More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0266 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0266  small GTP-binding protein  100 
 
 		 377 aa  756    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.410874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0042  small GTP-binding protein  45.36 
 
 		 400 aa  298  8e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2081  small GTP-binding protein  44.76 
 
 		 416 aa  297  2e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000627073  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1243  small GTP-binding protein  41.3 
 
 		 425 aa  285  5.999999999999999e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1569  small GTP-binding protein  42.3 
 
 		 407 aa  282  6.000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.627873  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0683  small GTP-binding protein  42.64 
 
 		 408 aa  280  3e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00203334  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0165  small GTP-binding protein  40.42 
 
 		 427 aa  272  6e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2152  small GTP-binding protein  41.33 
 
 		 409 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1843  small GTP-binding protein  40.93 
 
 		 422 aa  270  4e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1277  small GTP-binding protein domain-containing protein  40.36 
 
 		 405 aa  268  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.038791  hitchhiker  0.00000385407 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0183  small GTP-binding protein  41.88 
 
 		 408 aa  268  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1494  small GTP-binding protein  38.5 
 
 		 412 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1387  small GTP-binding protein  38.22 
 
 		 410 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0637341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0473  small GTP-binding protein  41.36 
 
 		 403 aa  265  8.999999999999999e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0038153  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2276  small GTP-binding protein domain-containing protein  38.7 
 
 		 400 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3926  GTP-binding protein  39.74 
 
 		 394 aa  260  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19310  small GTP-binding protein  39.85 
 
 		 411 aa  260  3e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00194835  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16490  iron-only hydrogenase maturation protein HydF  38.5 
 
 		 416 aa  258  1e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.520712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1629  GTPases  37.86 
 
 		 416 aa  257  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000232915  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0318  small GTP-binding protein domain-containing protein  39.95 
 
 		 402 aa  257  2e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0146  small GTP-binding protein  38.96 
 
 		 398 aa  256  5e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0325934  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3256  small GTP-binding protein  39.48 
 
 		 412 aa  256  5e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00305193  hitchhiker  0.00001491 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0705  small GTP-binding protein  38.48 
 
 		 412 aa  251  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.131335  hitchhiker  0.000692522 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0245  small GTP-binding protein  39.22 
 
 		 403 aa  250  3e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31412  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1501  small GTP-binding protein  38.92 
 
 		 408 aa  249  4e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.206775  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2638  small GTP-binding protein  41.51 
 
 		 394 aa  245  9e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0475  small GTP-binding protein  36.5 
 
 		 404 aa  240  4e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0490  small GTP-binding protein  36.5 
 
 		 404 aa  240  4e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3103  small GTP-binding protein  37.27 
 
 		 396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1361  small GTP-binding protein  36.41 
 
 		 396 aa  231  2e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.311924  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1862  small GTP-binding protein  37.31 
 
 		 398 aa  227  2e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.803475  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0106  GTP-binding protein  34.95 
 
 		 440 aa  207  3e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0103  GTP-binding protein  35.19 
 
 		 440 aa  205  8e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000228129  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0272  small GTP-binding protein  35.62 
 
 		 382 aa  199  5e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.934792  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1098  small GTP-binding protein domain-containing protein  37.69 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5742  tRNA modification GTPase TrmE  40.29 
 
 		 456 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3894  tRNA modification GTPase TrmE  33.73 
 
 		 456 aa  74.3  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  31.95 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4615  tRNA modification GTPase TrmE  35.97 
 
 		 454 aa  73.2  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4292  tRNA modification GTPase TrmE  35.97 
 
 		 454 aa  73.2  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4619  tRNA modification GTPase TrmE  33.54 
 
 		 455 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04098  tRNA modification GTPase  34.44 
 
 		 462 aa  72.8  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4148  tRNA modification GTPase TrmE  35.77 
 
 		 454 aa  72.4  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.421634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02071  tRNA modification GTPase TrmE  43.1 
 
 		 455 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.828373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2195  tRNA modification GTPase TrmE  40.18 
 
 		 475 aa  71.6  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2775  tRNA modification GTPase TrmE  39.66 
 
 		 452 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3865  tRNA modification GTPase TrmE  31.71 
 
 		 453 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000363316 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  41.18 
 
 		 455 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0005  tRNA modification GTPase TrmE  38.1 
 
 		 456 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273487  hitchhiker  0.00022418 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4234  tRNA modification GTPase TrmE  33.1 
 
