More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1260 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_1260  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 		 449 aa  910    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12578  putative tRNA modification GTPase  36.29 
 
 		 469 aa  295  1e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0089  tRNA modification GTPase TrmE  38.46 
 
 		 455 aa  293  3e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2030  tRNA modification GTPase TrmE  36.7 
 
 		 460 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2707  tRNA modification GTPase TrmE  36.85 
 
 		 466 aa  276  4e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622975  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1430  tRNA modification GTPase TrmE  35.1 
 
 		 461 aa  275  8e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1904  tRNA modification GTPase TrmE  36.56 
 
 		 472 aa  267  2.9999999999999995e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2316  tRNA modification GTPase TrmE  35.46 
 
 		 456 aa  261  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.64098  normal  0.135497 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  34.57 
 
 		 458 aa  261  2e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0217  tRNA modification GTPase TrmE  33.26 
 
 		 476 aa  260  4e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0500389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3641  tRNA modification GTPase TrmE  35.97 
 
 		 460 aa  258  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  34.06 
 
 		 458 aa  256  5e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  34.06 
 
 		 458 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3279  tRNA modification GTPase TrmE  35.93 
 
 		 458 aa  253  4.0000000000000004e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.768989 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  34.78 
 
 		 464 aa  250  4e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3560  tRNA modification GTPase TrmE  34.71 
 
 		 457 aa  250  4e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  33.19 
 
 		 458 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  32.82 
 
 		 463 aa  248  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0645  tRNA modification GTPase TrmE  35.91 
 
 		 449 aa  249  1e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  33.98 
 
 		 456 aa  248  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  34.92 
 
 		 455 aa  248  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4148  tRNA modification GTPase TrmE  34.77 
 
 		 455 aa  246  4e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  32.75 
 
 		 459 aa  246  8e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1201  hypothetical protein  31.8 
 
 		 455 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128445 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  34.88 
 
 		 447 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1734  tRNA modification GTPase TrmE  33.85 
 
 		 437 aa  243  5e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4774  tRNA modification GTPase TrmE  33.19 
 
 		 467 aa  243  5e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4729  tRNA modification GTPase TrmE  34.79 
 
 		 454 aa  242  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0876  tRNA modification GTPase TrmE  33.2 
 
 		 518 aa  241  2e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.588217 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2373  tRNA modification GTPase TrmE  33.48 
 
 		 473 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  35.56 
 
 		 460 aa  239  6.999999999999999e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0248  tRNA modification GTPase TrmE  31.53 
 
 		 473 aa  239  8e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0070  tRNA modification GTPase TrmE  34.15 
 
 		 444 aa  238  2e-61  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.868206  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  33.05 
 
 		 458 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  33.05 
 
 		 458 aa  238  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  33.05 
 
 		 458 aa  238  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  33.05 
 
 		 458 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  33.05 
 
 		 458 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  31.45 
 
 		 461 aa  237  3e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  32.89 
 
 		 450 aa  237  3e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  31 
 
 		 460 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  32.41 
 
 		 458 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  31 
 
 		 460 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  32.68 
 
 		 458 aa  236  6e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  32.83 
 
 		 458 aa  236  6e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  32.62 
 
 		 458 aa  236  9e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  32.62 
 
 		 458 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  32.75 
 
 		 462 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  32.76 
 
 		 462 aa  235  1.0000000000000001e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  33.11 
 
 		 450 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2881  tRNA modification GTPase TrmE  37.31 
 
 		 444 aa  234  3e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.470737  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03590  tRNA modification GTPase  35.24 
 
 		 454 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03534  hypothetical protein  35.24 
 
 		 454 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3920  tRNA modification GTPase TrmE  35.24 
 
 		 454 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189642  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5136  tRNA modification GTPase TrmE  35.24 
 
 		 454 aa  233  6e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.041745  normal  0.0619684 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2734  tRNA modification GTPase TrmE  31.89 
 
 		 459 aa  233  7.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2791  tRNA modification GTPase TrmE  31.89 
 
