More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0106 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0103  GTP-binding protein  98.18 
 
 
440 aa  867    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000228129  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0106  GTP-binding protein  100 
 
 
440 aa  882    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3103  small GTP-binding protein  46.54 
 
 
396 aa  372  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0146  small GTP-binding protein  45.54 
 
 
398 aa  364  2e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0325934  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1569  small GTP-binding protein  46.92 
 
 
407 aa  362  9e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.627873  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2152  small GTP-binding protein  44.01 
 
 
409 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0318  small GTP-binding protein domain-containing protein  43.44 
 
 
402 aa  357  1.9999999999999998e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19310  small GTP-binding protein  45.08 
 
 
411 aa  356  3.9999999999999996e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00194835  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0165  small GTP-binding protein  41.55 
 
 
427 aa  353  5e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2081  small GTP-binding protein  45.21 
 
 
416 aa  352  8.999999999999999e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000627073  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0473  small GTP-binding protein  46 
 
 
403 aa  346  5e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0038153  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0683  small GTP-binding protein  44.42 
 
 
408 aa  345  7e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00203334  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0183  small GTP-binding protein  43.25 
 
 
408 aa  345  1e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1277  small GTP-binding protein domain-containing protein  43.02 
 
 
405 aa  342  7e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.038791  hitchhiker  0.00000385407 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1243  small GTP-binding protein  41.91 
 
 
425 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0705  small GTP-binding protein  40.68 
 
 
412 aa  338  9e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.131335  hitchhiker  0.000692522 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1629  GTPases  42.43 
 
 
416 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000232915  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2276  small GTP-binding protein domain-containing protein  41.88 
 
 
400 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3256  small GTP-binding protein  41.14 
 
 
412 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00305193  hitchhiker  0.00001491 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1494  small GTP-binding protein  43.22 
 
 
412 aa  333  3e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16490  iron-only hydrogenase maturation protein HydF  40 
 
 
416 aa  333  4e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.520712  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1843  small GTP-binding protein  42.89 
 
 
422 aa  333  4e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2638  small GTP-binding protein  43.36 
 
 
394 aa  329  5.0000000000000004e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3926  GTP-binding protein  41.86 
 
 
394 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0042  small GTP-binding protein  41.46 
 
 
400 aa  318  1e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1387  small GTP-binding protein  37.9 
 
 
410 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0637341  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0490  small GTP-binding protein  37.56 
 
 
404 aa  283  6.000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0475  small GTP-binding protein  37.56 
 
 
404 aa  283  6.000000000000001e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0245  small GTP-binding protein  38.48 
 
 
403 aa  282  8.000000000000001e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31412  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1501  small GTP-binding protein  35.62 
 
 
408 aa  273  3e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.206775  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1862  small GTP-binding protein  36.18 
 
 
398 aa  267  2.9999999999999995e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.803475  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1361  small GTP-binding protein  36.03 
 
 
396 aa  260  3e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.311924  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0272  small GTP-binding protein  36.49 
 
 
382 aa  253  6e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.934792  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0266  small GTP-binding protein  34.95 
 
 
377 aa  207  4e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.410874  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1098  small GTP-binding protein domain-containing protein  41.62 
 
 
262 aa  156  6e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1965  tRNA modification GTPase TrmE  31.1 
 
 
468 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0392  GTP-binding protein EngA  39.62 
 
 
494 aa  71.2  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1766  small GTP-binding protein  33.16 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3610  tRNA modification GTPase TrmE  31.39 
 
 
475 aa  66.6  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2472  tRNA modification GTPase TrmE  28.48 
 
 
487 aa  66.2  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000689916 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0886  tRNA modification GTPase TrmE  26.18 
 
 
478 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00940326 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0062  GTP-binding protein EngA  33.81 
 
 
455 aa  65.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1477  GTP-binding protein EngA  32.89 
 
 
454 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3456  tRNA modification GTPase TrmE  29.61 
 
 
481 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0193  GTP-binding protein EngA  34.67 
 
 
495 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1029  small GTP-binding protein  33.68 
 
 
184 aa  64.7  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3755  tRNA modification GTPase TrmE  29.61 
 
 
481 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1758  small GTP-binding protein  32.86 
 
 
448 aa  63.9  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0777  GTP-binding protein EngA  39.42 
 
