRNA modification GTPase TrmE  39.44 
 
 		 456 aa  80.1  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3096  tRNA modification GTPase TrmE  37.7 
 
 		 466 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000134747 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3179  tRNA modification GTPase TrmE  29.59 
 
 		 464 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0373252  hitchhiker  0.000409063 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1477  GTP-binding protein EngA  37.5 
 
 		 454 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  37.11 
 
 		 461 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1572  GTP-binding protein EngA  33.33 
 
 		 460 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0764  GTP-binding protein EngA  28.95 
 
 		 437 aa  78.6  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000517804  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3751  GTP-binding protein EngA  37.4 
 
 		 449 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4469  tRNA modification GTPase TrmE  31.25 
 
 		 464 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0533201 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2824  tRNA modification GTPase TrmE  30.49 
 
 		 446 aa  77.8  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2008  GTP-binding protein EngA  30.54 
 
 		 438 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1726  GTP-binding protein EngA  30.54 
 
 		 438 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138722  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  35.93 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  34.81 
 
 		 463 aa  77.8  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3149  GTP-binding protein EngA  35.33 
 
 		 441 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.421281  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3233  tRNA modification GTPase TrmE  30.67 
 
 		 467 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  37.97 
 
 		 458 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3568  GTP-binding protein EngA  39.68 
 
 		 455 aa  77  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3395  tRNA modification GTPase TrmE  32.32 
 
 		 467 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.408647  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0307  tRNA modification GTPase TrmE  32.32 
 
 		 467 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1654  GTP-binding protein EngA  30.54 
 
 		 465 aa  77  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0096  tRNA modification GTPase TrmE  32.32 
 
 		 467 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0111  tRNA modification GTPase TrmE  32.32 
 
 		 467 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  37.97 
 
 		 458 aa  77  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2842  tRNA modification GTPase TrmE  32.32 
 
 		 488 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00155334  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3547  tRNA modification GTPase TrmE  32.32 
 
 		 488 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2243  tRNA modification GTPase TrmE  32.32 
 
 		 488 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  38.71 
 
 		 459 aa  77  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0536  GTP-binding protein EngA  34 
 
 		 461 aa  76.3  0.0000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  37.34 
 
 		 447 aa  75.9  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3038  tRNA modification GTPase TrmE  30.41 
 
 		 448 aa  75.9  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.38062  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2159  GTP-binding protein EngA  30.12 
 
 		 436 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000018961  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1339  GTP-binding protein EngA  32.74 
 
 		 463 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0053  GTP-binding protein EngA  35.12 
 
 		 460 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0460  GTP-binding protein EngA  31.18 
 
 		 436 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2929  tRNA modification GTPase TrmE  34.32 
 
 		 446 aa  75.1  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  30.34 
 
 		 303 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1758  small GTP-binding protein  38.71 
 
 		 448 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52440  tRNA modification GTPase TrmE  34.19 
 
 		 455 aa  74.7  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4148  tRNA modification GTPase TrmE  31.68 
 
 		 454 aa  75.5  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.421634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1348  GTP-binding protein EngA  28.57 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.124719  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5136  tRNA modification GTPase TrmE  31.68 
 
 		 454 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.041745  normal  0.0619684 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>