35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1098 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1098  small GTP-binding protein domain-containing protein  100 
 
 
262 aa  536  1e-151  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0318  small GTP-binding protein domain-containing protein  47.96 
 
 
402 aa  203  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1494  small GTP-binding protein  44 
 
 
412 aa  203  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1843  small GTP-binding protein  43.43 
 
 
422 aa  191  9e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1629  GTPases  44.95 
 
 
416 aa  188  9e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000232915  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1569  small GTP-binding protein  44.44 
 
 
407 aa  187  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.627873  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2638  small GTP-binding protein  46.43 
 
 
394 aa  187  2e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2152  small GTP-binding protein  44.9 
 
 
409 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1387  small GTP-binding protein  40.09 
 
 
410 aa  186  4e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0637341  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0683  small GTP-binding protein  43.22 
 
 
408 aa  185  8e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00203334  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3926  GTP-binding protein  44.16 
 
 
394 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3256  small GTP-binding protein  44.16 
 
 
412 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00305193  hitchhiker  0.00001491 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0705  small GTP-binding protein  43.15 
 
 
412 aa  180  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.131335  hitchhiker  0.000692522 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1501  small GTP-binding protein  43 
 
 
408 aa  180  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.206775  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1277  small GTP-binding protein domain-containing protein  40.2 
 
 
405 aa  180  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.038791  hitchhiker  0.00000385407 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2276  small GTP-binding protein domain-containing protein  43 
 
 
400 aa  179  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0165  small GTP-binding protein  42.08 
 
 
427 aa  179  4.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19310  small GTP-binding protein  37.27 
 
 
411 aa  178  9e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00194835  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0473  small GTP-binding protein  42.13 
 
 
403 aa  177  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0038153  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0183  small GTP-binding protein  40.7 
 
 
408 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1243  small GTP-binding protein  43.08 
 
 
425 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0042  small GTP-binding protein  41.92 
 
 
400 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2081  small GTP-binding protein  41.41 
 
 
416 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000627073  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0146  small GTP-binding protein  40.49 
 
 
398 aa  171  1e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0325934  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3103  small GTP-binding protein  41.97 
 
 
396 aa  170  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0490  small GTP-binding protein  37.74 
 
 
404 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0475  small GTP-binding protein  37.74 
 
 
404 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0272  small GTP-binding protein  44.12 
 
 
382 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.934792  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1862  small GTP-binding protein  40.29 
 
 
398 aa  161  9e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.803475  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0106  GTP-binding protein  41.62 
 
 
440 aa  156  4e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16490  iron-only hydrogenase maturation protein HydF  36.73 
 
 
416 aa  155  7e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.520712  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0245  small GTP-binding protein  38.31 
 
 
403 aa  153  2.9999999999999998e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31412  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0103  GTP-binding protein  42.05 
 
 
440 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000228129  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0266  small GTP-binding protein  37.69 
 
 
377 aa  147  1.0000000000000001e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.410874  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1361  small GTP-binding protein  33.83 
 
 
396 aa  146  3e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.311924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>