 
462 aa  63.9  0.000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  36.05 
 
 
460 aa  63.9  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1753  ribosome-associated GTPase EngA  37.23 
 
 
477 aa  63.5  0.000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2632  small GTP-binding protein  31.16 
 
 
434 aa  63.5  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0764  GTP-binding protein EngA  25.38 
 
 
437 aa  63.2  0.000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000517804  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  29.47 
 
 
300 aa  63.2  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  31.11 
 
 
461 aa  63.2  0.000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3456  tRNA modification GTPase TrmE  29.93 
 
 
475 aa  63.2  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0915  small GTP-binding protein  33.16 
 
 
184 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.793666  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  36.26 
 
 
447 aa  62.4  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4509  small GTP-binding protein domain-containing protein  34.78 
 
 
457 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2103  GTP-binding protein EngA  27.27 
 
 
441 aa  62.4  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2263  GTP-binding protein EngA  31.69 
 
 
506 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  31.91 
 
 
305 aa  62.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0005  tRNA modification GTPase TrmE  28.33 
 
 
481 aa  62  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75194  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2342  small GTP-binding protein  31.25 
 
 
448 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03489  tRNA modification GTPase TrmE  29.41 
 
 
446 aa  61.2  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2393  small GTP-binding protein  33.57 
 
 
448 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1339  GTP-binding protein EngA  36.89 
 
 
463 aa  61.6  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3709  small GTP-binding protein  32.74 
 
 
462 aa  61.2  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2180  tRNA modification GTPase TrmE  32.16 
 
 
472 aa  60.5  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02181  tRNA modification GTPase TrmE  37.25 
 
 
461 aa  60.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3751  GTP-binding protein EngA  32.12 
 
 
449 aa  60.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3787  GTP-binding protein Era  26.44 
 
 
468 aa  60.1  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.0434052 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0199  tRNA modification GTPase TrmE  31.34 
 
 
473 aa  60.1  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0053  GTP-binding protein EngA  37.23 
 
 
460 aa  60.1  0.00000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2124  tRNA modification GTPase TrmE  31.34 
 
 
452 aa  60.1  0.00000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  29.53 
 
 
463 aa  60.1  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1159  GTP-binding protein EngA  28.83 
 
 
436 aa  60.1  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427593  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl199  GTP-binding protein EngA  32.24 
 
 
435 aa  59.7  0.0000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.316366  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6368  tRNA modification GTPase TrmE  31.58 
 
 
455 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1186  GTP-binding protein EngA  36.54 
 
 
461 aa  59.7  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0947  small GTP-binding protein  32.28 
 
 
184 aa  59.7  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.445595  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1506  GTP-binding protein Era  28.68 
 
 
301 aa  59.3  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.094805  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73400  tRNA modification GTPase TrmE  31.58 
 
 
455 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000503354  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4133  tRNA modification GTPase TrmE  31.94 
 
 
456 aa  58.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0435  GTP-binding protein EngA  34.38 
 
 
460 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2143  tRNA modification GTPase TrmE  27.22 
 
 
478 aa  58.5  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0104732  hitchhiker  0.000152188 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4619  tRNA modification GTPase TrmE  30.08 
 
 
455 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0409  GTP-binding protein EngA  34.38 
 
 
460 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1224  ribosome-associated GTPase EngA  30.41 
 
 
447 aa  58.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  27.84 
 
 
463 aa  58.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  34.69 
 
 
458 aa  58.5  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1876  GTP-binding protein EngA  31.34 
 
 
445 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.900999 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2387  tRNA modification GTPase TrmE  29.93 
 
 
465 aa  58.5  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.188748  hitchhiker  0.000106684 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1572  GTP-binding protein EngA  34.38 
 
 
460 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  30.54 
 
 
439 aa  58.2  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0876  tRNA modification GTPase TrmE  27.1 
 
 
518 aa  58.2  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.588217 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2148  small GTP-binding protein  51.56 
 
 
495 aa  58.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2016  GTP-binding protein EngA  29.53 
 
 
435 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0060  tRNA modification GTPase TrmE  38.36 
 
 
439 aa  57.8  0.0000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.646746  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3839  small GTP-binding protein  30.11 
 
 
481 aa  58.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.674432 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>