 		 459 aa  233  7.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4073  tRNA modification GTPase TrmE  35.02 
 
 		 454 aa  232  9e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.420944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4428  tRNA modification GTPase TrmE  34.2 
 
 		 455 aa  232  9e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4260  tRNA modification GTPase TrmE  35.02 
 
 		 454 aa  232  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4219  tRNA modification GTPase TrmE  35.02 
 
 		 454 aa  232  1e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.99545  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4288  tRNA modification GTPase TrmE  35.02 
 
 		 454 aa  232  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  32.62 
 
 		 458 aa  232  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2387  tRNA modification GTPase TrmE  36.27 
 
 		 465 aa  231  2e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.188748  hitchhiker  0.000106684 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4216  tRNA modification GTPase TrmE  35.02 
 
 		 454 aa  230  4e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.021791  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4070  tRNA modification GTPase TrmE  35.01 
 
 		 467 aa  230  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125734  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  32.97 
 
 		 458 aa  230  5e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3086  tRNA modification GTPase TrmE  34.07 
 
 		 458 aa  230  5e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.924716  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  34.12 
 
 		 462 aa  230  5e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4234  tRNA modification GTPase TrmE  35.01 
 
 		 467 aa  230  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4177  tRNA modification GTPase TrmE  35.01 
 
 		 467 aa  230  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4127  tRNA modification GTPase TrmE  35.01 
 
 		 454 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2760  tRNA modification GTPase TrmE  33.33 
 
 		 462 aa  229  6e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.4484  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  32.97 
 
 		 463 aa  229  6e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4055  tRNA modification GTPase TrmE  35.01 
 
 		 454 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.765231  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  30.67 
 
 		 459 aa  229  7e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2410  tRNA modification GTPase TrmE  34.87 
 
 		 448 aa  229  9e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.749558  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1582  tRNA modification GTPase TrmE  32.26 
 
 		 462 aa  229  9e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2889  tRNA modification GTPase TrmE  32.27 
 
 		 464 aa  228  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1336  tRNA modification GTPase TrmE  34.51 
 
 		 441 aa  228  1e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2254  tRNA modification GTPase TrmE  32.53 
 
 		 436 aa  229  1e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9716  normal  0.222751 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2775  tRNA modification GTPase TrmE  32.6 
 
 		 452 aa  228  2e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  34.26 
 
 		 454 aa  228  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2472  tRNA modification GTPase TrmE  35.27 
 
 		 487 aa  228  2e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000689916 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4200  tRNA modification GTPase TrmE  33.7 
 
 		 448 aa  227  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0153583 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0008  tRNA modification GTPase TrmE  34.14 
 
 		 453 aa  227  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.185087  hitchhiker  0.000721309 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0680  tRNA modification GTPase TrmE  32.67 
 
 		 438 aa  227  3e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000180906  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1733  tRNA modification GTPase TrmE  32.09 
 
 		 452 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000059641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73400  tRNA modification GTPase TrmE  32.75 
 
 		 455 aa  226  7e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000503354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  31.53 
 
 		 460 aa  226  8e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0003  tRNA modification GTPase TrmE  33.85 
 
 		 457 aa  225  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4619  tRNA modification GTPase TrmE  33.55 
 
 		 455 aa  225  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3315  tRNA modification GTPase TrmE  32.47 
 
 		 458 aa  225  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3161  tRNA modification GTPase TrmE  33.41 
 
 		 471 aa  225  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.258894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0375  tRNA modification GTPase TrmE  34.2 
 
 		 459 aa  224  2e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2025  tRNA modification GTPase TrmE  32.03 
 
 		 473 aa  224  2e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4041  tRNA modification GTPase TrmE  34.59 
 
 		 449 aa  224  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.934487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4031  tRNA modification GTPase TrmE  34.07 
 
 		 453 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.608873  hitchhiker  0.001302 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  33.55 
 
 		 455 aa  224  2e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5133  tRNA modification GTPase TrmE  33.33 
 
 		 456 aa  224  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>