More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0272 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0272  small GTP-binding protein  100 
 
 		 382 aa  768    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.934792  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3103  small GTP-binding protein  46.55 
 
 		 396 aa  325  8.000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0683  small GTP-binding protein  42.67 
 
 		 408 aa  287  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00203334  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1569  small GTP-binding protein  43.26 
 
 		 407 aa  286  5e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.627873  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2638  small GTP-binding protein  42.13 
 
 		 394 aa  286  5e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0473  small GTP-binding protein  44.7 
 
 		 403 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0038153  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0165  small GTP-binding protein  40.87 
 
 		 427 aa  283  4.0000000000000003e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0183  small GTP-binding protein  39.8 
 
 		 408 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1243  small GTP-binding protein  40.66 
 
 		 425 aa  277  2e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0318  small GTP-binding protein domain-containing protein  40.97 
 
 		 402 aa  277  2e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1843  small GTP-binding protein  43 
 
 		 422 aa  277  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19310  small GTP-binding protein  39.9 
 
 		 411 aa  275  7e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00194835  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0146  small GTP-binding protein  39.09 
 
 		 398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0325934  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2081  small GTP-binding protein  41.84 
 
 		 416 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000627073  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2152  small GTP-binding protein  39.69 
 
 		 409 aa  272  7e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0042  small GTP-binding protein  41.97 
 
 		 400 aa  271  1e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1494  small GTP-binding protein  41.88 
 
 		 412 aa  269  5e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1629  GTPases  39.85 
 
 		 416 aa  264  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000232915  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0705  small GTP-binding protein  39.19 
 
 		 412 aa  255  8e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.131335  hitchhiker  0.000692522 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0245  small GTP-binding protein  39.39 
 
 		 403 aa  253  4.0000000000000004e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31412  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16490  iron-only hydrogenase maturation protein HydF  36.43 
 
 		 416 aa  253  5.000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.520712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0106  GTP-binding protein  36.49 
 
 		 440 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1387  small GTP-binding protein  37.37 
 
 		 410 aa  252  6e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0637341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0103  GTP-binding protein  36.26 
 
 		 440 aa  253  6e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000228129  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1277  small GTP-binding protein domain-containing protein  37.89 
 
 		 405 aa  251  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.038791  hitchhiker  0.00000385407 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3926  GTP-binding protein  38.01 
 
 		 394 aa  248  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0475  small GTP-binding protein  39.34 
 
 		 404 aa  247  3e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0490  small GTP-binding protein  39.34 
 
 		 404 aa  247  3e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3256  small GTP-binding protein  38.42 
 
 		 412 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00305193  hitchhiker  0.00001491 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1862  small GTP-binding protein  38.36 
 
 		 398 aa  239  4e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.803475  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1361  small GTP-binding protein  39.23 
 
 		 396 aa  238  1e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.311924  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2276  small GTP-binding protein domain-containing protein  35.7 
 
 		 400 aa  236  4e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1501  small GTP-binding protein  33.25 
 
 		 408 aa  218  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.206775  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0266  small GTP-binding protein  35.62 
 
 		 377 aa  199  6e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.410874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1098  small GTP-binding protein domain-containing protein  44.12 
 
 		 262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6055  tRNA modification GTPase TrmE  31.61 
 
 		 473 aa  68.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  33.85 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1775  GTP-binding protein EngA  32.39 
 
 		 465 aa  66.6  0.0000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0053  GTP-binding protein EngA  34.27 
 
 		 460 aa  66.2  0.0000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1260  tRNA modification GTPase TrmE  37.6 
 
 		 449 aa  65.5  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1422  ribosome-associated GTPase EngA  32.35 
 
 		 484 aa  65.5  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  26.45 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02071  tRNA modification GTPase TrmE  37.5 
 
 		 460 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.214831  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1711  GTP-binding protein EngA  31.69 
 
 		 465 aa  64.3  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.625328  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02181  tRNA modification GTPase TrmE  31.17 
 
 		 461 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02091  tRNA modification GTPase TrmE  37.5 
 
 		 460 aa  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.146144  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2824  tRNA modification GTPase TrmE  41.11 
 
 		 446 aa  63.5  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0191  tRNA modification GTPase TrmE  37.5 
 