 		 467 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4127  tRNA modification GTPase TrmE  33.1 
 
 		 454 aa  70.5  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4070  tRNA modification GTPase TrmE  33.1 
 
 		 467 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125734  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4055  tRNA modification GTPase TrmE  33.1 
 
 		 454 aa  70.5  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.765231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5308  tRNA modification GTPase TrmE  38.1 
 
 		 456 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.832252  normal  0.0803697 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4177  tRNA modification GTPase TrmE  33.1 
 
 		 467 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6368  tRNA modification GTPase TrmE  32.93 
 
 		 455 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5136  tRNA modification GTPase TrmE  33.79 
 
 		 454 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.041745  normal  0.0619684 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3317  tRNA modification GTPase TrmE  39.83 
 
 		 446 aa  69.7  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1658  tRNA modification GTPase TrmE  40.18 
 
 		 444 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.844134  normal  0.296272 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4216  tRNA modification GTPase TrmE  33.1 
 
 		 454 aa  69.7  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.021791  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  39.39 
 
 		 447 aa  69.7  0.00000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03590  tRNA modification GTPase  33.1 
 
 		 454 aa  69.7  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4073  tRNA modification GTPase TrmE  33.1 
 
 		 454 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.420944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03534  hypothetical protein  33.1 
 
 		 454 aa  69.7  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  38.41 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3920  tRNA modification GTPase TrmE  33.1 
 
 		 454 aa  69.7  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189642  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  34.23 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4260  tRNA modification GTPase TrmE  33.1 
 
 		 454 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5443  tRNA modification GTPase TrmE  38.1 
 
 		 456 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2453  tRNA modification GTPase TrmE  44.83 
 
 		 450 aa  68.9  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5212  tRNA modification GTPase TrmE  35.5 
 
 		 456 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4288  tRNA modification GTPase TrmE  33.1 
 
 		 454 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4219  tRNA modification GTPase TrmE  33.1 
 
 		 454 aa  69.3  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.99545  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4148  tRNA modification GTPase TrmE  39.5 
 
 		 455 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3038  tRNA modification GTPase TrmE  37.14 
 
 		 448 aa  68.6  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.38062  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5049  tRNA modification GTPase TrmE  32.95 
 
 		 471 aa  68.6  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0840037  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5133  tRNA modification GTPase TrmE  36.17 
 
 		 456 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2824  tRNA modification GTPase TrmE  37.06 
 
 		 446 aa  68.2  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0027  tRNA modification GTPase TrmE  31.03 
 
 		 454 aa  68.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73400  tRNA modification GTPase TrmE  32.32 
 
 		 455 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000503354  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5611  tRNA modification GTPase TrmE  35.46 
 
 		 456 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2392  tRNA modification GTPase TrmE  40.18 
 
 		 468 aa  68.2  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0118764  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0001  tRNA modification GTPase TrmE  28.66 
 
 		 453 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.201746  hitchhiker  0.00000000323985 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  40.15 
 
 		 461 aa  67.4  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4034  tRNA modification GTPase TrmE  32.64 
 
 		 453 aa  67.4  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.461545  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  40.17 
 
 		 463 aa  67  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4183  tRNA modification GTPase TrmE  31.72 
 
 		 454 aa  67  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000380111  normal  0.0649437 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3612  tRNA modification GTPase TrmE  30.49 
 
 		 455 aa  66.6  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2410  tRNA modification GTPase TrmE  36.61 
 
 		 448 aa  66.2  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.749558  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4245  tRNA modification GTPase TrmE  31.03 
 
 		 454 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00411948  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  32.72 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0132  tRNA modification GTPase TrmE  36.21 
 
 		 452 aa  65.5  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.849325  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3939  tRNA modification GTPase TrmE  29.27 
 
 		 453 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000114268 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4928  tRNA modification GTPase TrmE  29.27 
 
 		 453 aa  65.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0035842  hitchhiker  0.00000248868 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4263  tRNA modification GTPase TrmE  31.03 
 
 		 454 aa  64.7  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226045  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  38.94 
 
 		 461 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6518  tRNA modification GTPase TrmE  33.78 
 
 		 464 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1347  small GTP-binding protein  35.77 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.308373  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0137  tRNA modification GTPase TrmE  40.5 
 
 		 457 aa  65.1  0.000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4031  tRNA modification GTPase TrmE  29.27 
 
 		 453 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.608873  hitchhiker  0.001302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>