 		 460 aa  63.5  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.377202  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0536  putative GTP-binding protein EngA  32.33 
 
 		 473 aa  63.5  0.000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1406  GTP-binding protein EngA  31.62 
 
 		 439 aa  63.2  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0340673  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4791  tRNA modification GTPase TrmE  33.33 
 
 		 482 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3073  tRNA modification GTPase TrmE  38.21 
 
 		 446 aa  62.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  29.71 
 
 		 298 aa  62.4  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0392  GTP-binding protein EngA  31.37 
 
 		 494 aa  62.8  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1753  ribosome-associated GTPase EngA  30.82 
 
 		 477 aa  62  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0519  GTP-binding protein EngA  32.61 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1617  GTP-binding protein EngA  32.8 
 
 		 460 aa  61.6  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0819  tRNA modification GTPase TrmE  29.59 
 
 		 452 aa  61.6  0.00000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5298  tRNA modification GTPase TrmE  32.56 
 
 		 471 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  31.25 
 
 		 299 aa  62  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1339  GTP-binding protein EngA  32.67 
 
 		 463 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  34.38 
 
 		 447 aa  60.8  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  36.43 
 
 		 460 aa  61.2  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1752  GTP-binding protein Era  25.78 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1204  GTP-binding protein EngA  31.16 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.109244  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2008  GTP-binding protein EngA  31.71 
 
 		 438 aa  60.5  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1726  GTP-binding protein EngA  31.71 
 
 		 438 aa  60.5  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138722  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  29.5 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4957  tRNA modification GTPase TrmE  24.24 
 
 		 459 aa  60.1  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028541  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0435  GTP-binding protein EngA  30.83 
 
 		 460 aa  60.1  0.00000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0548  tRNA modification GTPase TrmE  36.89 
 
 		 442 aa  60.1  0.00000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0409  GTP-binding protein EngA  30.83 
 
 		 460 aa  60.5  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5049  tRNA modification GTPase TrmE  36.63 
 
 		 471 aa  60.1  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0840037  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  28.19 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1572  GTP-binding protein EngA  30.83 
 
 		 460 aa  59.7  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0005  tRNA modification GTPase TrmE  34.44 
 
 		 481 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75194  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl014  tRNA modification GTPase TrmE  28.41 
 
 		 452 aa  58.9  0.0000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2929  tRNA modification GTPase TrmE  36.59 
 
 		 446 aa  59.3  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3456  tRNA modification GTPase TrmE  34.44 
 
 		 481 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2707  tRNA modification GTPase TrmE  34.04 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622975  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0002  tRNA modification GTPase TrmE  39.53 
 
 		 455 aa  58.9  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0060  tRNA modification GTPase TrmE  43.33 
 
 		 439 aa  58.9  0.0000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.646746  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4241  tRNA modification GTPase TrmE  32.17 
 
 		 469 aa  58.9  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207719  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4133  tRNA modification GTPase TrmE  32.48 
 
 		 456 aa  59.3  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0793  GTP-binding protein Era  31.3 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.998663  normal  0.0560127 
 
 
-
 
NC_002936  DET1395  GTP-binding protein EngA  29.71 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56161  predicted protein  33.57 
 
 		 478 aa  58.5  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0083  GTP-binding protein EngA  31.78 
 
 		 476 aa  58.2  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04098  tRNA modification GTPase  32.8 
 
 		 462 aa  58.2  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0032  tRNA modification GTPase TrmE  43.08 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2195  tRNA modification GTPase TrmE  34.04 
 
 		 475 aa  58.2  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2775  tRNA modification GTPase TrmE  35.63 
 
 		 452 aa  58.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2148  small GTP-binding protein  28.69 
 
 		 495 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  27.56 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4310  tRNA modification GTPase TrmE  37.11 
 
 		 460 aa  58.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.671502  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3865  tRNA modification GTPase TrmE  37.78 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000363316 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1458  GTP-binding protein EngA  32.52 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548717  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0001  tRNA modification GTPase TrmE  37.78 
 
 		 453 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.201746  hitchhiker  0.00000000323985 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0536  GTP-binding protein EngA  31.58 
 
 		 461 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3755  tRNA modification GTPase TrmE  34.44 
 
 		 481 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>